Ένας κτηνίατρος επιδημιολόγος παρακολουθεί πληθυσμούς ζώων για να προστατεύσει τόσο την υγεία των ανθρώπων όσο και των ζώων. Η εργασία μπορεί να περιλαμβάνει ανταπόκριση σε εστίες ασθένειας, συμμετοχή σε κλινικές δοκιμές και συνεργασία με υπαλλήλους δημόσιας υγείας. Άνθρωποι σε αυτόν τον τομέα μπορούν να απασχοληθούν από κυβερνητικές υπηρεσίες, καθώς και φαρμακευτικές εταιρείες και οργανώσεις φιλοζωικής. Σε πολλές περιοχές, είναι απαραίτητο να είστε αδειούχος κτηνίατρος με κλινική εμπειρία για να εργάζεστε ως επιδημιολόγος και ορισμένοι εργοδότες προτιμούν υποψήφιους για εργασία με συγκεκριμένη εμπειρία και κατάρτιση στον τομέα της επιδημιολογίας.
Η υγεία και η καλή διαβίωση των ζώων προκαλεί ανησυχία για διάφορους λόγους. Οι ασθένειες σε πληθυσμούς ζώων μπορούν να εκτοξευτούν στους ανθρώπους, είτε πρόκειται για ιούς γρίπης σε πτηνά είτε για βακτηριακές λοιμώξεις ανθεκτικές στα φάρμακα σε ζώα τροφίμων. Η κακή υγεία μεταξύ των πληθυσμών των ζώων μπορεί επίσης να έχει οικονομικό αντίκτυπο. για παράδειγμα, εάν ένας πληθυσμός ζώων τροφίμων πρέπει να καταστραφεί εξαιτίας μιας εστίας αφθώδους πυρετού. Ο κτηνίατρος επιδημιολόγος εργάζεται για την προστασία των συμφερόντων των ανθρώπων και των ζώων, με έμφαση στον περιορισμό της εμφάνισης της ασθένειας και τον έλεγχο της όταν εμφανιστεί.
Ορισμένες ασθένειες των ζώων ενδέχεται να υπόκεινται σε υποχρεωτική αναφορά, όπου οι αγρότες, οι κτηνίατροι και άλλοι που έρχονται σε επαφή με άρρωστα ζώα πρέπει να υποβάλουν έκθεση στον κτηνίατρο επιδημιολόγο. Αυτοί οι επαγγελματίες υγειονομικής περίθαλψης παρακολουθούν αναφορές, ανταποκρίνονται σε εστίες ασθένειας και διαχειρίζονται έρευνες. Σε περίπτωση εστίας γνωστής ασθένειας, ο κτηνίατρος επιδημιολόγος μπορεί να διαχειριστεί το σχέδιο ανταπόκρισης για τον έλεγχο της. Με άγνωστες ασθένειες, η εργασία μπορεί να απαιτήσει κάποιο στρίψιμο για να μάθετε τι συμβαίνει και να αναπτύξετε έναν τρόπο διαχείρισης.
Οι κτηνίατροι επιδημιολόγοι μπορούν να παρέχουν δημόσια ενημέρωση και εκπαίδευση, ιδιαίτερα σε όσους εργάζονται με ζώα. Μπορούν να συζητήσουν κοινές ασθένειες, τρόπους πρόληψής τους και πώς να τις εντοπίσουν όταν εμφανιστούν σε πληθυσμούς ζώων. Αυτό μπορεί να προκαλέσει ιδιαίτερη ανησυχία στα ζώα που μεταφέρονται και πωλούνται, όπως ζώα κρέατος που μπορεί να αποσταλούν σε μακρινούς χώρους ζωοτροφών ή ζώα που χρησιμοποιούνται στην έρευνα που θα μπορούσαν να εισαχθούν από άλλες χώρες. Εάν μολυνθούν, θα μπορούσαν να μεταδώσουν ασθένειες σε νέους πληθυσμούς και να προκαλέσουν κρίση δημόσιας υγείας.
Μια άλλη πτυχή της εργασίας μπορεί να επικεντρωθεί στην ανάπτυξη θεραπειών για άρρωστα ζώα. Οι κλινικές δοκιμές ενδέχεται να περιλαμβάνουν έναν κτηνίατρο επιδημιολόγο και η παρακολούθηση μπορεί να πραγματοποιηθεί μετά την έγκριση των φαρμάκων για πώληση. Εάν αρχίσει να εμφανίζεται ένα μοτίβο ανεπιθύμητων ενεργειών, ασυνήθιστων αλληλεπιδράσεων φαρμάκων ή άλλων ζητημάτων, το φάρμακο μπορεί να υποβληθεί σε επανεξέταση για να διαπιστωθεί εάν χρειάζεται πρόσθετες προειδοποιήσεις ή πρέπει να αποσυρθεί από την αγορά.