USS Thresher to amerykański okręt podwodny, który zaginął w 1963 roku podczas ćwiczeń nurkowych. Los USS Thresher wywołał szereg obaw dotyczących bezpieczeństwa okrętów podwodnych z napędem jądrowym i skłonił Marynarkę Wojenną Stanów Zjednoczonych do ustanowienia programu bezpieczeństwa w celu zapewnienia lepszego szkolenia i reagowania na katastrofy. Program ten, znany jako SUBSAFE, zapewnia kontrolę jakości i gwarancje bezpieczeństwa dla całej floty jądrowej.
Ten okręt podwodny był okrętem wiodącym w swojej klasie, co oznacza, że był pierwszym, który został zbudowany zgodnie z nowym zestawem specyfikacji. Numer kadłuba USS Thresher wynosił 593, a technicznie okręty podwodne zbudowane po USS Thresher powinny być znane jako okręty podwodne klasy Thresher lub 593, ale zamiast tego są określane jako okręty podwodne klasy Permit lub 594, po drugim statku w klasie, ze względu na do przesądów o odwoływaniu się do statków, które zaginęły na morzu. Klasa Permit została zastąpiona kolejnymi nowymi modelami atomowych okrętów podwodnych.
Oficjalnie oddany do użytku w 1961 roku, USS Thresher przeszedł intensywne próby morskie przez kapitana i załogę. Okręt podwodny napotkał kilka drobnych problemów w okresie prób morskich, w tym problemy ze zbiornikami balastowymi i reaktorem jądrowym. Gdy próby morskie zostały ostatecznie zakończone, USS Thresher został wypuszczony na morze u wybrzeży Massachusetts na szkolenie w zakresie nurkowania na głębokich wodach, w towarzystwie USS Skylark, okrętu ratunkowego dla łodzi podwodnych, 9 kwietnia 1963 roku.
USS Thresher zanurzył się na oczekiwaną głębokość, a następnie zgłosił, że ma problemy i próbuje wynurzyć się. Raport był zniekształcony, ao łodzi podwodnej nigdy więcej nie słyszano. USS Skylark zgłosił zaginięcie statku i podjęto próbę zidentyfikowania wraku i ustalenia, czy reaktor przeciekał. USS Thresher zatonął w wodach wystarczająco głębokich, by spowodować implozję statku pod ciśnieniem, zabijając 129 marynarzy na pokładzie w mniej niż dwie sekundy i rozrzucając statek po dnie oceanu na sześć kawałków. Rutynowe badania radiologiczne nie wykazały oznak, że paliwo jądrowe statku skaziło ten obszar.
Badania nad losem USS Thresher zdają się sugerować, że statek zatonął z powodu awarii systemu rurociągów ze słoną wodą, co ostatecznie doprowadziło do zalania okrętu podwodnego, wyłączając reaktor jądrowy. Zanim załoga łodzi podwodnej zdołała ponownie uruchomić reaktor, statek zatonął. Odzyskanie wraku USS Thresher nie było możliwe ze względu na głębokość zatonięcia i obawy o skażenie nuklearne, a kilka pomników ku czci statku i jego załogi znajduje się w różnych miejscach w Stanach Zjednoczonych, w tym na Narodowym Cmentarzu w Arlington.