Skutki ćwiczeń są zarówno krótko-, jak i długoterminowe i mogą być zarówno fizjologiczne, jak i psychologiczne. Fizjologiczne efekty ćwiczeń obejmują wpływ na mięśnie, kości, stawy oraz układ sercowo-naczyniowy i oddechowy. W większości przypadków efekty te są pozytywne i pożądane, ale czasami forsowne ćwiczenia mogą mieć negatywny wpływ. Psychologiczne skutki ćwiczeń są zwykle powiązane z redukcją stresu i podniesieniem nastroju, a wielu z nich wykorzystuje ćwiczenia do zwalczania przewlekłego lęku i depresji.
Osoby cierpiące na choroby serca mogą poprawić zdrowie układu krążenia i zmniejszyć ryzyko wystąpienia przyszłych powikłań poprzez zwiększenie aktywności. Podobnie jak inne mięśnie ciała, serce staje się silniejsze dzięki ćwiczeniom, które pozwalają mu wydajniej pompować krew. Ci, którzy ćwiczą, mają zazwyczaj niższe tętno, ponieważ silniejsze serce nie musi pracować tak ciężko, ponieważ z każdym uderzeniem serca pompowana jest większa ilość krwi.
Stawy również mają pozytywny wpływ, ponieważ ruch zapobiega usztywnieniu i wzmacnia tkanki otaczające stawy, a ćwiczenia poprawiają równowagę i koordynację, zmniejszając w ten sposób ryzyko upadków i złamań. Układ oddechowy również korzysta z regularnych ćwiczeń. Ciało reaguje na wysiłek zwiększając tempo oddychania. To dostarcza mięśniom energii potrzebnej do funkcjonowania i redukuje dwutlenek węgla. Długofalowym efektem tego jest zwiększona efektywność wykorzystania tlenu.
Chociaż poważna depresja powinna być najpierw leczona przez lekarza, ćwiczenia również okazały się skutecznym sposobem na zmniejszenie objawów związanych z lękiem i depresją. Coraz częściej lekarze przepisują ćwiczenia oprócz innych metod redukcji stresu. Kilka fizjologicznych skutków ćwiczeń, które są powiązane ze zmniejszeniem lęku, to zmniejszenie częstości akcji serca, napięcia mięśni i hormonów stresu. Uważa się, że psychologiczne skutki ćwiczeń związanych z depresją są powiązane ze zmianami neuroprzekaźników w mózgu, takich jak adrenalina, endorfiny i serotonina.
Ćwiczenia zwykle mają pozytywny wpływ, ale niektóre okoliczności mogą skutkować kontuzją. Silne ćwiczenia aerobowe, takie jak bieganie, są zwykle winowajcą w takich przypadkach. Ciągły, wstrząsający ruch stóp uderzających o chodnik może spowodować urazy kostek, kolan i pleców. Aby zmniejszyć ryzyko kontuzji, należy nosić odpowiednie obuwie amortyzujące, rozciągać się przed i po treningu, urozmaicać treningi i łączyć trening siłowy z ćwiczeniami aerobowymi. Trening siłowy jest ważny, ponieważ silniejsze mięśnie pomagają ciału lepiej kontrolować ruch.