Στον τομέα της βιολογίας, η μετάφραση χαραγών είναι μια διαδικασία που χρησιμοποιείται για την αντικατάσταση ορισμένων μορίων που αποτελούν κλώνους DNA με παρόμοια μόρια που παράγουν ένα συγκεκριμένο, επιθυμητό χαρακτηριστικό, συχνά ένα χαρακτηριστικό που επιτρέπει σε αυτά τα μόρια να εντοπίζονται και να αναγνωρίζονται εύκολα κατά τη διάρκεια ενός πειράματος. Ένα ένζυμο γνωστό ως πολυμεράση DNA Ι προκαλεί την αντικατάσταση ορισμένων μορίων DNA, γνωστών ως νουκλεοτιδίων, με νέα νουκλεοτίδια. Τα νέα νουκλεοτίδια επιλέγονται ειδικά από τους επιστήμονες που εκτελούν το πείραμα.
Συχνά η μετάφραση του ψευδώνυμου χρησιμοποιείται για επιστημονικές διαδικασίες όπως το στύπωμα. Αυτό περιλαμβάνει την απομόνωση και την εξέταση στελεχών του DNA για να καθοριστεί από ποια νουκλεοτίδια αποτελείται και στη συνέχεια η εκτέλεση πειραμάτων στον συγκεκριμένο κλώνο του DNA. Η εκμάθηση για διαφορετικές αλληλουχίες DNA μπορεί να βοηθήσει στην απομόνωση μιας μετάλλαξης ή στη δημιουργία ενός αντισώματος για την καταπολέμηση ενός ιού.
Η διαδικασία της μετάφρασης εγκοπής περιλαμβάνει αυτά που αναφέρονται ως ένζυμα περιορισμού που χρησιμοποιούνται για την πραγματοποίηση τομών ή «εγκοπών» στην αλληλουχία DNA. Ένα ένζυμο περιορισμού έχει σχεδιαστεί για να κόβει μια αλληλουχία DNA σε μια συγκεκριμένη τοποθεσία και είναι ένας τύπος αμυντικού μηχανισμού που χρησιμοποιείται για την καταστροφή επιβλαβών ιών. Οι επιστήμονες έβαλαν το περιοριστικό ένζυμο να δουλέψει κόβοντας κομμάτια του DNA ώστε να μπορούν να τα αντικαταστήσουν με νέα κομμάτια.
Μόλις γίνουν οι εγκοπές, χρησιμοποιούνται συγκεκριμένα ένζυμα για την επιδιόρθωση του DNA με ειδικά νουκλεοτίδια που έχουν σχεδιαστεί για να διευκολύνουν τη μελέτη του DNA. Οι επιστήμονες μελετούν αυτή τη νέα αλληλουχία DNA για να δουν πώς αντιδρά στον εαυτό της ή σε άλλα αντικείμενα και η ύπαρξη αυτών των νουκλεοτιδίων με ετικέτα απλοποιεί τη διαδικασία προσεκτικής παρακολούθησης και μελέτης του κλώνου DNA. Ένα συνηθισμένο παράδειγμα είναι η εισαγωγή επισημασμένων νουκλεοτιδίων που θα λάμπουν όταν τοποθετηθούν κάτω από ένα μαύρο φως, καθιστώντας έτσι εύκολο τον εντοπισμό τους.
Ένα άλλο συνηθισμένο παράδειγμα μιας από τις πολλές χρήσεις της μετάφρασης εγκοπής είναι ο υβριδισμός φθορισμού in situ. Αυτή η διαδικασία επιτρέπει σε έναν επιστήμονα να αναζητήσει συγκεκριμένες αλληλουχίες DNA για να δει εάν υπάρχουν ή όχι σε μια αλυσίδα DNA. Η μετάφραση Nick μπορεί να δώσει σε αυτούς τους κλώνους του DNA φθορίζουσες ιδιότητες, ώστε να λάμπουν και ο επιστήμονας μπορεί να το χρησιμοποιήσει για να βοηθήσει στον εντοπισμό ποιες αλληλουχίες DNA υπάρχουν και ποιες απουσιάζουν.
Τα νουκλεοτίδια που αφαιρούνται και στη συνέχεια αντικαθίστανται μέσω της μετάφρασης εγκοπής ονομάζονται συχνά «άχρηστο DNA». Οι επιστήμονες δεν έχουν ακόμη καταφέρει να βρουν κανένα είδος σκοπού που εξυπηρετούν αυτά τα μόρια DNA. Φαίνεται ότι δεν λειτουργούν και δεν φέρουν τον κωδικό για κανένα είδος πρωτεΐνης, όπως είναι τυπικό του πιο χρήσιμου DNA.