Pseudomonas putida to rodzaj bakterii Gram-ujemnych powszechnie występujących w wodzie i glebie, szczególnie wokół korzeni roślin. Może chronić rośliny przed chorobami przed innymi mikroorganizmami. Jego metabolizm jest bardzo złożony, a bakterie mogą rozkładać wiele różnych zanieczyszczeń organicznych. Wykorzystanie go do tego celu ma interes handlowy. Zwykle bakterie są uważane za bezpieczne, ale jest kilka przypadków, w których spowodowały chorobę u osób z osłabionym układem odpornościowym.
Zanieczyszczenia, które wcześniej uważano za nieulegające biodegradacji, takie jak Styrofoam™, okazały się być rozkładane przez ten organizm. Ze względu na biologiczne i chemiczne zastosowania tych bakterii sekwencjonowano sekwencje DNA wielu szczepów. Są one blisko spokrewnione z Pseudomonas aeruginosa, oportunistycznym patogenem człowieka. Poprzez sekwencjonowanie odkryto, że Pseudomonas putida brakowało kluczowych genów, które Pseudomonas aeruginosa wykorzystuje do wywoływania chorób u ludzi. Na przykład nie może degradować błon komórkowych ani uwalniać toksyn.
W nielicznych przypadkach, w których Pseudomonas putida okazała się być patogenna u ludzi, dotyczyła ona już chorych. Inną wspólną cechą było to, że bakterie zostały wprowadzone na coś, co miało być sterylne. Na przykład w jednym przypadku roztwór przeciwmgielny został skażony bakteriami. W innych, niesterylne cewniki lub podobne urządzenia były wprowadzane do osoby, która niedawno przyjmowała antybiotyki.
W organizmie Pseudomonas putida może powodować infekcje ogólnoustrojowe, takie jak bakteriemia – infekcja krwi. Zapalenie płuc lub zapalenie otrzewnej to poważne choroby, które może wywołać ten czynnik bakteryjny. Może również powodować bardziej zlokalizowane infekcje, takie jak zapalenie zatok lub infekcje dróg moczowych.
Ogólnie rzecz biorąc, Pseudomonas putida została wyznaczona jako bezpieczna bakteria do użycia w klonowaniu genów do prac bioremediacyjnych. Wiąże się to z ogólnoustrojowym wykorzystaniem organizmu do degradacji zanieczyszczeń w wodzie lub glebie. Bakterie te mają bardzo wszechstronny metabolizm i mogą degradować szereg toksycznych chemikaliów, w tym składniki benzyny. Inne szczepy mogą przekształcać orzeszki ziemne wykonane z pianki polistyrenowej w biodegradowalny plastik. Prowadzonych jest wiele badań nad zdolnościami degradacyjnymi tego organizmu.
Pseudomonas putida jest również ważna w utrzymaniu zdrowia roślin. Zamieszkuje większość gleb i łączy się z korzeniami roślin, gdzie często poprawia zdrowotność roślin. Organizm wytwarza również molekuły, które sekwestrują żelazo z obszaru wokół rośliny. Pozbawia to grzyby i inne bakterie niezbędnego składnika odżywczego, ograniczając ich wzrost. W ten sposób może wpływać na biologiczną kontrolę niektórych patogenów roślin.
Istnieje wiele dróg badawczych, które wykorzystują Pseudomonas putida do inżynierii genetycznej. Wytwarzane są rekombinowane bakterie, które rozkładają określone zanieczyszczenia i dostarczają biopestycydy do korzeni roślin. Są one również wykorzystywane do ekspresji genów Pseudomonas aeruginosa, które mogą być zaangażowane w wywoływanie chorób u ludzi. Naukowcy wolą przeprowadzać takie eksperymenty na Pseudomonas putida, ponieważ jest wysoce nieprawdopodobne, aby wywołać chorobę u ludzi w porównaniu z Pseudomonas aeruginosa.