Οι θεραπείες για τη βακτηριακή κολπίτιδα είναι συνήθως με τη μορφή αντιβιοτικών. Μερικές φορές η βακτηριακή κολπίτιδα υποχωρεί μόνη της χωρίς ιατρική θεραπεία. Τα άτομα που χρειάζονται θεραπείες για τη βακτηριακή κολπίτιδα συνήθως συνταγογραφούνται είτε μετρονιδαζόλη είτε κλινδαμυκίνη, τα οποία είναι δύο τύποι αντιβιοτικών. Και τα δύο αυτά αντιβιοτικά έρχονται σε μορφή χαπιού ή με τη μορφή κρεμών που εισάγονται μέσα στον κόλπο. Οι περισσότερες λοιμώξεις από βακτηριακή κολπίτιδα γενικά υποχωρούν μέσα σε δύο ή τρεις ημέρες μετά την έναρξη της αντιβιοτικής θεραπείας, αλλά οι γιατροί συνήθως συμβουλεύουν τις γυναίκες να παίρνουν τα αντιβιοτικά τους για τουλάχιστον μία εβδομάδα ακόμα και αν τα συμπτώματά τους παύσουν.
Πολλές γυναίκες που έχουν βακτηριακή κολπίτιδα δεν εμφανίζουν συμπτώματα και για αυτόν τον λόγο μπορεί να μην συνειδητοποιούν ότι έχουν τη μόλυνση. Το γεγονός ότι η βακτηριακή κολπίτιδα περιστασιακά υποχωρεί από μόνη της σημαίνει ότι υπάρχουν μερικές γυναίκες που μπορεί να μην γνωρίζουν ότι την είχαν ποτέ, ιδιαίτερα αν δεν υπήρχαν συμπτώματα. Μια γυναίκα δεν πρέπει να αναβάλλει τη θεραπεία για τη βακτηριακή κολπίτιδα επειδή πιστεύει ότι η μόλυνση της θα υποχωρήσει χωρίς θεραπεία. Παρόλο που η βακτηριακή κολπίτιδα περιστασιακά υποχωρεί χωρίς θεραπεία, θα μπορούσε να επιδεινωθεί πολύ πριν βελτιωθεί. Συνήθως θεωρείται καλύτερο να επισκεφτείτε γιατρό ή γυναικολόγο αμέσως μόλις εμφανιστούν συμπτώματα βακτηριακής κολπίτιδας, ώστε το πρόβλημα να μην επιδεινωθεί.
Ένας γιατρός συνήθως αξιολογεί τα συμπτώματα μιας γυναίκας εκτός από τη διενέργεια πυελικής εξέτασης πριν συνταγογραφήσει θεραπείες για τη βακτηριακή κολπίτιδα. Τα συμπτώματα της βακτηριακής κολπίτιδας είναι συχνά παρόμοια με τα συμπτώματα μόλυνσης από ζυμομύκητες και για αυτόν τον λόγο πολλές γυναίκες μπορεί να πιστεύουν ότι έχουν μόλυνση ζύμης. Συχνά, μόνο όταν μια γυναίκα επιχειρήσει να θεραπεύσει τη βακτηριακή κολπίτιδα της με κρέμα λοίμωξης ζύμης χωρίς συνταγή, συνειδητοποιεί ότι έχει ένα άλλο πρόβλημα επειδή το φάρμακο για τη μόλυνση από ζύμες είναι αναποτελεσματικό έναντι της βακτηριακής κολπίτιδας. Οι γιατροί μπορούν κανονικά να κάνουν μια πυελική εξέταση και να λάβουν δείγμα κολπικής έκκρισης για να ελέγξουν για σημεία βακτηριακής κολπίτιδας. Το δείγμα που λαμβάνει ένας γιατρός θα δείξει τα βακτήρια που υπάρχουν στο έκκριμα εάν μια γυναίκα έχει όντως βακτηριακή κολπίτιδα αντί για μόλυνση ζύμης.
Οι θεραπείες με αντιβιοτικά για τη βακτηριακή κολπίτιδα είναι συχνά αποτελεσματικές αμέσως. Τα συμπτώματα συνήθως αρχίζουν να υποχωρούν μετά την πρώτη ή δύο ημέρες από τη λήψη αντιβιοτικών. Τα αντιβιοτικά χορηγούνται κανονικά με τη μορφή κρεμών ή τζελ που πρέπει να εισαχθούν μέσα στον κόλπο. Οι έγκυες γυναίκες με βακτηριακή κολπίτιδα συνήθως συνταγογραφούνται αντιβιοτικά σε μορφή χαπιού, επειδή η εισαγωγή του φαρμάκου στον κόλπο κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης μπορεί να μην είναι ασφαλής για τα έμβρυα. Εάν τα αντιβιοτικά δεν ληφθούν για όλη τη διάρκεια που τους συνταγογραφήθηκαν, υπάρχει πιθανότητα να επιστρέψει η μόλυνση.