Trzecia komora jest jedną z czterech wypełnionych płynem jam w układzie komorowym w ludzkim mózgu. Rozciąga się od centralnego kanału rdzenia kręgowego i jest wypełniony płynem mózgowo-rdzeniowym (CSF). Pozostałe cztery komory składają się z dwóch komór bocznych i czwartej komory. Razem zapewniają ochronę i stabilność mózgu. To sprawia, że układ komorowy jest niezbędny do prawidłowego rozwoju i wzrostu neuronów u człowieka.
Trzecia komora rozwija się w taki sam sposób jak reszta układu komorowego — z kanału centralnego cewy nerwowej. Dokładniej, ta komora pochodzi z części cewy nerwowej, która jest obecna w przodomózgowiu. Jest to również znane jako przomózgowie.
Trzecia komora to wąska jama pomiędzy dwiema bocznymi komorami układu komorowego. Trzecia komora jest zasadniczo jamą pośrodkową mózgu, która leży na szczycie skrzyżowania wzrokowego, tuber cinereum, ciał sutkowych, lejka, tylnej perforowanej substancji i najwyższej części nakrywki śródmózgowia. Jest również związany po obu stronach wzgórza i podwzgórza. Dach trzeciej komory składa się z warstwy wyściółki, która jest cienką wyściółką błony nabłonkowej.
Trzecia komora ma również kilka małych pustych obszarów lub wgłębień zwanych wgłębieniami. Zagłębienie przedwzrokowe znajduje się z tyłu skrzyżowania wzrokowego, gdzie nerwy wzrokowe przechodzą do mózgu. Następnie wgłębienie lejka jest obszarem w kształcie lejka sięgającym do lejka. Ciała sutkowe wbijające się w jamę powodują, że trzecia wnęka nazywana jest wnęką sutkową. Wreszcie wgłębienie szyszynki znajduje się w tylnym rogu trzeciej komory i rozciąga się do szyszynki.
Połączenia między czterema komorami umożliwiają przepływ płynu mózgowo-rdzeniowego między trzecią komorą a pozostałymi. W szczególności komora ta komunikuje się z komorami bocznymi do przodu przez otwór międzykomorowy. Komunikuje się również z czwartą komorą z tyłu przez akwedukt mózgowy, który jest również znany jako akwedukt Sylviusa.
Głównym celem układu komorowego jest wytwarzanie i krążenie płynu mózgowo-rdzeniowego w mózgu. To amortyzuje mózg i rdzeń kręgowy przed uszkodzeniem w czaszce. Wstrząśnienie mózgu, czyli siniak, powstaje w wyniku kontaktu z czaszką podczas silnego wstrząsu. Płyn mózgowo-rdzeniowy zapewnia również pływalność, która wspiera mózg w walce z grawitacją i zapewnia unoszenie się mózgu.