Το SYBR Green® είναι μια φθορίζουσα χρωστική που συνδέεται με δίκλωνο DNA με μεγάλη εξειδίκευση. Χρησιμοποιείται ευρέως στην έρευνα της μοριακής βιολογίας για την ποσοτικοποίηση και την οπτικοποίηση του δίκλωνου DNA. Το SYBR Green® είναι μια συνθετική βαφή, η οποία εισήχθη στις αρχές της δεκαετίας του 1990 από την Molecular Probes®, Inc., θυγατρική της Invitrogen&trade Corporation. Είναι μια ασύμμετρη χρωστική κυανίνης, οι κυανίνες είναι μια οικογένεια συνθετικών οργανικών χρωστικών που χρησιμοποιούνται στη φωτογραφία, τα μέσα CD-R και DVD-R και σε μια ποικιλία ερευνητικών εφαρμογών μοριακής βιολογίας.
Διάφορα χαρακτηριστικά καθιστούν το SYBR Green® ιδιαίτερα χρήσιμο ως λεκέ νουκλεϊκού οξέος. Είναι σταθερό σε ένα εύρος θερμοκρασιών, πράγμα που σημαίνει ότι μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την παρακολούθηση βιοχημικών αντιδράσεων που λαμβάνουν χώρα σε υψηλές και χαμηλές θερμοκρασίες. Δεσμεύεται μη ομοιοπολικά στην επιφάνεια του DNA, πράγμα που σημαίνει ότι δεν θα παρεμβαίνει στη δραστηριότητα των περισσότερων νουκλεασών και DNA πολυμερασών. Συνδέεται επίσης με νουκλεϊκά οξέα σε ένα δυναμικό γραμμικό εύρος έως και τεσσάρων τάξεων μεγέθους, ώστε να μπορεί να δώσει ακριβή ποσοτικό προσδιορισμό του DNA σε ένα ευρύ φάσμα συγκεντρώσεων.
Οι πιο συνηθισμένες εργαστηριακές χρήσεις του SYBR Green® είναι η ανίχνευση δίκλωνου DNA σε αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης σε πραγματικό χρόνο (PCR) και σε πηκτώματα ακρυλαμιδίου. Η PCR είναι μια τεχνική για την ενίσχυση μερικών αντιγράφων DNA μέσω επαναλαμβανόμενων κύκλων αντιγραφής DNA. Η PCR σε πραγματικό χρόνο μετρά την ενίσχυση καθώς λαμβάνει χώρα, και δεδομένου ότι το SYBR Green® συνδέεται με δίκλωνο DNA, η μέτρηση της εκπομπής φθορισμού του συμπλέγματος DNA-χρωστικής επιτρέπει στον ερευνητή να ποσοτικοποιήσει την ποσότητα του DNA που παράγεται. Καθώς οι κύκλοι της PCR προχωρούν, υπάρχει μια αύξηση στον φθορισμό ανάλογη με την ποσότητα του παραγόμενου προϊόντος PCR.
Τα πηκτώματα ακρυλαμιδίου είναι πανταχού παρόντα στα εργαστήρια μοριακής βιολογίας, καθώς εξυπηρετούν τον κοινώς απαραίτητο σκοπό του διαχωρισμού των θραυσμάτων DNA κατά μέγεθος. Το SYBR Green® επιτρέπει στον ερευνητή να οπτικοποιήσει το DNA σε ένα πήκτωμα ακρυλαμιδίου, ρίχνοντας φως του κατάλληλου μήκους κύματος πάνω του. Άλλες χρήσεις του SYBR Green® περιλαμβάνουν την ανίχνευση νουκλεϊκών οξέων σε διάλυμα, σε εφαρμογές βιοτσίπ και στην κυτταρομετρία ροής. Το σύμπλεγμα DNA-χρωστικής απορροφά το μπλε φως στα 488 nm και εκπέμπει πράσινο φως στα 522 nm.
Το SYBR Green® είναι πολύ ευαίσθητο. είναι 25 φορές πιο ευαίσθητο από το βρωμιούχο αιθίδιο, μια άλλη χρωστική που χρησιμοποιείται συνήθως για την οπτικοποίηση του DNA. Η υψηλή συγγένεια του SYBR Green® για δίκλωνο DNA το καθιστά χρήσιμο για την ανίχνευση δειγμάτων DNA με χαμηλό αριθμό αντιγράφων. Συνδέει κατά προτίμηση δίκλωνο DNA, αλλά μπορεί επίσης να δεσμεύσει μονόκλωνο DNA με μειωμένο φθορισμό. Όπως με κάθε μόριο που δεσμεύει το DNA, το SYBR Green® μπορεί να προκαλέσει μεταλλάξεις και είναι πιθανό καρκινογόνο. Ωστόσο, είναι ασφαλέστερη η εργασία και ευκολότερη απόρριψη από το βρωμιούχο αιθίδιο.