Tymczasowa ileostomia służy do odwrócenia treści jelitowej od odcinka jelita, który mógł wymagać wygojenia po operacji, na przykład w celu usunięcia raka. Część jelita cienkiego lub jelita krętego zostanie wyciągnięta na powierzchnię i otwarta na skórę przez otwór zwany stomią, umożliwiając zebranie odpadów w worku. Kiedy nadejdzie czas na ponowne połączenie jelita, procedura będzie się różnić w zależności od typu ileostomii, która została pierwotnie utworzona. Proste usunięcie ileostomii pętlowej może obejmować odcięcie dwóch otwartych końców jelita od skóry, zszycie ich z powrotem i umieszczenie ich z powrotem w jamie brzusznej. Wyjęcie końcowej ileostomii jest bardziej skomplikowane, ponieważ po odłączeniu jednego kawałka jelita od stomii należy go połączyć z kawałkiem jelita, który znajduje się w jamie brzusznej, co wymaga wykonania nacięcia brzucha lub operacji dziurki od klucza.
W przypadku pacjentów, u których wykonano ileostomię pętlową, pętla jelita cienkiego zostanie wyciągnięta przez otwór w jamie brzusznej i przecięta na pół, pozostawiając dwa odcięte końce wychodzące przez stomię. Procedura usunięcia ileostomii może być przeprowadzona tylko wtedy, gdy jelito całkowicie się zagoi, a mięśnie zwieracza, które kontrolują wydalanie kału z organizmu, funkcjonują prawidłowo. Pacjenci mogą ćwiczyć ćwiczenia wzmacniające mięśnie zwieracza odbytu w tygodniach poprzedzających operację. Aby umożliwić ustabilizowanie się obrzęku i blizny, usunięcie ileostomii zwykle nie może być wykonane przed upływem około dziewięciu tygodni od pierwotnej operacji.
Do wykonania faktycznego usunięcia ileostomii potrzeba mniej niż godziny, ale może być wymagany pobyt w szpitalu do pięciu dni. Zazwyczaj na dzień przed operacją dozwolone są tylko płyny, a po północy w ogóle nic. Chirurg przecina skórę i brzuch, wykonując okrągłe nacięcie, które biegnie dookoła stomii. Oba końce jelita są następnie zszywane lub zszywane i umieszczane z powrotem w jamie brzusznej, z niewielką raną na skórze brzucha. Po zabiegu normalne jest, że na początku tylko płyny i powoli przechodzi do postaci stałych w dniu po zabiegu.
Pacjenci, którzy przeszli ileostomię końcową, zazwyczaj muszą spędzić w szpitalu większą liczbę dni, być może do dziesięciu, a powrót do zdrowia trwa zwykle dłużej. Operacja usunięcia ileostomii może obejmować ponowne otwarcie nacięcia brzucha z pierwotnej operacji, aby dotrzeć do jednego końca jelita. Można go następnie połączyć z drugim końcem jelita, który został odłączony od stomii. Czasami końcową ileostomię można odwrócić za pomocą laparoskopowych technik chirurgicznych.