Η κύρια σχέση μεταξύ της καούρας και του πονοκεφάλου είναι ότι τα φάρμακα που χρησιμοποιούνται για τη θεραπεία κάθε πάθησης μπορεί να οδηγήσουν στην άλλη. Τα τρόφιμα μπορεί επίσης να έχουν αυτό το αποτέλεσμα, όπως στην περίπτωση της καφεΐνης. Σε ορισμένες ιατρικές καταστάσεις, πονοκέφαλος και καούρα μπορεί να εμφανιστούν μαζί, αν και αυτό συνήθως προκαλείται από τη θεραπεία της πάθησης και όχι από την ίδια την ασθένεια. Μια εξαίρεση είναι το σύνδρομο ευερέθιστου εντέρου, το οποίο πολύ περιστασιακά μπορεί να προκαλέσει πονοκεφάλους στους πάσχοντες.
Οι περισσότεροι άνθρωποι υποφέρουν από καούρα και πονοκέφαλο κατά καιρούς. Αυτές οι παθήσεις συνήθως εμφανίζονται ξεχωριστά και δεν σχετίζονται, αλλά όταν χρησιμοποιούνται ορισμένα φάρμακα, μπορεί να εμφανιστούν και τα δύο μαζί. Πολλά φάρμακα για την ημικρανία είναι γνωστό ότι αναφέρουν τον πονοκέφαλο ως παρενέργεια. Επιπλέον, ορισμένες θεραπείες για την καούρα μπορούν επίσης να οδηγήσουν σε ήπιους έως σοβαρούς πονοκεφάλους εάν ληφθούν μακροχρόνια ή σε μεγάλες ποσότητες.
Υπάρχουν επίσης τροφές που συνδέουν την καούρα με τους πονοκεφάλους. Η καφεΐνη, για παράδειγμα, έχει αποδειχθεί ότι μειώνει τον πόνο ημικρανίας σε μερικούς ανθρώπους, αλλά έχει επίσης συνδεθεί με πεπτικές διαταραχές, συμπεριλαμβανομένης της καούρας. Αυτό ισχύει ιδιαίτερα σε ποτά όπως η σόδα και ο καφές, τα οποία είναι ερεθιστικά για το στομάχι και τον οισοφάγο. Οι ασθενείς που χρησιμοποιούν καφεΐνη για τη θεραπεία του πόνου στον πονοκέφαλο μπορεί να χρειαστεί να βρουν εναλλακτικές θεραπείες εάν το αποτέλεσμα είναι η καούρα. Η αποτελεσματικότητα της χρήσης τροφών και ποτών με καφεΐνη για το σκοπό αυτό συνήθως δεν υπερτερεί της πιθανής ενόχλησης της καούρας ή της δυσπεψίας.
Σε ορισμένες σπάνιες περιπτώσεις, ασθενείς που πάσχουν από σύνδρομο ευερέθιστου εντέρου έχουν αναφέρει συχνούς πονοκεφάλους ως μέρος των συμπτωμάτων τους. Αυτό δεν είναι απαραίτητα μια παρενέργεια του ίδιου του συνδρόμου, αλλά μπορεί να προκληθεί από το άγχος που αντιμετωπίζουν οι πάσχοντες από την πάθηση. Μόλις γίνουν διατροφικές αλλαγές και μετριαστούν οι πεπτικές διαταραχές, οι πονοκέφαλοι συχνά υποχωρούν χωρίς περαιτέρω θεραπεία. Εν τω μεταξύ, μπορεί να χρησιμοποιηθεί ένα φάρμακο χωρίς ιατρική συνταγή.
Μερικές φορές τόσο η καούρα όσο και ο πονοκέφαλος μπορεί να συσχετιστούν με άγχος. Το σοβαρό άγχος μπορεί να προκαλέσει και τις δύο καταστάσεις εάν δεν αντιμετωπιστεί. Προκαλεί τόσο αύξηση του σχηματισμού οξέος στο στομάχι όσο και ένταση, δημιουργώντας το τέλειο σενάριο για καούρα και πόνο που σχετίζεται με τον πονοκέφαλο. Η θεραπεία μπορεί να περιλαμβάνει φάρμακα χωρίς ιατρική συνταγή για την ανακούφιση των συμπτωμάτων, καθώς και θεραπεία ή συνταγογραφούμενα φάρμακα για τη θεραπεία των ριζικών στρεσογόνων παραγόντων. Κανονικά, όταν το άγχος έχει ανακουφιστεί, και τα δύο συμπτώματα θα εξαφανιστούν.
Περιστασιακά ένα φάρμακο για μια μη σχετική πάθηση θα προκαλέσει πονοκεφάλους και καούρα ή δυσπεψία. Εάν αυτό συμβεί και δεν μειώνεται με την πάροδο του χρόνου, οι ασθενείς μπορεί να χρειαστεί να αλλάξουν σε εναλλακτική φαρμακευτική αγωγή. Μερικές φορές αυτό δεν είναι δυνατό και μπορεί να χρειαστούν πρόσθετα φάρμακα για την καταπολέμηση των δυσάρεστων παρενεργειών.