Είναι δύσκολο να προσδιοριστεί εάν κάποιο φάρμακο είναι 100% ασφαλές για χρήση κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης και η κωδεΐνη δεν αποτελεί εξαίρεση. Μελέτες για τη χρήση κωδεΐνης κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης δεν έχουν αποκλείσει τους κινδύνους εμφάνισης των αναπτυσσόμενων μωρών. Σε γενικές γραμμές, οι γιατροί αποφεύγουν να το συνταγογραφήσουν εκτός εάν προσδιορίσουν ότι τα οφέλη από τη χρήση του φαρμάκου υπερτερούν των πιθανών κινδύνων που δέχεται μια γυναίκα όταν το παίρνει. Ο κύριος από αυτούς τους κινδύνους μπορεί να είναι η καθυστέρηση της ανάπτυξης και η εξάρτηση του εμβρύου από το φάρμακο. Υπάρχει επίσης η πιθανότητα το έμβρυο να παρουσιάσει συμπτώματα στέρησης όταν η μητέρα του σταματήσει να παίρνει το φάρμακο.
Γενικά, οι γιατροί διστάζουν να συνταγογραφήσουν φάρμακα γενικά κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης. Αυτό οφείλεται στο γεγονός ότι είναι δύσκολο να γνωρίζουμε εάν ακόμη και μια ήπια φαρμακευτική αγωγή θα προκαλέσει εκ γενετής ελάττωμα ή με άλλο τρόπο θα επηρεάσει το έμβρυο με δυσμενή τρόπο. Ωστόσο, οι γιατροί συνταγογραφούν κωδεΐνη κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης, όταν κρίνουν ότι τα οφέλη για τη μέλλουσα μητέρα θα υπερτερούν των κινδύνων για το έμβρυο. Για παράδειγμα, εάν μια γυναίκα υποφέρει από μέτριο έως σοβαρό πόνο, ένας γιατρός μπορεί να συνταγογραφήσει κωδεΐνη για να τον ανακουφίσει. Σε ορισμένες περιπτώσεις, οι γιατροί συνταγογραφούν επίσης κωδεΐνη για να βοηθήσει στην καταστολή του βήχα.
Η ασφάλεια της κωδεΐνης κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης είναι αβέβαιη, επειδή δεν έχουν γίνει αρκετές ελεγχόμενες μελέτες για να καθοριστεί εάν αντιπροσωπεύει ή όχι σοβαρό κίνδυνο για ένα αναπτυσσόμενο μωρό. Η κύρια πιθανότητα κινδύνου για τη χρήση κωδεΐνης κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης φαίνεται να είναι η εξάρτηση. Η κωδεΐνη μπορεί να είναι εθιστική όχι μόνο για μια μέλλουσα μητέρα, αλλά και για το αναπτυσσόμενο μωρό της. Επιπλέον, υπάρχει η ανησυχία ότι η χρήση κωδεΐνης κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης μπορεί να οδηγήσει σε καθυστέρηση της ανάπτυξης του εμβρύου. Στην πραγματικότητα, η χρήση κωδεΐνης μπορεί να προκαλέσει ακόμη και συμπτώματα στέρησης σε ένα έμβρυο όταν η μέλλουσα μητέρα σταματήσει να τη παίρνει.
Εάν ένας γιατρός κρίνει ότι η ανάγκη της μέλλουσας μητέρας για θεραπεία υπερτερεί του κινδύνου λήψης κωδεΐνης κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης, μπορεί να της συνταγογραφήσει το φάρμακο, προσέχοντας τη δοσολογία. Στις περισσότερες περιπτώσεις, θα συνταγογραφήσει τη χαμηλότερη δόση που θα της ανακουφίσει από τον πόνο ή θα καταστείλει τον βήχα της. η χαμηλότερη δόση μπορεί να βοηθήσει στην ελαχιστοποίηση του κινδύνου για το μωρό. Μπορεί επίσης να της συστήσει να διακόψει τη χρήση του φαρμάκου μόλις τα συμπτώματά της υποχωρήσουν ή γίνουν πιο υποφερτά. Μόλις η μέλλουσα μητέρα γεννήσει, η χρήση κωδεΐνης μπορεί να είναι λιγότερο ανησυχητική. Αν και το φάρμακο μπορεί να περάσει μέσω του μητρικού γάλακτος, η χρήση κωδεΐνης κατά τη διάρκεια του θηλασμού δεν σχετίζεται με υψηλό επίπεδο κινδύνου.