Wybór najlepszego pieczywa pumpernikiel jest w dużej mierze kwestią osobistego gustu. Istnieje kilka różnych rodzajów chleba, które można kupić lub wypiekać, więc wybór czasami opiera się na rodzaju o najbardziej znanych smakach. Inną kwestią jest sposób wykorzystania chleba, ponieważ jego smak może wahać się od słodkiego i lekkiego do gęstego i lekko pikantnego. Tekstura chleba może być również bardzo różna, w zależności od zakupionego rodzaju, przy czym autentyczna niemiecka odmiana ma bardzo kruchą, suchą konsystencję, w przeciwieństwie do chleba bardziej przyjaznego dla piekarni, z bardziej gąbczastym wrażeniem. Dodatkowe składniki smakowe w bochenku pumpernikla również mogą pomóc w podjęciu decyzji, który smakuje najlepiej, ponieważ niektóre zawierają kminek lub koper włoski, podczas gdy inne mają w środku kawę lub pieczoną bułkę tartą.
Jedna odrębna wersja chleba pumpernikiel jest znana jako niemiecki pumpernikiel i jest potencjalnie jednym z najwcześniejszych znanych rodzajów chleba. Powstaje z mąki żytniej, która zawiera całe lub popękane jagody żytnie wraz z melasą. Użyty środek spulchniający to starter zakwasu, który nadaje pieczywu bardziej sfermentowany smak. Ciasto umieszcza się w kwadratowej brytfannie i piecze w piekarniku przez prawie cały dzień, w niektórych przypadkach, nadając mu gęsty, zwarty miękisz i lekko suchość. Ten chleb najlepiej wybrać, gdy potrzebna jest baza do wilgotnych składników, takich jak pasty do smarowania lub peklowane owoce morza, takie jak wędzony łosoś.
Inną wersję chleba pumpernikiel można zrobić w sposób bardziej zbliżony do standardowego bochenka żytniego, przy czym mąkę żytnią miesza się z mąką pszenną lub uniwersalną, dzięki czemu w cieście są dłuższe, bardziej sprężyste pasma glutenu. Ciemnobrązowy kolor chleba uzyskuje się nie poprzez długie pieczenie, ale poprzez użycie ciemnych składników barwiących, takich jak kakao, melasa, kawa czy czekolada. Te bochenki są formowane w okrągłe bochenki zamiast kwadratowych w stylu niemieckim i pieczone podobnie jak zwykły chleb. Ten rodzaj pumpernikla najlepiej nadaje się do kanapek lub tostów, ponieważ zawiera więcej wilgoci i bardziej miękką konsystencję niż odmiana niemiecka.
W obu przypadkach chleb z pumperniklem powinien wydawać się cięższy niż inne rodzaje chleba, co oznacza, że zawiera więcej żyta niż mąki pszennej. Dodatek kminku lub nasion kopru włoskiego jest tradycyjny, ale dla tych, którym smak nasion jest nieprzyjemny, można znaleźć zwykłe bochenki. Inne składniki to suszone owoce i orzechy, podkreślające słodycz chleba. Niektóre rodzaje chleba pumpernikiel produkowanego na skalę przemysłową zawierają dużą ilość sztucznych barwników i słodzików, co nadaje im smak wyraźnie różniący się od pieczywa wykorzystującego bardziej konwencjonalne składniki.