Męski i żeński układ rozrodczy ewoluowały dla różnych specjalności, ale w tym samym celu: produkowaniu dzieci. Cały układ rozrodczy kobiety znajduje się wewnątrz ciała, podczas gdy większość układu rozrodczego mężczyzny znajduje się poza ciałem. Funkcjonalna różnica między tymi dwoma systemami polega na tym, że system kobiecy jest przeznaczony do pielęgnacji dziecka, gdy rośnie ono na tyle, aby przeżyć na świecie, a system męski to system dostarczania nasienia. Poszczególne komponenty systemów również się różnią.
Układ rozrodczy u kobiet jest całkowicie wewnętrzny, z punktami wyjścia i wejścia w pochwie. Jedną z najbardziej zauważalnych różnic między mężczyznami i kobietami są męskie narządy płciowe na zewnątrz ciała. Niższe temperatury środowiska zewnętrznego pomagają utrzymać plemniki w zdrowiu i zapobiegają uszkodzeniom spowodowanym przez ciepło znajdujące się w organizmie.
Kobieta ma oddzielne otwory na mocz, menstruację i stosunek płciowy, podczas gdy mężczyzna ma tylko jeden otwór na mocz i nasienie. Chociaż zewnętrzne części pochwy mają tendencję do napełnienia się krwią podczas stosunku płciowego, penis mężczyzny wykazuje znacznie bardziej widoczne powiększenie. To pozwala mu używać swojego penisa ze względów funkcjonalnych i wkładać go do pochwy.
Zarówno męski, jak i żeński układ rozrodczy wytwarzają hormony, ale hormony różnią się. Na przykład kobiety wytwarzają wyższy poziom żeńskich hormonów, takich jak estrogen, a mężczyźni mają więcej testosteronu. Hormony te wywierają szeroko zakrojone działanie na organizm, takie jak rozwój drugorzędowych cech płciowych, takich jak piersi lub szerokie ramiona. Oba układy rozrodcze zaczynają wytwarzać coraz większą liczbę hormonów w okresie dojrzewania.
Kobiety już po urodzeniu mają jaja w jajnikach, które są uwalniane co miesiąc. Z drugiej strony mężczyźni regularnie wytwarzają nowe plemniki. Żeński układ rozrodczy wymaga miesięcznego okresu na odnowienie wyściółki macicy, podczas gdy męski układ nie wymaga regularnej konserwacji w ten sam sposób.
Strukturalnie żeński układ rozrodczy jest obszarem do trzymania i pielęgnacji nienarodzonego dziecka. Ponadto jest to przestrzeń, w której komórki jajowe kobiety mogą mieszać się z męskim plemnikiem, aby wyprodukować nowego człowieka, co pozwala kobiecie przekazać część swoich genów następnemu pokoleniu, a mężczyźnie zrobić to samo. Męski układ rozrodczy nie zawiera żadnego sprzętu biologicznego, który mógłby utrzymać nowe dziecko. Zamiast tego jest to system produkcji i dostarczania nasienia.