Τα καθήκοντα ενός θεραπευτή ζώων μπορεί να ποικίλλουν αρκετά, ανάλογα με το είδος της εργασίας που επιλέγει να εκτελέσει ο θεραπευτής και τυχόν εξειδικεύσεις που μπορεί να ακολουθήσει. Κάποιος που εργάζεται ως συμπεριφοριστικός θεραπευτής με ζώα συχνά βοηθά στην εκπαίδευση ζώων, συνήθως εξημερωμένων κατοικίδιων ζώων ή ζώων για ψυχαγωγία, να συμπεριφέρονται με συγκεκριμένους τρόπους. Υπάρχουν επίσης καθήκοντα για έναν θεραπευτή ζώων που βοηθά τα ζώα με φυσικοθεραπεία, συχνά βοηθώντας τα ζώα με παρόμοιους τρόπους με τον τρόπο που ένας φυσιοθεραπευτής βοηθά τους ανθρώπους. Ορισμένοι θεραπευτές, που επικεντρώνονται στην εργασία με ανθρώπους, μπορούν να χρησιμοποιήσουν τη θεραπεία με τη βοήθεια ζώων χρησιμοποιώντας ζώα για να βοηθήσουν τους ανθρώπους να ξεπεράσουν διάφορες δυσκολίες ή καταστάσεις.
Ένας ζωοθεραπευτής είναι συνήθως κάποιος που εργάζεται επαγγελματικά με ζώα, σε κάποιο είδος θεραπευτικής ικανότητας, αν και η ακριβής φύση αυτής της εργασίας μπορεί να ποικίλει αρκετά. Οι συμπεριφορικοί θεραπευτές για ζώα συχνά εργάζονται με διαφορετικούς τύπους ζώων για να καταλάβουν γιατί συμπεριφέρεται με έναν συγκεκριμένο τρόπο και στη συνέχεια βοηθούν στην αλλαγή ή τη διόρθωση της αρνητικής συμπεριφοράς. Αυτή η εργασία περιλαμβάνει συχνά παρατήρηση από την πλευρά του θεραπευτή, για να καταλάβει πώς συμπεριφέρεται ένα ζώο και να ερμηνεύσει αυτή τη δραστηριότητα με βάση την προηγούμενη γνώση της συμπεριφοράς των ζώων. Ένας θεραπευτής ζώων που εργάζεται με θέματα συμπεριφοράς συνήθως βοηθά τον ιδιοκτήτη στην εκπαίδευση αυτού του ζώου να ενεργεί με τον τρόπο που είναι πιο κατάλληλος ή αποδεκτός.
Υπάρχουν επίσης ορισμένες μορφές φυσικοθεραπείας που μπορούν να γίνουν από έναν θεραπευτή ζώων. Αυτός ο τύπος εργασίας εκτελείται συχνά αφού ένα ζώο έχει υποστεί τραυματισμό ή έχει υποβληθεί σε χειρουργική επέμβαση, όπως και η εργασία που γίνεται από ανθρώπινους φυσικοθεραπευτές. Αυτός ο τύπος θεραπευτή ζώων μπορεί στη συνέχεια να βοηθήσει αυτό το ζώο να μάθει για άλλη μια φορά να περπατάει ή να τρέχει ή να προσαρμόζεται σε τραυματισμούς που μπορεί να έχουν επηρεάσει σε μεγάλο βαθμό την άνετη κινητικότητα του ζώου. Αυτός ο τύπος εργασίας συχνά περιλαμβάνει την παρατήρηση της συμπεριφοράς των ζώων και την κατανόηση του τρόπου με τον οποίο μπορεί να αντιδρά ένα ζώο στις φυσικές αλλαγές που έχει υποστεί.
Ορισμένοι θεραπευτές που εργάζονται με ανθρώπους μπορούν να χρησιμοποιήσουν θεραπεία με βοήθεια ζώων για ανθρώπους. Αυτή η θεραπεία ακολουθεί συνήθως ορισμένες ρουτίνες και στρατηγικές θεραπείας ενώ χρησιμοποιείτε ζώα. Κάποιος που αντιμετωπίζει δυσκολίες στην αντιμετώπιση της κατάθλιψης, για παράδειγμα, μπορεί να βιώνει συναισθήματα μοναξιάς και απομόνωσης λόγω αναπηρίας ή άλλης κατάστασης. Η εισαγωγή ενός κατοικίδιου ζώου στη ζωή του ατόμου μπορεί να βοηθήσει στην ανακούφιση αυτών των συναισθημάτων σε ορισμένες περιπτώσεις. Ο θεραπευτής συνήθως συνεργάζεται με έναν εκπαιδευτή ζώων για να επιλέξει το σωστό ζώο για να βοηθήσει το άτομο στη θεραπεία.