Struktura organizacyjna uczelni odnosi się do hierarchii, poprzez którą realizowane jest delegowanie odpowiedzialności. Daje to pracownikom i studentom poczucie, kto odpowiada komu i do kogo należy się zwrócić w przypadku pojawienia się problemu. Specyficzna struktura organizacyjna uczelni może się różnić w zależności od instytucji, chociaż w większości przypadków szczebel kierowniczy jest najwyższym szczeblem drabiny organizacyjnej. Ten poziom obejmuje rektora kolegium lub uniwersytetu, a także kanclerza, jeśli taki istnieje, oraz radę dyrektorów, jeśli istnieją. Inne stanowiska na tym szczeblu obejmują skarbników i proboszczów, a także wiceprezesa lub wiceprezesów.
Chociaż w większości przypadków na uczelni lub na uniwersytecie istnieje tylko jeden rektor, w strukturze organizacyjnej uczelni może istnieć kilku wiceprezesów. Wiceprezesi mogą odpowiadać za różnorodne zadania na mniejszych uczelniach, podczas gdy na znacznie większych uczelniach mogą zajmować się tylko jednym lub dwoma konkretnymi obszarami funkcjonowania uczelni. Na przykład wiceprezes do spraw studenckich będzie zajmował się przede wszystkim działalnością studencką, problemami, osiągnięciami i sprawami budżetowymi. Wiceprezes ds. finansów będzie zajmował się wyłącznie finansami uczelni, a jego jurysdykcja może obejmować wszystkie wydziały uczelni.
Dziekani akademiccy są kierownikami różnych wydziałów w strukturze organizacyjnej uczelni. Na przykład wydział anglistyki będzie miał dziekana, który zasadniczo zarządza lub w inny sposób nadzoruje wszystkie funkcje tego wydziału. Dziekan ds. nauk przyrodniczych będzie kierował konkretnym wydziałem nauk ścisłych na uczelni, a dziekan medycyny będzie nadzorował wszelkie kierunki medyczne oferowane przez uczelnię. Dziekan może zajmować inne stanowiska w strukturze uczelni, choć nie jest to powszechne w niektórych szkołach. Programy mogą również mieć zastępców dziekanów, którzy odpowiadają dziekanowi; osoby te są odpowiedzialne za pomoc w prowadzeniu działu i rozwiązywanie wszelkich konkretnych problemów stojących przed działem.
Struktura organizacyjna uniwersytetu może się stamtąd rozgałęziać, obejmując inne programy, takie jak programy sportowe, utrzymanie ziemi, samorząd studencki, wydziały mieszkaniowe i wiele innych. Konkretne miejsce w hierarchii tych stanowisk może różnić się w zależności od określonych priorytetów uczelni. W wielu przypadkach może nastąpić reorganizacja w celu zmiany priorytetów struktury, tak aby fundusze były odpowiednio alokowane i staż pracy był odpowiednio traktowany. Restrukturyzacja organizacyjna może być trudna i stresująca dla wszystkich członków struktury uniwersyteckiej, dlatego często najlepiej jest znaleźć system, który działa i trzymać się go.