Typowe leczenie toksoplazmozy to sześciotygodniowy cykl leków przeciwmalarycznych i antybiotyków, a różne terapie obejmują jedynie różne leki. Większość osób ze zdrowym układem odpornościowym nie wie, że jest zarażona toksoplazmozą, ponieważ infekcja nie powoduje żadnych objawów choroby. Jeśli dana osoba zachoruje na toksoplazmozę, rozwiną się u niej objawy grypopodobne. Kobiety w ciąży są bardziej narażone na wystąpienie objawów toksoplazmozy i powinny być badane w przypadku podejrzenia infekcji. Toksoplazmoza wrodzona może skutkować komplikacjami u nienarodzonego dziecka, dlatego przyszła mama zwykle rozpoczyna leczenie antybiotykami.
To, które leczenie toksoplazmozą zostanie przepisane, zależy od tego, czy infekcja jest ostra czy utajona. Oba typy wymagają użycia środków przeciwmalarycznych i antybiotyków w celu zniszczenia patogenu odpowiedzialnego za wywołanie infekcji. Ostra toksoplazmoza odnosi się do nowej infekcji i jest zwykle leczona kombinacją pirmetaminy i sulfadiazyny. Kobiety w ciąży są leczone antybiotykiem zwanym spirmycyną, a stosowanie tego antybiotyku zapobiega przedostawaniu się infekcji do dziecka w macicy. Po urodzeniu dziecka można przeprowadzić testy w celu ustalenia, czy ma ono aktywną infekcję, a jeśli wynik testu u dziecka będzie pozytywny, rozpocznie się trzytygodniowy cykl pirmetaminy i sulfadiazyny.
Pirmetamina przeciwmalaryczna może narastać do toksycznego poziomu we krwi, gdy jest przyjmowana w dużych ilościach przez długi czas, więc większości ludzi przepisuje się kwas folinowy, aby zapobiec rozwojowi toksyczności krwi. Pirmetamina może również blokować wchłanianie kwasu foliowego i innych witamin z grupy B, więc lekarze przepisują ten sam kwas folinowy, który jest stosowany w celu zapobiegania toksyczności, aby pomóc w uzupełnieniu poziomu kwasu foliowego w organizmie. Często potrzebne są dwie rundy tych leków, z dwutygodniowym odpoczynkiem od leków między fazami leczenia. Schemat leczenia toksoplazmozy jest prawie uniwersalny dla wszystkich pacjentów i zwykle jest skuteczny w eliminowaniu infekcji.
Leczenie toksoplazmozy może trwać nawet 12 tygodni leczenia. Jeśli infekcja jest oporna na standardowe leki przeciwmalaryczne i antybiotyki, staje się infekcją utajoną i konieczne jest dalsze leczenie. Leki te są czasami przepisywane pacjentom z obniżoną odpornością jako pierwsza linia leczenia toksoplazmozy. Atowakwon i klindamycyna to dwa antybiotyki, które są stosowane do zabijania torbieli toksoplazmozy, gdy inne antybiotyki zawodzą. Lekarze są w stanie skutecznie leczyć toksoplazmozę przez większość czasu bez żadnych trwałych konsekwencji, ale niektóre dzieci zakażone przed urodzeniem mogą urodzić się z łagodnymi powikłaniami wynikającymi z zakażenia.