Najczęstszą przyczyną owrzodzeń jamy ustnej u dzieci jest niewłaściwa obsługa. Zmiany w jamie ustnej spowodowane przez używanie szczoteczki do zębów, gryzienie w policzek lub inne tego typu działania określane są mianem owrzodzeń urazowych. Nawracające owrzodzenia jamy ustnej u dzieci mogą być również wynikiem infekcji wirusowych lub bakteryjnych. Te wrzody są spowodowane przez różne organizmy, w tym wirusy Coxsackie i herpes simplex. W przypadku, gdy owrzodzenie jamy ustnej u dzieci jest spowodowane infekcjami jamy ustnej, zaleca się podjęcie natychmiastowego leczenia, aby zapobiec ewentualnym powikłaniom.
Dzieci często cierpią na traumatyczne wrzody po prostu dlatego, że nie są przyzwyczajone do odpowiedniej pielęgnacji jamy ustnej. Bardzo często zdarza się, że bardzo małe dzieci ranią dziąsła lub policzki w wyniku zbyt intensywnego mycia zębów. Podobnie dzieci mogą przypadkowo przygryźć własne języki, policzki i usta podczas żucia lub mówienia, a nawet podczas brutalnej zabawy. Uszkodzenie może czasami przekształcić się w otwarte rany, które powodują dyskomfort. Na szczęście częstość występowania urazowych owrzodzeń jamy ustnej u dzieci maleje wraz z wiekiem dzieci i uzyskuje się lepszą kontrolę motoryczną wokół ust.
Z drugiej strony nawracające owrzodzenia jamy ustnej u dzieci są zwykle wynikiem infekcji jamy ustnej. Na przykład nagromadzenie płytki bakteryjnej może prowadzić do zapalenia dziąseł i owrzodzeń dziąseł. Infekcja wirusem Coxsackie może powodować powstawanie małych czerwonych zmian w jamie ustnej, dłoniach i innych zakażonych obszarach; ten stan jest powszechnie znany jako choroba dłoni, stóp i jamy ustnej. W rzadkich przypadkach owrzodzenie jamy ustnej jest wynikiem zakażenia wirusem opryszczki pospolitej. Niedobory witamin i stany osłabiające układ odpornościowy narażają dzieci na większe ryzyko infekcji.
Owrzodzenia jamy ustnej spowodowane przez infekcje są zwykle leczone kombinacją leków i środków zapobiegawczych. Chociaż leki na owrzodzenie jamy ustnej są na ogół wystarczające do wyeliminowania objawów, zmiany mogą powrócić, jeśli dziecko nie zostanie nauczone, jak unikać infekcji. Ogólne wskazówki dotyczące czystości, takie jak unikanie wkładania ręki do ust po dotknięciu brudnych przedmiotów, są tak samo ważne jak samo leczenie. Niezwykle ważne jest również natychmiastowe leczenie, jeśli przyczyną owrzodzeń jamy ustnej u dzieci jest poważniejszy stan, taki jak zakażenie wirusem opryszczki lub poważnie osłabiony układ odpornościowy. Niekontrolowane infekcje te mogą rozprzestrzenić się poza jamę ustną i prowadzić do powikłań medycznych z konsekwencjami na całe życie dla dziecka.