Η κρατική σημαία της Βόρειας Καρολίνας όπως κυματίζει αυτή τη στιγμή υιοθετήθηκε τον Μάρτιο του 1885. Ο στρατηγός Τζόνστον Τζόουνς πιστώνεται ότι πρότεινε το νομοσχέδιο που άλλαξε την κρατική σημαία της Βόρειας Καρολίνας από το προηγούμενο σχέδιο της, που αντιπροσώπευε τη Βόρεια Καρολίνα κατά τη διάρκεια του Εμφυλίου Πολέμου. Η τρέχουσα σημαία της Βόρειας Καρολίνας εμφανίζει μια φαρδιά, οριζόντια κόκκινη επάνω γραμμή, πάνω από μια φαρδιά, οριζόντια λευκή κάτω γραμμή. Μια κατακόρυφη μπλε ράβδος διακοσμεί την αριστερή πλευρά της σημαίας και πάνω σε αυτή τη γραμμή υπάρχουν τα γράμματα NC σε χρυσό, που χωρίζονται από ένα λευκό αστέρι. Πάνω από αυτά τα γράμματα, ένα χρυσό πανό διακηρύσσει την ημερομηνία της Διακήρυξης της Ανεξαρτησίας του Μεκλεμβούργου, 20 Μαΐου 1775, με μαύρα γράμματα. Ένα παρόμοιο banner κάτω από τα γράμματα NC εμφανίζει την ημερομηνία του Halifax Resolves, 12 Απριλίου 1776.
Το πρώτο άτομο που πρότεινε την υιοθέτηση μιας σημαίας της πολιτείας της Βόρειας Καρολίνας πιστεύεται ότι ήταν ο συνταγματάρχης John D. Whitford. Λέγεται ότι έκανε την πρότασή του στις 20 Μαΐου 1861, την ημέρα που η Βόρεια Καρολίνα ψήφισε για απόσχιση από τις Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής και ένταξη στις Συνομοσπονδιακές Πολιτείες της Αμερικής. Ενώ η Συνέλευση της Βόρειας Καρολίνας ενέκρινε την πρόταση σημαίας του Γουίτφορντ, η ομάδα τελικά απέρριψε το σχέδιό του. Αντίθετα, δέχτηκαν ένα σχέδιο που δημιουργήθηκε από τον William Jarl Browne. Αυτό το σχέδιο υιοθετήθηκε επίσημα από τη Σύμβαση της Βόρειας Καρολίνας στις 22 Ιουνίου 1861 και παρέμεινε σε χρήση μέχρι και μετά τον Εμφύλιο Πόλεμο.
Η αρχική σημαία της πολιτείας της Βόρειας Καρολίνας μοιάζει πολύ με τη σημερινή κρατική σημαία της Βόρειας Καρολίνας. Η θέση των κόκκινων και μπλε ράβδων όπως εμφανίζονται στη σύγχρονη σημαία του κράτους αντιστράφηκε. Η κάθετη γραμμή στα αριστερά ήταν κόκκινη και η οριζόντια επάνω γραμμή στα δεξιά ήταν μπλε. Η κόκκινη κάθετη μπάρα έφερε συνήθως ένα λευκό αστέρι.
Πάνω από αυτό το αστέρι αναγραφόταν γενικά η ημερομηνία της Διακήρυξης της Ανεξαρτησίας του Μεκλεμβούργου και κάτω από αυτό αναγραφόταν γενικά η ημερομηνία της επίσημης διαδοχής της Βόρειας Καρολίνας από τις Ηνωμένες Πολιτείες, 20 Μαΐου 1861. Οι ιστορικοί πιστεύουν ότι η Βόρεια Καρολίνα ήταν μία από τις δύο πολιτείες της Συνομοσπονδίας εκδίδει επίσημες κρατικές σημαίες στα συντάγματά της κατά τη διάρκεια του αμερικανικού εμφυλίου πολέμου.
Οι περισσότεροι πιστεύουν ότι η ανάγκη για μια νέα κρατική σημαία της Βόρειας Καρολίνας έγινε σαφής όταν η Βόρεια Καρολίνα εντάχθηκε ξανά στις Ηνωμένες Πολιτείες μετά τον Αμερικανικό Εμφύλιο Πόλεμο. Η πολιτεία της Βόρειας Καρολίνας συνεχίζει να χρησιμοποιεί το βασικό σχέδιο σημαίας που υιοθετήθηκε τον Μάρτιο του 1885. Μια πράξη του νομοθετικού σώματος της πολιτείας το 1991 επέκτεινε την κρατική σημαία της Βόρειας Καρολίνας και αφαίρεσε τα κόμματα από τις ημερομηνίες που εμφανίζονται σε αυτήν.