Η μετάδοση του ιού των ανθρώπινων θηλωμάτων ή του ιού HPV μέσω του σάλιου εξακολουθεί να μελετάται από το 2011, αν και η μόλυνση από τον ιό HPV του στοματικού βλεννογόνου είναι πιθανή και εμπλέκεται σε καρκίνους του στόματος. Ο HPV είναι επίσης ύποπτος ότι προκαλεί καρκίνο του τραχήλου της μήτρας και του ανογεννητικού καρκίνου. Αν και μόνο το 10% των λοιμώξεων φαίνεται να περιλαμβάνει καρκινογόνα στελέχη του HPV, έως και το 75% των ενηλίκων εκτίθενται ή έχουν εκτεθεί στον ιό, ο οποίος συνήθως υποχωρεί από μόνος του. Αν και ο HPV είναι κοινός, μπορεί επίσης να προληφθεί.
Πλήρεις ιοί όπως η λύσσα, ο Epstein-Barr και η γρίπη εμφανίζονται σταθερά στο σάλιο. Ενώ αυτοί οι ιοί μπορούν να εξαπλωθούν μέσω της στοματικής έκθεσης από ένα δάγκωμα ή ένα φιλί, ο HPV έχει εμφανίσει ίχνη DNA με μεταβλητό ρυθμό. Κατά τη μελέτη της μετάδοσης του HPV μέσω του σάλιου, οι ερευνητές ανακάλυψαν ποσοστά ανίχνευσης χαμηλότερα από αυτά που βρίσκονται στον ιστό.
Ωστόσο, μια μελέτη του 2008 στην Ελλάδα διαπίστωσε ότι τα ποσοστά ανίχνευσης ήταν υψηλότερα σε εκείνους με αναποτελεσματικές αποκρίσεις του ανοσοποιητικού συστήματος. Τα αντισώματα και οι αντιμικροβιακές πρωτεΐνες που ονομάζονται λυζοσώματα υπάρχουν κανονικά στο σάλιο και επιτίθενται σε οποιονδήποτε εισβολέα, διατηρώντας την αντίστροφη μέτρηση των βακτηρίων και των ιών. Όσοι έχουν παθήσεις που προάγουν την ξηροστομία έχουν λιγότερο σάλιο και υψηλότερα επίπεδα μικροβίων στο στόμα τους. Επιπλέον, τα άτομα με εξασθενημένο ανοσοποιητικό σύστημα είναι πιο ευαίσθητα σε βακτήρια και ιούς που τα μολύνουν με αυτόν τον τρόπο, συμπεριλαμβανομένης της εξάπλωσης του HPV μέσω του σάλιου του ασθενούς.
Ο ιός συνήθως εξαπλώνεται μέσω της επαφής δέρμα με δέρμα, συνήθως κατά τη σεξουαλική δραστηριότητα. Ο βλεννογόνος στο στόμα και το στοματοφαρυγγικό σύμπλεγμα είναι πολύ παρόμοιος με αυτόν των γεννητικών οργάνων. Ο HPV16, το ίδιο στέλεχος που προκαλεί καρκίνο του τραχήλου της μήτρας, συνδέεται επίσης με τον καρκίνο του στόματος. Έχει αναπτυχθεί ένα εμβόλιο που στοχεύει τέσσερις τύπους HPV και συνιστάται να εμβολιάζονται γυναίκες και άνδρες ηλικίας 9-26 ετών πριν από οποιαδήποτε σεξουαλική επαφή. Το εμβόλιο έχει αποδειχθεί ότι αποτρέπει τη μόλυνση από τον HPV πριν από την έκθεση. Η πρώιμη σεξουαλική διαπαιδαγώγηση με στόχο την πρόληψη ασθενειών θα πρέπει να περιλαμβάνει τη δυνατότητα εξάπλωσης του HPV μέσω του σάλιου.
Ο HPV16 έχει επίσης βρεθεί σε νεότερους ανθρώπους των οποίων ο μόνος παράγοντας κινδύνου για καρκίνο του φάρυγγα είναι το στοματικό σεξ και όχι η μακροχρόνια χρήση καπνού ή αλκοόλ. Αυτό υποδηλώνει ότι ο HPV16 όντως μεταδίδεται μέσω της στοματικής-γεννητικής επαφής και έτσι μπορεί να συστέλλεται ή να περάσει μέσω των βλεννογόνων και των υγρών στο στόμα. Η εκπαίδευση με στόχο την πρόληψη ασθενειών θα πρέπει να περιλαμβάνει τη δυνατότητα εξάπλωσης του HPV. Η συνεπής χρήση προφυλακτικών από λάτεξ και άλλων συσκευών φραγμού που μπορούν να χρησιμοποιηθούν κατά τη διάρκεια του στοματικού σεξ, όπως τα οδοντιατρικά φράγματα, έχει αποδειχθεί ότι μειώνει τη μετάδοση του HPV μέσω της σεξουαλικής δραστηριότητας.