Skutki struktury organizacyjnej mogą rozciągać się na niemal każdy rodzaj wymiernej wydajności. Dobrze zaplanowana, łatwa do adaptacji struktura może pomóc firmie rozwijać się w wielu obszarach, tworząc reakcję łańcuchową wzajemnego wsparcia i doskonalenia. Niektóre z najważniejszych efektów struktury organizacyjnej można zaobserwować w morale pracowników, komunikacji wewnętrznej, wydajności i efektywności.
Morale pracowników często w dużej mierze zależy od silnej struktury organizacyjnej. Pracownicy zwykle czują się zmotywowani i lojalni, gdy są traktowani z szacunkiem, stanowią wyzwanie dla ich pracy i mają dostęp do możliwości awansu. Wpływ struktury organizacyjnej na morale pracowników może być również negatywny; jeśli na przykład organizacja rutynowo nagradza kierowników działów podwyżkami i premiami, jednocześnie zamrażając pensje młodszych pracowników, pracownicy niższego szczebla mogą szybko rozczarować się pracą. Ponieważ część struktury organizacyjnej określa sposób zarządzania programami motywacyjnymi, dyscypliną i rozwojem, sposób organizacji firmy może odgrywać bardzo realną rolę w stanie morale.
To, jak dobrze komunikują się pracownicy i działy, to kolejny z najważniejszych efektów struktury organizacyjnej. W sztywno ustrukturyzowanym, silnie odseparowanym środowisku pracownicy mogą nie mieć dostępu do informacji lub personelu niezbędnego do wykonania zadania. I odwrotnie, zbyt luźna organizacja może prowadzić do niejasnego łańcucha dowodzenia, co oznacza, że pracownicy mogą nie być w stanie dowiedzieć się, z kim mają rozmawiać o projekcie lub obawach. Ważnym elementem struktury organizacyjnej jest zrównoważenie potrzeby elastyczności między działami ze znaczeniem jasnego łańcucha dowodzenia.
Wydajność w organizacji odnosi się do ilości pracy niezbędnej do osiągnięcia celów wydajnościowych. Jeśli organizacja jest zorganizowana w efektywny sposób, praca będzie wydajna i użyteczna, przy niewielkich stratach. Wpływ struktury organizacyjnej na efektywność może być ogromny, ponieważ źle zorganizowany system może spowolnić pracę w niemal każdym obszarze firmy. Przykładem struktury organizacyjnej prowadzącej do nieefektywności może być pracownik, który musi przejść przez siedem poziomów szefów i przełożonych, aby uzyskać zgodę na zadanie, jego praca może stać w miejscu przez wiele godzin, jeśli nie dni, czekając na zatwierdzenie. Proces dostosowywania struktury pod kątem wydajności zazwyczaj wiąże się z uproszczeniem lub usprawnieniem łańcuchów dowodzenia.
Celem większości organizacji jest efektywność we wszystkich obszarach, w tym relacji pracowniczych, wydajności, sprzedaży i marketingu. Strukturę organizacyjną często określa się mianem „szkieletu” firmy, co może pomóc lub utrudnić osiągnięcie efektywności. Jednym ze sposobów, w jaki struktura może wpływać na skuteczność, jest wbudowanie procesu przeglądu, który porównuje oczekiwania z rzeczywistą wydajnością. Tworząc strukturę organizacyjną, która może dokonywać przeglądów i dostosowywać się, firma może stale iść naprzód w kierunku osiągania celów efektywności.