Ο βιολογικός πόλεμος, που αναφέρεται επίσης ως πόλεμος μικροβίων, είναι η χρήση επιβλαβών μικροοργανισμών όπως ιών ή βακτηρίων από στρατιωτικές φατρίες ή τρομοκράτες εναντίον αμάχων, αντίπαλων στρατευμάτων, καλλιεργειών ή ζώων. Οι οργανισμοί που χρησιμοποιούνται μπορεί να λειτουργούν παράγοντας επιβλαβή δηλητήρια ή τοξίνες είτε πριν είτε μετά την αποστολή τους. Μπορεί να μην είναι απαραίτητο να απελευθερωθεί μια μεγάλη ποσότητα ενός βιολογικού όπλου, καθώς ορισμένοι τύποι θανατηφόρων παραγόντων έχουν τη δυνατότητα να σκοτώσουν ακόμη και εκατομμύρια ανθρώπους απελευθερώνοντας μόνο ίχνη.
Ο βιολογικός πόλεμος μπορεί να χρησιμοποιηθεί με πολλούς διαφορετικούς τρόπους από μια στρατιωτική στολή ή άλλα άτομα με επιβλαβείς προθέσεις. Η πιο κοινή αντίληψη για τη χρήση βιολογικών παραγόντων είναι ότι προορίζονται να σκοτώσουν τεράστιες ποσότητες στρατιωτών και πολιτών, αλλά υπάρχουν πολλοί τρόποι με τους οποίους θα μπορούσαν να χρησιμοποιηθούν. Λιγότερα επιβλαβή μικρόβια θα μπορούσαν ενδεχομένως να διανεμηθούν μεταξύ των εχθρικών στρατιωτών για να τους κάνουν πολύ άρρωστους για να πολεμήσουν. Μια άλλη αποτελεσματική χρήση των μικροοργανισμών είναι η χρήση τους για να σκοτώσουν ή να βλάψουν τις καλλιέργειες τροφίμων του εχθρού με σκοπό τη διακοπή της παροχής τροφής τους, και αυτό μπορεί να περιλαμβάνει ζώα καθώς και βασικά τρόφιμα με βάση τα φυτά.
Το 1969 στις Ηνωμένες Πολιτείες, ο πρώην πρόεδρος των ΗΠΑ Ρίτσαρντ Μ. Νίξον δήλωσε ότι η χώρα δεν θα χρησιμοποιούσε πλέον βιολογικό πόλεμο εναντίον άλλων χωρών. Αυτός ο τύπος μάχης απαγορεύτηκε μέσω μιας διεθνούς συνθήκης το 1975, και περιλαμβάνει επίσης την κατοχή και παραγωγή βιολογικών όπλων. Ωστόσο, οι στρατιωτικοί στρατηγοί πρέπει ακόμη, μέχρι σήμερα, να λαμβάνουν υπόψη την πιθανή παράνομη χρήση βιολογικού πολέμου από τον εχθρό. Για το λόγο αυτό, υπάρχει συνεχής έρευνα σε όλο τον επιστημονικό κόσμο που είναι αφιερωμένη στην άμυνα ενάντια σε ένα πλήθος σεναρίων βιολογικής επίθεσης. Αυτές περιλαμβάνουν τρομοκρατικές επιθέσεις, που αναφέρονται επίσης ως βιοτρομοκρατία, οι οποίες ενδέχεται να συμβούν οπουδήποτε και ανά πάσα στιγμή.
Για να είναι αποτελεσματικό ένα βιολογικό όπλο, πρέπει να μπορεί να ταξιδεύει γρήγορα και σε μια ευρεία περιοχή. Πρέπει επίσης να είναι δύσκολο να αντιμετωπιστεί. Για παράδειγμα, εάν πρόκειται για ασθένεια, το εμβόλιο πρέπει να είναι δύσκολο ή να μην υπάρχει. Ο άνθρακας είναι ένας τύπος βιολογικού πολέμου που, εάν παραχθεί σωστά, θα μπορούσε να εξαπλωθεί αεροπορικώς σε μια ευρεία περιοχή και να μολύνει τον στόχο του σχετικά γρήγορα. Δεδομένου ότι τα αποτελέσματα του άνθρακα δεν μεταφέρονται μεταξύ ανθρώπων ή ζώων με φυσιολογικά μέσα όπως η αναπνοή, ο άνθρακας μπορεί εύκολα να περιοριστεί σε μια περιοχή στόχο. Ωστόσο, αυτή η περιοχή έχει τη δυνατότητα να είναι πολύ μεγάλη και θα παραμείνει μολυσμένη για μεγάλο χρονικό διάστημα μετά την απελευθέρωση του όπλου λόγω της αυξημένης αντοχής ενός ρύπου που έχει κατασκευαστεί ειδικά ως βιολογικό όπλο.
Άλλοι παράγοντες που έχουν χρησιμοποιηθεί ή σχεδιαστεί ως βιολογικός πόλεμος κατά των ανθρώπων περιλαμβάνουν τη χολέρα, την ευλογιά και τον κίτρινο πυρετό, για να αναφέρουμε μόνο μερικούς. Δεδομένου ότι υπάρχουν τόσες πολλές ποικιλίες, όσοι ασχολούνται με την άμυνα ενάντια στις βιολογικές επιθέσεις πρέπει να είναι προετοιμασμένοι να αναγνωρίσουν το είδος των μικροβίων ή των τοξινών όσο το δυνατόν γρηγορότερα μέσω ενός ευρέος φάσματος μεθόδων. Οι τοξίνες και τα δηλητήρια που παράγονται από τα βιολογικά όπλα συχνά θεωρούνται επίσης τύποι χημικού πολέμου. Υπάρχει αρκετή έρευνα που γίνεται τόσο στους τομείς του βιολογικού όσο και του χημικού πολέμου ταυτόχρονα, καθώς μπορούν να συνδέονται τόσο στενά μεταξύ τους.