Η χειρουργική επέμβαση ημικρανίας χρησιμοποιείται συνήθως ως έσχατη λύση όταν άλλες μέθοδοι θεραπείας δεν ήταν επιτυχείς, καθώς υπάρχουν πιθανές επιπλοκές που σχετίζονται με οποιαδήποτε χειρουργική επέμβαση. Υπάρχουν διάφοροι τύποι χειρουργικών επεμβάσεων ημικρανίας, ανάλογα με την υποκείμενη αιτία των πονοκεφάλων. Οι πιο δημοφιλείς επεμβάσεις περιλαμβάνουν αρτηριακή χειρουργική επέμβαση, κλείσιμο ωοειδούς τρήματος και απελευθέρωση του σημείου ενεργοποίησης. Η διέγερση του νωτιαίου μυελού μπορεί να είναι μια καλή επιλογή για όσους υποφέρουν από πολλαπλές κρίσεις ημικρανίας κάθε μήνα. Οποιεσδήποτε συγκεκριμένες ερωτήσεις ή ανησυχίες σχετικά με τους διάφορους τύπους χειρουργικής επέμβασης ημικρανίας ή την καταλληλότερη διαδικασία για μια μεμονωμένη κατάσταση θα πρέπει να συζητηθούν με έναν γιατρό ή άλλο επαγγελματία ιατρό.
Η αρτηριακή επέμβαση είναι ο πιο συχνά εκτελούμενος τύπος χειρουργικής επέμβασης ημικρανίας και ενδείκνυται σε περιπτώσεις όπου ένας ή περισσότεροι από τους κλάδους της καρωτίδας, που βρίσκονται στον αυχένα, είναι διευρυμένοι. Όταν αυτά τα αγγεία επισκευάζονται χειρουργικά, οι περισσότεροι ασθενείς θα βιώσουν ανακούφιση από τον πόνο καθώς και παύση των συσχετιζόμενων συμπτωμάτων ημικρανίας, όπως ναυτία και ευαισθησία στο φως και τον ήχο. Οι τομές για αυτό το είδος επέμβασης τοποθετούνται συνήθως εντός της γραμμής των μαλλιών, έτσι ώστε να μην υπάρχουν ορατές ουλές και να είναι σπάνιες οι σοβαρές επιπλοκές.
Το πατεντό κλείσιμο του ωοειδούς τρήματος είναι μια μορφή χειρουργικής επέμβασης ημικρανίας που χρησιμοποιείται όταν υπάρχει μια τρύπα στην καρδιά λόγω γενετικής ανωμαλίας. Αυτό το ελάττωμα έχει αποδειχθεί ότι προκαλεί χρόνιες ημικρανίες, οι οποίες συχνά δεν ανταποκρίνονται σε πιο παραδοσιακές μεθόδους θεραπείας. Υπάρχουν σημαντικοί κίνδυνοι που σχετίζονται με αυτή τη χειρουργική επέμβαση, καθώς η τυχαία βλάβη στον καρδιακό ιστό μπορεί να οδηγήσει σε καρδιακή ανακοπή ή θάνατο.
Η απελευθέρωση της θέσης ενεργοποίησης μπορεί να επιλεγεί ως ο προτιμώμενος τύπος χειρουργικής επέμβασης ημικρανίας σε καταστάσεις όπου πιστεύεται ότι οι πονοκέφαλοι προκαλούνται λόγω φλεγμονής ή κατεστραμμένων νεύρων. Ανάλογα με τα συγκεκριμένα νεύρα που έχουν τραυματιστεί, η απελευθέρωση του σημείου ενεργοποίησης μπορεί να περιλαμβάνει χειρουργική αποσύνδεση του προσβεβλημένου νεύρου ή ψαλίδισμα ενός κοντινού μυός και επανασύνδεση των υγιών άκρων. Η μερική παράλυση είναι από τις πιο συχνές επιπλοκές που προκύπτουν από αυτή τη διαδικασία.
Η διέγερση του νωτιαίου μυελού προορίζεται για όσους υποφέρουν από σοβαρές ημικρανίες πολλές φορές κάθε μήνα και δεν έχουν ανταποκριθεί σε άλλες θεραπευτικές επιλογές. Μια συσκευή γνωστή ως διεγέρτης νωτιαίου μυελού εμφυτεύεται χειρουργικά κάτω από την περιοχή του δέρματος που καλύπτει τη σπονδυλική στήλη και έχει σχεδιαστεί για να διακόπτει τα σήματα πόνου. Η συσκευή μπορεί να αφαιρεθεί εάν αυτή η μέθοδος θεραπείας δεν παρέχει επαρκή ανακούφιση από τον πόνο.