Η ηλεκτρονικά διαγραφόμενη προγραμματιζόμενη μνήμη μόνο για ανάγνωση (EEPROM) και η μνήμη flash έχουν πολλά κοινά. Τόσο το EEPROM όσο και η μνήμη flash είναι κατασκευασμένα σε μορφή τσιπ, μπορούν να αποθηκεύουν δεδομένα που μπορούν να διαγραφούν και να ξαναγραφτούν και να χρησιμοποιούν την ίδια τεχνολογία τρανζίστορ floating-gate. Αν και είναι σωστό να δηλωθεί ότι η μνήμη flash είναι ένας τύπος EEPROM, οι όροι EEPROM και μνήμη flash συνήθως περιγράφουν διαφορετικές συσκευές.
Το EEPROM, σε γενικούς όρους, αναφέρεται σε κάθε τύπο συσκευής μνήμης δεδομένων που μπορεί να έχει ψηφιακά δεδομένα γραμμένα σε αυτήν και να διαγράφονται μέσω της χρήσης μιας ηλεκτρονικής συσκευής κάποιου τύπου. Αυτό έρχεται σε αντίθεση με τη διαγραφόμενη προγραμματιζόμενη μνήμη μόνο για ανάγνωση (EPROM), η οποία πρέπει να αφαιρεθεί και να διαγραφεί φυσικά μέσω μιας μη ηλεκτρονικής μεθόδου, όπως με το υπεριώδες φως. Καθώς οι εκτελέσεις εγγραφής και διαγραφής της μνήμης flash εκτελούνται με υπολογιστή, η μνήμη flash είναι, εξ ορισμού, EEPROM.
Παρόλο που η μνήμη flash είναι ένας τύπος EEPROM, οι δύο όροι συνήθως περιγράφουν πολύ διαφορετικούς τύπους συσκευών. Για παράδειγμα, το EEPROM συνήθως ενσωματώνεται σε ένα μεγαλύτερο ολοκληρωμένο κύκλωμα (IC). Εξυπηρετεί τη λειτουργία της αποθήκευσης διαφόρων τμημάτων δεδομένων που χρειάζεται το υπόλοιπο IC για να επιτύχει το σκοπό του. Το EEPROM το κάνει αυτό αποθηκεύοντας δεδομένα σε μικρά μπλοκ, συνήθως μόνο ενός byte σε μήκος.
Η μνήμη flash, από την άλλη πλευρά, συνήθως χρησιμοποιείται σε αυτόνομες συσκευές αποθήκευσης μνήμης, όπως μονάδες USB ή κάρτες μνήμης κάμερας, και αποθηκεύει αρχεία χρήστη υπολογιστή. Για να γίνει αυτό, τα δεδομένα οργανώνονται σε μεγάλα μπλοκ, το καθένα από τα οποία περιέχει πολλά byte δεδομένων. Αυτά τα μεγάλα μπλοκ μπορούν να προσπελαστούν και να διαγραφούν πολύ πιο γρήγορα από τα μπλοκ δεδομένων ενός byte. Αυτή η πολύ μεγαλύτερη ταχύτητα στο χειρισμό δεδομένων είναι εκεί όπου η μνήμη flash αντλεί το όνομά της.
Το EEPROM και η μνήμη flash χρησιμοποιούν τρανζίστορ αιωρούμενης πύλης για την αποθήκευση δεδομένων. Ως αποτέλεσμα, και οι δύο μορφές μνήμης είναι μη ασταθείς. Το Non-Vatile αναφέρεται στη μνήμη που μπορεί να συνεχίσει να αποθηκεύει δεδομένα ακόμα και όταν δεν υπάρχει διαθέσιμη ισχύς. Αυτό έρχεται σε αντίθεση με άλλους τύπους μνήμης, όπως η μνήμη τυχαίας πρόσβασης υπολογιστή, που απορρίπτουν όλα τα αποθηκευμένα δεδομένα αμέσως μόλις διακοπεί η παροχή ρεύματος.
Ένα άλλο κοινό χαρακτηριστικό των τεχνολογιών που βασίζονται σε τρανζίστορ floating-gate είναι ο περιορισμένος κύκλος ζωής των τρανζίστορ λόγω ενός φαινομένου που ονομάζεται φθορά μνήμης. Κάθε φορά που γράφονται ή διαγράφονται δεδομένα από αυτές τις συσκευές, εμφανίζεται λίγο περισσότερη φθορά. Τελικά, μετά από 10,000 έως 100,000 κύκλους, τα τρανζίστορ θα αρχίσουν να αποτυγχάνουν. Ενώ το EEPROM περιέχει λειτουργικά δεδομένα που αλλάζουν σπάνια, τα δεδομένα που είναι αποθηκευμένα στη μνήμη flash αλλάζουν συχνά. Επομένως, ενώ τόσο η EEPROM όσο και η μνήμη flash αντιμετωπίζουν φθορά της μνήμης, συνήθως έχει πολύ μεγαλύτερη επίδραση στη μνήμη flash.