Ο κτηνιατρικός υπέρηχος χρησιμοποιείται σε πολλές από τις ίδιες συνθήκες που απαιτούν τη χρήση υπερήχων σε ανθρώπους. Μπορεί να είναι ένα χρήσιμο διαγνωστικό εργαλείο και μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για την παρακολούθηση των συνεχιζόμενων συνθηκών. Σε ορισμένες περιπτώσεις, μπορεί να είναι απαραίτητη η χρήση κτηνιατρικού υπερήχου επειδή τα ζώα δεν μπορούν να επικοινωνήσουν με τον άνθρωπο για τα συμπτώματά τους, και ως εκ τούτου, ένας υπέρηχος μπορεί να χρησιμοποιηθεί αντί μιας εκτεταμένης συνέντευξης με τον ασθενή.
Ένας από τους πιο συνηθισμένους λόγους για τον κτηνίατρο να χρησιμοποιεί υπερηχογράφημα είναι ως βοήθημα στη διάγνωση. Για παράδειγμα, εάν μια αρσενική γάτα φέρεται από έναν ιδιοκτήτη που ισχυρίζεται ότι η γάτα δυσκολεύεται να ουρήσει, ο κτηνίατρος μπορεί να χρησιμοποιήσει υπερηχογράφημα για να ελέγξει εάν υπάρχει απόφραξη στην ουροδόχο κύστη ή την ουρήθρα. Ο υπέρηχος μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για την εξέταση ύποπτων μαζών και άλλων ευρημάτων που προκύπτουν κατά τη διάρκεια μιας χειροκίνητης εξέτασης. Μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί σε περιπτώσεις έκτακτης ανάγκης για να αναζητήσετε σοβαρά ιατρικά προβλήματα, όπως εσωτερικά όργανα που έχουν υποστεί βλάβη σε σύγκρουση.
Μια κλινική μπορεί επίσης να χρησιμοποιήσει κτηνιατρικό υπέρηχο για να παρακολουθεί μια συνεχιζόμενη κατάσταση. Ένα έγκυο σκυλί, για παράδειγμα, μπορεί να υποβληθεί σε πολλές υπερηχογραφικές εξετάσεις για να επιβεβαιώσει την εγκυμοσύνη και να αξιολογήσει την υγεία των αναπτυσσόμενων κουταβιών. Ο υπέρηχος μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για την παρακολούθηση της προόδου της ηπατικής και νεφρικής νόσου, μαζί με τυχόν θεραπευτικές προσεγγίσεις, όπως συμβαίνει και στους ανθρώπους.
Ο κτηνιατρικός υπέρηχος μεγάλων ζώων μπορεί να χρησιμοποιηθεί για πράγματα όπως ο έλεγχος της υγείας της καρδιάς ενός ιππόδρομου, ο προσδιορισμός ότι μια αγελάδα είναι έτοιμη για αναπαραγωγή ή ο έλεγχος για την πηγή εντερικής απόφραξης σε μια κατσίκα. Ο κτηνιατρικός υπέρηχος μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για την καθοδήγηση διαδικασιών όπως οι βιοψίες, με τον κτηνίατρο να υποβάλλεται σε υπερηχογράφημα στην περιοχή ενδιαφέροντος για να επιβεβαιώσει ότι το δείγμα έχει ληφθεί από τη σωστή θέση.
Στην περίπτωση μεγάλων ζώων, ο κτηνίατρος μπορεί να φέρει το υπερηχογράφημα στο ζώο, για να μειώσει το στρες για το ζώο πριν από την εξέταση. Τα μικρά ζώα πρέπει γενικά να μεταφερθούν σε κτηνιατρική κλινική για υπερηχογραφική εξέταση. Και στις δύο περιπτώσεις, η διαδικασία είναι ανώδυνη και το ζώο γενικά δεν χρειάζεται νάρκωση, αν και συνήθως υπάρχει κτηνιατρικός τεχνικός ή βοηθός για να κρατήσει και να ηρεμήσει το ζώο, έτσι ώστε ο κτηνίατρος να έχει καλή εικόνα. Ο κτηνιατρικός υπέρηχος μπορεί να διαρκέσει από 30 λεπτά έως μιάμιση ώρα, ανάλογα με τον λόγο της εξέτασης και τον τύπο του ζώου.
Δεν προσφέρουν όλοι οι κτηνίατροι υπερηχογράφημα. Ορισμένοι κτηνίατροι μπορεί να χρειαστεί να παραπέμψουν τους πελάτες τους σε άλλο κτηνίατρο ή σε ειδικό κτηνιατρικό υπερηχογράφημα. Οι ιδιοκτήτες μπορεί να επιλέξουν να είναι παρόντες κατά τη διάρκεια της εξέτασης σε ορισμένες περιπτώσεις και ο κτηνίατρος μπορεί να παράσχει πληροφορίες σχετικά με τις ανατομικές δομές που παρατηρούνται κατά τη διάρκεια της υπερηχογραφικής εξέτασης. Ανάλογα με τα ευρήματα της μελέτης απεικόνισης, ένας κτηνίατρος μπορεί να συστήσει την καλύτερη πορεία δράσης, η οποία μπορεί να ποικίλει από το να ζητήσει πρόσθετο έλεγχο έως τη σύσταση αλλαγής φαρμάκου έως τη συνέχιση της φροντίδας του ζώου όπως πριν.