Kostnienie śródbłoniaste zachodzi podczas rozwoju ssaków w macicy i jest procesem, w którym z tkanki łącznej powstają płaskie kości, takie jak niektóre kości czaszki i obojczyki. Jest to również proces, w którym zranione kości goją się i występuje, gdy kości są złamane lub uszkodzone w celu odbudowy kości. Również podczas rozwoju embrionalnego dochodzi do kostnienia śródchrzęstnego, procesu, w którym kości są wytwarzane z chrząstki. Kostnienie śródchrzęstne występuje podczas rozwoju kości długich, takich jak ręce i nogi. W kostnieniu śródbłoniastym nie ma chrząstki, a zamiast tego kości rozwijają się z innych tkanek łącznych.
Proces rozpoczyna się od mezenchymalnych komórek macierzystych (MSC), czyli komórek, które nie zostały jeszcze zróżnicowane w konkretny typ komórek. MSC rozwijają się w osteoblasty, komórki wytwarzające tkankę kostną, zarówno gąbczastą tkankę wewnętrzną szpiku, jak i zmineralizowaną zwartą tkankę kostną otaczającą szpik. Podczas kostnienia zachodzi kilka etapów, gdy MSC zmieniają się, różnicują i stają się specyficznymi typami komórek kostnych. Podobny proces zachodzi w celu naprawy złamanej lub uszkodzonej kości, przy czym tkanka kostna rozwija się z tkanki błoniastej lub łącznej w podobny sposób, w jaki rozwija się w macicy.
W podstawowym procesie MSC tworzą warstwy stosunkowo prymitywnej tkanki łącznej, a inne rozwijają się w komórki produkujące kości. Komórki produkujące kości tworzą następnie macierz kostną wapnia, która ostatecznie gromadzi się w spikuli kostnych. Spikule kostne powiększają się w miarę wydalania większej ilości macierzy kostnej, ostatecznie łącząc się w większą formację zwaną beleczkami. Struktury te kontynuują proces, niektóre budują się na sobie i ostatecznie tworzą splecioną kość, a inne beleczki pozostają jako gąbczasta tkanka, która staje się szpikiem kostnym.
Kości lub części kości, które rozwijają się w procesie kostnienia śródbłoniastego, obejmują obojczyki; rzepka lub rzepka; kości ciemieniowe, czołowe, potyliczne i skroniowe w czaszce; oraz górną i dolną szczękę. W ten sposób rozwijają się również inne wyspecjalizowane struktury, takie jak skorupa żółwia. Przyczynia się również do wzrostu kości, zwłaszcza do wzrostu kości krótkich i pogrubienia kości długich w miarę ich rozwoju.
Ten złożony proces rozwoju kości zachodzi u wszystkich ssaków, zarówno w macicy, jak i wtedy, gdy konieczna jest naprawa kości. Nawet u ssaków innych niż ludzie te same zestawy kości powstają w wyniku kostnienia śródbłoniastego. W niektórych przypadkach, tak jak w przypadku żółwia, zwierzęta rozwijają inne kości lub struktury oprócz kości czaszki, obojczyka i innych kości płaskich.