Pacjent może mieć nieprawidłowy test czynności wątroby z wielu powodów. Ogólnie, podwyższenie w tych testach laboratoryjnych jest spowodowane uszkodzeniem wątroby. Szereg infekcji, w tym wywołanych przez wirusy zapalenia wątroby, powoduje nieprawidłowe wyniki tych testów. Leki lub inne substancje toksyczne dla wątroby mogą również powodować nieprawidłowe wyniki. Choroby wywodzące się z wątroby, w tym niealkoholowe stłuszczeniowe zapalenie wątroby, mogą również powodować nieprawidłowe wyniki testów czynności wątroby.
Jednym z powodów nieprawidłowego testu czynności wątroby jest infekcja. Wirusy, w tym zapalenie wątroby typu A, zapalenie wątroby typu B, zapalenie wątroby typu C i zapalenie wątroby typu E, mogą powodować ostre lub przewlekłe zmiany w testach czynności wątroby. Z tego powodu u większości pacjentów z podwyższonymi testami wątrobowymi krew zostanie przebadana w celu wykrycia zakażenia tymi wirusami. Inne wirusy, w tym wirus Epsteina-Barra (EBV), wirus cytomegalii (CMV) i ludzki wirus niedoboru odporności (HIV) mogą uszkadzać wątrobę. Infekcje bakteryjne i infekcje pasożytnicze mogą również infekować wątrobę, ale wirusy częściej infekują ten narząd w porównaniu z innymi rodzajami patogenów.
Wiele różnych leków lub innych przyjmowanych substancji może powodować nieprawidłowe wyniki testu czynności wątroby. Alkohol jest bardzo toksyczny dla wątroby i często wpływa na zdolność wątroby do wykonywania swojej pracy. Leki, w tym paracetamol, leki z grupy statyn, metotreksat i środki chemioterapeutyczne są również częstymi przyczynami podwyższenia wyników tych testów. Nawet naturalne środki, w tym zioła i witaminy, mogą spowodować uszkodzenie wątroby. Z tego powodu lekarze badający przyczynę nieprawidłowego badania czynności wątroby muszą dokładnie wypytać pacjenta o wszelkie leki i inne substancje przyjmowane w ciągu ostatnich miesięcy.
Inne choroby wywodzące się z wątroby mogą również powodować nieprawidłowe wyniki testów czynności wątroby. Niealkoholowe stłuszczeniowe zapalenie wątroby (NASH) rozwija się u wielu pacjentów w związku z otyłością, cukrzycą lub podwyższonym poziomem cholesterolu we krwi, a stan ten powoduje łagodne podwyższenie wyników testów czynności wątroby. Jest to jedna z najczęstszych chorób wątroby, które powodują nieprawidłowe wyniki badań laboratoryjnych. Rzadsze choroby, takie jak choroba Wilsona, choroba alfa-1-antytrypsyny, hemochromatoza, autoimmunologiczne zapalenie wątroby i pierwotna marskość żółciowa wątroby mogą również powodować podwyższenie wyników tych testów. Często lekarze mogą sprawdzać te choroby po wykluczeniu innych, częstszych przyczyn nieprawidłowości w testach czynności wątroby.
Pacjenci, którzy są poważnie chorzy, mogą mieć nieprawidłowe wyniki testów czynności wątroby z innych powodów. Zmniejszony przepływ krwi do wątroby, spowodowany niewydolnością serca lub ciężką infekcją, powoduje drastyczny wzrost poziomu enzymów wątrobowych we krwi. Z tego powodu najlepiej sprawdzać czynność wątroby, gdy pacjent jest poza tym zdrowy, aby uniknąć odnotowania wzrostu, który występował tylko z powodu ostrej, ciężkiej choroby.