Η ακριβής σχέση μεταξύ της καψαϊκίνης και του καρκίνου συζητείται ευρέως, καθώς μελέτες έχουν δείξει ορισμένα αντικρουόμενα αποτελέσματα. Ορισμένες έρευνες έχουν δείξει ότι η καψαϊκίνη, μια κοινή ουσία στις πιπεριές τσίλι, μπορεί να αυξήσει τον κίνδυνο καρκίνου του δέρματος. Πολλές άλλες μελέτες έχουν δείξει ότι η καψαϊκίνη μπορεί να είναι ένας ισχυρός μαχητής του καρκίνου και ότι πολλοί τύποι καρκινικών κυττάρων στην πραγματικότητα καταστρέφονται όταν εφαρμόζεται η ουσία. Οι περισσότερες έρευνες, συμπεριλαμβανομένης αυτής που υποστηρίζεται από πολλά ερευνητικά κέντρα για τον καρκίνο, υποστηρίζουν τη χρήση της καψαϊκίνης.
Η καψαϊκίνη και οι μελέτες θεραπείας του καρκίνου έχουν συνδέσει κυρίως τη χρήση αυτής της ουσίας με τη θεραπεία του καρκίνου του προστάτη, αν και ο καρκίνος του ήπατος και ορισμένοι άλλοι μπορεί επίσης να σταματήσουν με θεραπεία. Συνήθως δεν αρκεί να τρώτε απλώς περισσότερες πιπεριές τσίλι όταν πρόκειται για θεραπεία του καρκίνου. Πρέπει να λαμβάνονται υψηλές δόσεις της ουσίας για να έχουν αρκετά μεγάλο αντίκτυπο για τη θεραπεία της νόσου, αφού έχει ήδη διαγνωστεί ο καρκίνος. Ακόμη και με ορισμένες υποσχόμενες σχέσεις μεταξύ της καψαϊκίνης και της θεραπείας του καρκίνου, οι νεοδιαγνωσθέντες ασθενείς με καρκίνο θα πρέπει να μιλήσουν με έναν γιατρό για να καθορίσουν τη σωστή πορεία θεραπείας που θα χρησιμοποιήσουν.
Ορισμένοι επαγγελματίες υγείας συνιστούν τη λήψη καψαϊκίνης ως μέρος της θεραπείας του καρκίνου. Τα συμπληρώματα καψαϊκίνης ή πιπεριού καγιέν μπορούν να αγοραστούν από τα περισσότερα καταστήματα υγιεινής διατροφής ή διαδικτυακά από εξειδικευμένους λιανοπωλητές. Δεδομένου ότι μπορεί επίσης να παρέχουν ένα ευρύ φάσμα άλλων πλεονεκτημάτων για την υγεία, δεν υπάρχει συνήθως κανένα κακό στη λήψη χαπιών καψαϊκίνης ως μέρος των καθημερινών συμπληρωμάτων κάποιου.
Η καψαϊκίνη δεν συνιστάται επί του παρόντος από τα περισσότερα κύρια ιατρικά ιδρύματα για χρήση ως θεραπεία καρκίνου, αν και οι ερευνητές εργάζονται για να βρουν έναν τρόπο να αναπτύξουν φάρμακα που περιέχουν την ουσία ή να μιμηθούν τα αποτελέσματά της. Πολλοί επαγγελματίες υγείας ισχυρίζονται ότι ο λόγος που οι ιατροί δεν προωθούν την καψαϊκίνη είναι επειδή είναι σχετικά χαμηλής τιμής και δεν θα κέρδιζαν χρήματα από τις φαρμακευτικές εταιρείες. Άλλοι υποστηρίζουν ότι θα ήταν πολύ δύσκολο να καταναλωθεί αρκετή ποσότητα της ουσίας μόνο μέσω συμπληρωμάτων. Δεδομένου ότι τόσο λίγα είναι γνωστά για τη μακροχρόνια χρήση της καψαϊκίνης σε υψηλές δόσεις, είναι καλύτερο να αποφύγετε τη λήψη υπερβολικών ποσοτήτων εκτός εάν υπό την επίβλεψη γιατρού ή ολιστικού ιατρού.
Υπάρχουν μερικές αντικρουόμενες μελέτες σχετικά με τη σχέση μεταξύ καψαϊκίνης και καρκίνου. Αν και οι περισσότερες ήταν θετικές, ορισμένες μελέτες έχουν δείξει ότι η ουσία μπορεί να αυξήσει τον κίνδυνο για καρκίνο του δέρματος. Άλλες έρευνες έρχονται σε αντίθεση με αυτά τα ευρήματα και δεν έχουν δείξει καμία σχέση μεταξύ των δύο. Η καψαϊκίνη θεωρείται γενικά ασφαλής για χρήση, καθώς έχει επίσης αποδειχθεί ευεργετική για την ενίσχυση του μεταβολισμού και την πρόληψη ορισμένων εγκεφαλικών διαταραχών σε πολλές μελέτες. Οι καταναλωτές ενθαρρύνονται να συμβουλευτούν έναν επαγγελματία υγείας πριν λάβουν οποιαδήποτε φάρμακα ή συμπληρώματα.