Οι παρενέργειες του φαρμάκου για τον θυρεοειδή μπορεί να εμφανιστούν όταν ένας ασθενής παίρνει πάρα πολύ ή όχι αρκετά, προκαλώντας μη φυσιολογικά επίπεδα θυρεοειδικής ορμόνης. Μπορεί επίσης να υπάρχουν ανησυχίες σχετικά με τις αλληλεπιδράσεις με άλλα τρόφιμα ή διατροφικά συστατικά όπως το ιώδιο. Οι ακριβείς παρενέργειες μπορεί να εξαρτώνται από το φάρμακο και τις συγκεντρώσεις της θυρεοειδικής ορμόνης στο σώμα, αλλά μπορεί να περιλαμβάνουν πονοκεφάλους, κακή θερμορύθμιση, αλλαγές βάρους και κόπωση. Οι ασθενείς θα πρέπει να συζητήσουν τις παρενέργειες με τους ιατρούς τους, καθώς μπορεί να υποδείξουν ότι το φάρμακο δεν λειτουργεί όπως προβλέπεται.
Τα άτομα που δεν παράγουν αρκετή θυρεοειδική ορμόνη πρέπει να πάρουν ένα συνθετικό φάρμακο για να αντικαταστήσει τη λειτουργία αυτού του αδένα. Ενώ έχουν χαμηλά επίπεδα ορμονών, μπορεί να έχουν συμπτώματα όπως μυϊκούς πόνους, υπερβολική κόπωση και δυσκοιλιότητα. Αυτά μπορεί να επιμείνουν ενώ η δόση του θυρεοειδικού φαρμάκου προσαρμόζεται αργά προς τα πάνω για να βρεθεί το σημείο στο οποίο είναι αποτελεσματικό. Οι ασθενείς μπορεί να περάσουν εβδομάδες ή μήνες για να συνηθίσουν το φάρμακο, κατά τη διάρκεια των οποίων παρακολουθούν τακτικά ραντεβού παρακολούθησης για να δουν αν χρειάζονται υψηλότερες δόσεις.
Μόλις ο ασθενής λάβει τη σωστή δόση, οι παρενέργειες θα πρέπει να υποχωρήσουν, επειδή το σώμα λαμβάνει την ορμόνη που χρειάζεται. Εάν οι συγκεντρώσεις αυξηθούν πολύ υψηλές, οι άνθρωποι μπορεί να παρατηρήσουν παρενέργειες του φαρμάκου του θυρεοειδούς όπως απώλεια βάρους, ανεξέλεγκτο τρέμουλο, διάρροια και εφίδρωση. Μερικοί ασθενείς εμφανίζουν νευρικότητα ή διέγερση μαζί με αϋπνία. Αυτά τα συμπτώματα μπορεί να επιμείνουν έως ότου τα επίπεδα της ορμόνης εξισορροπηθούν σωστά, μειώνοντας τη δόση ή επιλύοντας μια αλληλεπίδραση με το φάρμακο.
Πιο σοβαρά, το φάρμακο για τον θυρεοειδή μπορεί να προκαλέσει πόνο στο στήθος, εξανθήματα, αρρυθμίες και αίσθημα παλμών. Αυτά μπορεί να αποτελούν ιδιαίτερο κίνδυνο σε άτομα που πάσχουν από στεφανιαία νόσο ή άλλες καρδιακές παθήσεις και θα πρέπει να αναφέρονται σε γιατρό εάν εμφανιστούν. Η δόση του φαρμάκου για τον θυρεοειδή μπορεί να προσαρμοστεί για να μειώσει τα επίπεδα και να βρει ένα πιο κατάλληλο επίπεδο για χρήση στο μέλλον. Αυτό διασφαλίζει ότι ο ασθενής λαμβάνει αρκετή φαρμακευτική αγωγή για να αντικαταστήσει τη λειτουργία του θυρεοειδούς αδένα χωρίς να συσσωρεύονται πάρα πολλά, που ενδέχεται να αντιμετωπίζουν ανεπιθύμητες επιπλοκές.
Όταν συνιστάται αυτό το φάρμακο, οι ασθενείς πρέπει να παραμείνουν σε αυτό μέχρι να επιλυθεί το υποκείμενο πρόβλημα ή εφ’ όρου ζωής, εάν ο θυρεοειδής έχει υποστεί μόνιμη βλάβη ή έχει αφαιρεθεί. Κατά τη διάρκεια της θεραπείας με φάρμακα για τον θυρεοειδή, οι ασθενείς πρέπει να παρακολουθούν τακτικά ιατρικά ραντεβού για να μπορούν ο γιατρός να ελέγχει τα επίπεδα. Αυτά μπορούν να εντοπίσουν μια αύξηση των ορμονών προτού αρχίσει να προκαλεί σοβαρές παρενέργειες, έτσι ο γιατρός μπορεί προληπτικά να προσαρμόσει τη δόση για να αποτρέψει την ενόχληση.