Związek między bezpieczeństwem komputera a prywatnością polega na tym, że odpowiednie bezpieczeństwo komputera lub jego brak jest wyznacznikiem poziomu prywatności, jakiego może oczekiwać użytkownik komputera. Komputery stały się istotną częścią współczesnego życia. Ludzie używają komputerów do wykonywania wielu zadań, w tym biznesu, bankowości, spotkań towarzyskich i przechowywania prywatnych informacji. Jeśli dojdzie do naruszenia bezpieczeństwa komputera, będzie to miało negatywny wpływ na sposób wykonywania tego typu zadań. Bezpieczeństwo komputera i prywatność odnosi się również do nieautoryzowanego monitorowania działań ludzi na komputerze.
W obszarze e-Commerce kwestia bezpieczeństwa komputerowego i prywatności będzie decydować o poziomie zaufania pomiędzy stronami biznesowymi. Jeśli istnieje jakiekolwiek podejrzenie naruszenia bezpieczeństwa po którejkolwiek ze stron, doprowadzi to do zniszczenia zaufania i zakończenia relacji biznesowych. Obejmuje to ryzyko i zagrożenia ze strony osób trzecich, nawet niezwiązanych z partnerami biznesowymi.
Przykładem może być klient, który zamówił książki w firmie sprzedającej publikacje online. Jeśli klient odkryje, że informacje wprowadzone podczas zamawiania książek zostały wykorzystane do innych celów bez jego zgody, spowoduje to zerwanie zaufania klienta do firmy. Może nawet nie mieć znaczenia, czy witryna internetowa została zhakowana przez osobę trzecią, ponieważ szkody już zostałyby wyrządzone. Klient poczuje, że jego prywatność została naruszona i trudno będzie mu ponownie zaufać firmie.
Innym obszarem bezpieczeństwa komputerowego i prywatności są nieautoryzowane narzędzia, takie jak oprogramowanie szpiegujące i śledzące pliki cookie, używane do szpiegowania działań osób na komputerze. Wkraczają one w prywatność ludzi, monitorując, jak i kiedy korzystają z komputera, a następnie wysyłając zebrane informacje do zdalnego obserwatora. Niektórzy marketerzy robią to w ramach zbierania danych w celach marketingowych. Inni robią to z zamiarem poznania upodobań i niechęci użytkownika Internetu, aby wysyłać reklamy specjalnie dostosowane do użytkownika. Wysyłanie niechcianych wiadomości e-mail stanowi problem w zakresie bezpieczeństwa komputera i prywatności. Takie wiadomości e-mail są nie tylko niepożądane, ale często zawierają łącza, które po kliknięciu na komputer danej osoby mogą zainfekować komputer różnymi typami wirusów.