Στα ολιστικά θεραπευτικά συστήματα εμπνευσμένα από τους Ινδουιστές, τα τσάκρα θεωρούνται ως δίνες ενέργειας. Όπως συμβαίνει με τις αρχαίες παραδόσεις, έχουν αναπτυχθεί παραλλαγές των μοντέλων του συστήματος τσάκρα. Μερικές παραλλαγές είναι η δυτική παράδοση, το Bön και τα συστήματα ταντρικού τσάκρα. Η κινεζική ιατρική ενσωματώνει επίσης ενεργειακά κέντρα που είναι παρόμοια με τα τσάκρα.
Τα περισσότερα συστήματα τσάκρα έχουν επτά κύρια τσάκρα, τα οποία ξεκινούν από τη βάση της σπονδυλικής στήλης και κινούνται προς τα πάνω στην κορυφή του κεφαλιού. Κατά τον ορισμό των τσάκρα, αυτά τα επτά ονομάζονται τσάκρα ρίζας, ιερού, ηλιακού πλέγματος, καρδιάς, λαιμού, τρίτου ματιού και στέμματος, τα οποία μπορεί να αντιστοιχούν σε ομάδες νεύρων στο σώμα. Αυτή η ενέργεια μπορεί να απαιτεί εξισορρόπηση τσάκρα ή τεχνικές θεραπείας τσάκρα για τη διατήρηση της ευεξίας.
Η δυτική σκέψη για τα συστήματα τσάκρα έχει επηρεαστεί έντονα από τις μεταφράσεις και τα έργα του Sir John Woodruff και του CW Leadbetter. Στη δυτική παράδοση, οι ινδουιστικές έννοιες των τσάκρα έχουν αναμειχθεί με την παραδοσιακή αντίληψη της κινεζικής ιατρικής για το qi, ή την ενέργεια της ζωής. Όπως συμβαίνει με πολλές άλλες παραδόσεις, στη δυτική παράδοση τα τσάκρα ευθυγραμμίζονται από τη βάση της σπονδυλικής στήλης μέχρι το στέμμα στο κεφάλι. Οι παράγωγοι της Νέας Εποχής συνήθως συνδέουν ένα χρώμα με κάθε τσάκρα, μαζί με άλλα φυσικά, διανοητικά και συναισθηματικά χαρακτηριστικά. Ορισμένες παραλλαγές δηλώνουν την ύπαρξη ενός τσάκρα κάτω από τα πόδια, γνωστό ως τσάκρα του αστέρα της Γης, και ενός ή περισσότερων τσάκρα πάνω από το κεφάλι, γνωστά ως Υπερπροσωπικά τσάκρα.
Μια παράδοση του Bönpo των Ιμαλίων, που διδάσκεται από τον Tenzin και τον Wangyal Rinpoche, ονομάζεται Bön. Στην παράδοση του Bön υπάρχουν έξι κύρια τσάκρα. Τα τσάκρα Bön αντιστοιχούν στα βουδιστικά έξι βασίλεια εμπειρίας. Μια βασική ιδέα σε αυτή την πρακτική είναι ότι τα τσάκρα, τα οποία είναι κέντρα δύναμης της ζωής, θα επηρεάσουν τον χαρακτήρα της αντιληπτής πραγματικότητας.
Οι ινδουιστικές παραδόσεις ταντρικού τσάκρα συνδέονται συχνά με την αισθησιασμό και τη σεξουαλικότητα. Η Κουνταλίνι γιόγκα μπορεί να χρησιμοποιηθεί σε πρακτικές ταντρικής θεραπείας. Οι ασκούμενοι συλλαμβάνουν ένα φίδι ενέργειας που τυλίγεται κοντά στο κάτω μέρος της σπονδυλικής στήλης. Ορισμένες στάσεις γιόγκα μπορούν να χρησιμοποιηθούν για τη θεραπεία των τσάκρα προκαλώντας το ξετύλιγμα του φιδιού. Αυτή η δράση μπορεί να απελευθερώσει μια μεταμόρφωση όπου όλα τα τσάκρα, από τη ρίζα μέχρι το στέμμα, τρυπούνται και η συνείδηση του ατόμου συγχωνεύεται με αυτή του σύμπαντος.
Παρόμοια με τα συστήματα τσάκρα, η ιδέα των ενεργειακών κέντρων χρησιμοποιείται επίσης στην κινεζική ιατρική. Η ενέργεια της ζωής κινείται κάτω από ένα κανάλι κοντά στο μπροστινό μέρος του σώματος και προς τα πάνω κατά μήκος ενός καναλιού κοντά στο πίσω μέρος. Όπως ισχύει για τα ινδουιστικά συστήματα θεραπείας τσάκρα, η ενέργεια πρέπει να ρέει ελεύθερα για να διατηρηθεί η υγεία.