Ο έμμηνος κύκλος αναφέρεται στον γυναικείο αναπαραγωγικό κύκλο. Περιλαμβάνει ωορρηξία και έμμηνο ρύση και συνήθως συμβαίνει τακτικά κάθε μήνα. Οι περισσότερες γυναίκες ξεκινούν τον εμμηνορροϊκό κύκλο τους στις αρχές της εφηβείας και συνεχίζουν να βιώνουν τον κύκλο τακτικά μέχρι την εμμηνόπαυση, περίπου στην ηλικία των 50 ετών. Ο τυπικός εμμηνορροϊκός κύκλος διαρκεί 21 έως 35 ημέρες, με τον μέσο όρο να είναι 28 ημέρες. Η ωορρηξία συνήθως συμβαίνει στα μισά του κύκλου και η έμμηνος ρύση εμφανίζεται συνήθως στο τέλος του κύκλου.
Όταν μια νεαρή κοπέλα έχει την πρώτη της έμμηνο ρύση, ή εμμηναρχή, θεωρείται γενικά ότι είναι γόνιμη. Τα περισσότερα κορίτσια εμφανίζουν εμμηναρχή κάποια στιγμή μεταξύ οκτώ και 15 ετών. Οι σωματικές αλλαγές που συνοδεύουν την εφηβεία αρχίζουν γενικά περίπου δύο χρόνια πριν από την εμμηναρχή.
Ο αναπαραγωγικός κύκλος που είναι γνωστός ως εμμηνορροϊκός κύκλος αποτελείται γενικά από κάτι περισσότερο από την έμμηνο ρύση. Ο μέσος έμμηνος κύκλος διαρκεί 28 ημέρες. Κατά μέσο όρο, η ωορρηξία εμφανίζεται τη 14η ημέρα του εμμηνορροϊκού κύκλου. Μια γυναίκα θεωρείται πιο πιθανό να συλλάβει τις ημέρες 11 έως 14 του μέσου εμμηνορροϊκού κύκλου.
Κατά τις πρώτες ημέρες του εμμηνορροϊκού κύκλου, η επένδυση της μήτρας μιας γόνιμης γυναίκας γίνεται κανονικά παχιά, έτσι ώστε ένα γονιμοποιημένο ωάριο μπορεί ενδεχομένως να εμφυτευτεί και να αρχίσει να μεγαλώνει σε έμβρυο. Εάν η γυναίκα δεν συλλάβει κατά τη διάρκεια ενός συγκεκριμένου εμμηνορροϊκού κύκλου, τότε η μήτρα θα αποβάλλει γενικά την επένδυση της, μαζί με το μη γονιμοποιημένο ωάριο. Η αποβολή της επένδυσης της μήτρας συνήθως οδηγεί σε μια περίοδο κολπικής αιμορραγίας που μπορεί να διαρκέσει δύο έως επτά ημέρες. Αυτή η κολπική αιμορραγία μπορεί να είναι βαριά ή ελαφριά και συχνά συνοδεύεται από επώδυνες κράμπες και άλλα σωματικά συμπτώματα, όπως φούσκωμα, κόπωση και εναλλαγές της διάθεσης. Αυτά τα συμπτώματα θεωρούνται φυσιολογικά συμπτώματα της εμμήνου ρύσεως και συνήθως μπορούν να ανακουφιστούν με υγιεινή διατροφή, τακτική άσκηση και δραστηριότητες διαχείρισης του στρες.
Η περίοδος της κολπικής αιμορραγίας που είναι γνωστή ως εμμηνορροϊκή περίοδος θεωρείται γενικά το τελευταίο βήμα στον εμμηνορροϊκό κύκλο. Μόλις τελειώσει η έμμηνος ρύση, ο εμμηνορροϊκός κύκλος συνήθως ξεκινά εκ νέου. Τα επίπεδα οιστρογόνων στο σώμα της γόνιμης γυναίκας συνήθως αυξάνονται κατά τις δύο πρώτες εβδομάδες του κύκλου. Αυτή η αύξηση των επιπέδων οιστρογόνων θεωρείται υπεύθυνη για τη σταδιακή πάχυνση της επένδυσης της μήτρας και, τελικά, για την ωορρηξία. Οι περισσότερες γυναίκες φτάνουν στην έναρξη της εμμηνόπαυσης μεταξύ 45 και 50 ετών, όταν οι εμμηνορροϊκοί κύκλοι μπορεί να επιμηκυνθούν και να γίνουν ακανόνιστες, οδηγώντας σε οριστική διακοπή της ωορρηξίας και της εμμήνου ρύσεως.