Istnieje wiele zgłoszonych korzyści zdrowotnych kombuchy, takich jak poprawa układu odpornościowego, poprawa funkcji wątroby, lepsze trawienie i zapobieganie nowotworom. Ponieważ herbata kombucha stała się popularna, wiele osób skupiło się na tych twierdzeniach. Podobnie jak w przypadku wszystkich modnych produktów spożywczych i napojów, ważne jest, aby przejrzeć badania, które mogą wspierać takie twierdzenia. Chociaż pojawiło się wiele osobistych doniesień na temat korzyści płynących z kombuchy i niektórych badań laboratoryjnych, korzyści te nie są powszechnie akceptowane w zachodniej społeczności medycznej. Ponadto istnieją doniesienia o osobach doświadczających negatywnych skutków w wyniku picia kombuchy.
Mimo że wiele nauk kryjących się za korzyściami płynącymi z kombuchy jest nieco miękkie lub nieakceptowane przez zachodnią społeczność medyczną, wiele osób przysięga, że herbata kombucha jest cudownym napojem. Istnieją również przesłanki, że ludzie na Wschodzie od wielu stuleci korzystają z dobrodziejstw kombuchy. Dla niektórych doniesienia, że kombucha leczy i promuje zdrowie przez tak długi czas, są wystarczającym dowodem.
Ponieważ brakuje naukowej wiedzy o korzyściach płynących z kombuchy, twierdzenia dotyczące właściwości napoju są raczej niejasne. Nie można na przykład twierdzić, że napój poprawi ostrość umysłu, jeśli nie ma wystarczających dowodów na poparcie tego faktu. Ogólne twierdzenia dotyczące korzyści płynących z kombuchy obejmują poprawę ogólnego stanu zdrowia i samopoczucia, a także te wymienione powyżej. Możliwe jest jednak, że dowody w przyszłości potwierdzą lub wyszczerbią te twierdzenia.
Niepożądane skutki kombuchy mają zwykle związek z rozstrojem żołądka. Może to być spowodowane tym, że napój jest dość kwaśny. Z drugiej strony wiele osób twierdzi, że jedną z najlepszych zalet kombuchy jest lepsze trawienie. Inne negatywne skutki kombuchy mogą mieć związek z rodzajem beczki lub słoika, w którym uprawia się napój. Jeśli słoik jest zrobiony z materiału takiego jak glina, możliwe jest, że napój zostanie skażony ołowiem, składnikiem, który jest czasami używany w glazurach do tego rodzaju słoików.