Ανάλογα με τη σοβαρότητα της διαταραχής, διατίθενται διάφορες επιλογές θεραπείας για ασθενείς με υπερδραστήριο αυτόνομο νευρικό σύστημα. Αυτή η κατάσταση μπορεί να προκληθεί από άλλη διαταραχή, όπως ο αλκοολισμός ή ο διαβήτης, και όταν είναι δυνατόν, η θεραπεία αυτών των ασθενειών μπορεί να θεραπεύσει πλήρως τα προβλήματα στο αυτόνομο νευρικό σύστημα. Για περιπτώσεις που εμφανίζονται αυθόρμητα, δεν υπάρχει θεραπεία, αν και υπάρχουν αλλαγές στον τρόπο ζωής και φάρμακα που μπορούν να βοηθήσουν τους ασθενείς να αντιμετωπίσουν τις δυσμενείς επιπτώσεις αυτών των διαταραχών. Το είδος της θεραπείας που χρησιμοποιείται συχνά εξαρτάται από τη σοβαρότητα των συμπτωμάτων.
Σε ορισμένες περιπτώσεις, ένας ασθενής μπορεί να αναπτύξει ένα υπερδραστήριο αυτόνομο νευρικό σύστημα επειδή έχει άλλο ιατρικό πρόβλημα. Είναι γνωστό ότι ο αλκοολισμός διαταράσσει τη λειτουργία αυτού του συστήματος, και σε μια τέτοια περίπτωση, η θεραπεία θα περιλάμβανε την αποχή από το αλκοόλ και την παροχή χρόνου στο σώμα να επουλωθεί από τη ζημιά που προκαλείται από την υπερβολική κατανάλωση αλκοόλ. Οι ασθενείς με διαβήτη μπορεί επίσης να εμφανίσουν προβλήματα με το αυτόνομο νευρικό σύστημα, και παρόλο που αυτή η ασθένεια δεν μπορεί να θεραπευτεί, η σωστή διαχείρισή της μπορεί να εξαλείψει πολλά από τα συμπτώματα. Ορισμένοι τύποι ιογενών λοιμώξεων μπορούν επίσης να προκαλέσουν διαταραχές του αυτόνομου νευρικού συστήματος, οι οποίες μπορεί να υποχωρήσουν από μόνες τους μόλις κατασταλεί η λοίμωξη.
Σε πολλές περιπτώσεις, ωστόσο, δεν είναι δυνατή η θεραπεία ενός υπερδραστήριου αυτόνομου νευρικού συστήματος. Ασθενείς με ορισμένες γενετικές διαταραχές. εκφυλιστικές ασθένειες, όπως η νόσος του Πάρκινσον. ή τραυματισμοί που έχουν καταστρέψει τα μέρη του εγκεφάλου που ελέγχουν το αυτόνομο νευρικό σύστημα μπορεί να χρειαστεί να διαχειριστούν αυτή τη διαταραχή για ολόκληρη τη ζωή τους. Σε ήπιες περιπτώσεις που επηρεάζουν τον ασθενή μόνο κατά διαστήματα ή που αυξάνουν ελαφρώς την αρτηριακή πίεση και τον καρδιακό ρυθμό, ο ασθενής μπορεί να είναι σε θέση να διαχειριστεί τα συμπτώματα με τεχνικές μείωσης του στρες. Μια σωστή διατροφή, ένα υψηλό επίπεδο φυσικής κατάστασης και μια θετική προοπτική για τη ζωή μπορούν όλα να βοηθήσουν να ηρεμήσει τον ασθενή και να καταπιέσει τη ροή της αδρεναλίνης που προκαλεί υπερβολική αντίδραση του συστήματος. Οι βαθιές αναπνοές και ο διαλογισμός είναι επίσης χρήσιμες, ειδικά όταν ένας ασθενής υποφέρει από επίθεση.
Πιο σοβαρές περιπτώσεις μπορεί να απαιτούν τη χρήση φαρμάκων ή άλλης ιατρικής παρέμβασης. Ορισμένα φάρμακα μπορούν να χρησιμοποιηθούν για τη μείωση της αρτηριακής πίεσης και του καρδιακού ρυθμού, ενώ άλλα μπορεί να βοηθήσουν τον ασθενή να αισθάνεται λιγότερο άγχος. Χειρουργικές επεμβάσεις που επιτρέπουν στην καρδιά να χτυπά κανονικά μπορεί επίσης να είναι διαθέσιμες σε ασθενείς με σοβαρά προβλήματα που επηρεάζουν τον καρδιακό ρυθμό.