Na liście zagrożonych gatunków znajduje się wiele różnych gatunków zwierząt morskich z wielu różnych powodów. Często wpływ człowieka, taki jak wypadki na łodziach, rybołówstwo, rozwój wybrzeży i zanieczyszczenie, przypisuje dużą liczbę zgonów wśród tych zwierząt morskich. Czasami przyczyny zmniejszenia liczebności są nieznane. Ssaki morskie, takie jak wieloryby, manaty i diugonie, znacznie spadły, podobnie jak żółwie, niektóre ptaki morskie, rekiny i łososie.
Wiele zgonów zwierząt morskich wynika z wpływu człowieka. Zagrożenie dla ludzi wiąże się nie tylko z rybołówstwem, polowaniem i wielorybnictwem, ale także z wypadkami łodzi. Jest to szczególnie powszechne wśród płytko pływających zwierząt, które oddychają powietrzem, takich jak różnego rodzaju ssaki morskie i żółwie. Zanieczyszczenie może również dodać do listy zagrożonych zwierząt morskich.
Wiele gatunków żółwi morskich jest zagrożonych. Zjawisko to często wynika z niebezpieczeństwa, jakie stwarzają jaja zwierząt. Jaja żółwi składane są na lądzie, który często jest niszczony przez zabudowę miejską w pobliżu wybrzeży. Nadmorskie kurorty i obszary turystyczne stanowią zagrożenie dla wielu gatunków zwierząt morskich.
Wieloryby należą do najbardziej zagrożonych zwierząt morskich. W szczególności wieloryby i wieloryby grenlandzkie odnotowały dramatyczny spadek liczebności i stanęły w obliczu krytycznego zagrożenia. Liczba wielorybów prawosawów północnoatlantyckich drastycznie spadła z nieznanych przyczyn, ale podejrzewa się, że nie spowodował tego sam wieloryb. Może to być wynikiem kolizji łodzi, zanieczyszczenia lub problemów z reprodukcją wśród zwierząt.
Uważa się, że przyczyną spadku liczby manatów i diugonów jest duża liczba śmiertelnych kolizji łodzi. Ze względu na szarawe ubarwienie tych zwierząt ludzie na łodziach mają trudności z ich dostrzeżeniem. Ponadto manaty i diugonie poruszają się bardzo wolno i mogą mieć trudności z ucieczką z szybko płynącej łodzi. Wśród takich zwierząt odnotowano dużą liczbę zgonów prenatalnych z przyczyn nieznanych biologom.
Zagrożone zostały różne gatunki ptaków morskich, w tym pelikan brunatny. Ten ptak, niegdyś powszechnie spotykany w Ameryce Północnej, Środkowej i Południowej, miał do czynienia z dużą liczbą zgonów z powodu zmiażdżenia jaj podczas inkubacji. Uważa się, że skorupki jaj tych ptaków stały się niebezpiecznie cienkie z powodu zastosowania dichlorodifenylotrichloroetanu (DDT). Od końca XX wieku wiele form DDT zostało zakazanych w Stanach Zjednoczonych.
Pingwiny znalazły się również na liście zagrożonych zwierząt morskich. W wyniku przełowienia zapasy żywności dla pingwina Humboldta, występującego w Chile i Peru, znacznie się zmniejszyły. Wiele zgonów wśród tych pingwinów przypisuje się również zaplątaniu się w sieci rybackie.
Łosoś, choć często uważany za rybę słodkowodną, jest również uważany za część listy zagrożonych zwierząt morskich. Te ryby pojawiają się w słodkiej wodzie, ale wypływają tam, gdzie rzeki i strumienie spotykają się z morzem. Spadek jakości wody w wyniku zanieczyszczenia zmniejszył liczebność łososia. Obiekty gospodarki wodnej, takie jak tamy, również niekorzystnie wpłynęły na tarło łososia.