Głównymi czynnikami determinującymi dawkowanie hydrokortyzonu są rodzaj i ciężkość leczonej choroby oraz wielkość pacjenta. Im większy rozmiar pacjenta, tym więcej leku będzie potrzebne do wytworzenia pożądanego poziomu we krwi. W konsekwencji dorosłym przepisuje się znacznie większe dawki niż dzieciom. Dawkowanie różni się sposobem podawania, a także wielkością. Ostre, zagrażające życiu schorzenia będą wymagały wstrzyknięcia domięśniowego lub dożylnego, podczas gdy choroby nieostre można leczyć dawką doustną. W leczeniu chorób skóry można go również stosować miejscowo w kremie lub maści hydrokortyzonowej, a w celu złagodzenia zapalenia okrężnicy można go podawać doodbytniczo w postaci zawiesiny.
Jednym z warunków, w których stosuje się ten lek, jest niewydolność kory nadnerczy, czyli niewydolność nadnerczy w wytwarzaniu wystarczającej ilości hormonów steroidowych. Dawka hydrokortyzonu dla dorosłych wynosi 100 mg dożylnie, a następnie 300 mg na dobę w podzielonych ilościach lub jako 48-godzinny wlew. Gdy stan dorosłego pacjenta poprawi się, dawka zmieni się na doustną, 50 mg trzy razy na dobę, a następnie zmniejszy się do 30 do 50 mg raz na dobę. Małe dzieci z tym schorzeniem będą początkowo otrzymywały dożylnie od 1 do 2 miligramów/kilogram (mg/kg), a później dawka zostanie zmniejszona do 25 do 100 mg na dobę w podzielonych ilościach. Starsze dzieci otrzymają początkowo zastrzyk hydrokortyzonu, a następnie przepisano doustną dawkę od 30 do 50 mg dziennie w podzielonych ilościach.
Dawkę hydrokortyzonu dla dorosłych na zapalenie można podawać dożylnie, domięśniowo lub doustnie. Zwykle przepisuje się od 15 do 240 mg na dobę. Dawki doustne zalecane dla małych dzieci z zapaleniem wynoszą od 2.5 do 10 mg/kg dziennie w podzielonych ilościach. Dawki dożylne lub domięśniowe dla tej grupy wiekowej wynoszą zazwyczaj 1 do 5 mg/kg dziennie. Dawka przeciwzapalna dla starszych dzieci to podanie doustne, domięśniowe lub dożylne od 15 do 240 mg dwa razy dziennie.
Inną chorobą, w leczeniu której stosuje się ten lek, jest wstrząs, który jest stanem nagłym wynikającym z niedostatecznego przepływu krwi w organizmie. Typowa dawka hydrokortyzonu dla dorosłych wynosi 500 mg do 2 gramów (g) podawana dożylnie, cztery do 12 razy dziennie. Dzieciom we wstrząsie podaje się dożylnie dwie początkowe dawki 50 mg/kg w odstępie czterech godzin. W razie potrzeby dawkę dla dzieci zmniejsza się później do jednego razu na dobę. Młodzieży we wstrząsie przepisuje się od 500 mg do 2 g, cztery do 12 razy dziennie.
Astmę, która jest chorobą dróg oddechowych, można leczyć hydrokortyzonem. Dawka hydrokortyzonu dla dorosłych wynosi zwykle od 100 do 500 mg dożylnie, cztery razy dziennie. Leczenie dzieci z ostrą astmą może obejmować dawkę nasycającą od 4 do 8 mg/kg dożylnie. Dawka podtrzymująca dla dziecka wynosi 2 mg/kg, cztery razy dziennie.
Ten lek może złagodzić wrzodziejące zapalenie jelita grubego, stan zapalny dotyczący jelita grubego. Dawka hydrokortyzonu dla dorosłych to zwykle podawanie 100 mg zawiesiny doodbytniczej co noc przez 21 dni. Ciężkie przypadki choroby mogą wymagać od dwóch do trzech miesięcy leczenia. Jeśli czas trwania tej terapii jest dłuższy niż 21 dni, należy ją odstawić powoli, zmniejszając dawkę hydrokortyzonu do raz na 48 godzin przez okres od dwóch do trzech tygodni.