Τα πλεονεκτήματα της αιθανόλης ζαχαροκάλαμου είναι πολύ εμφανή, ειδικά σε σύγκριση με την αιθανόλη με βάση το καλαμπόκι. Το ζαχαροκάλαμο μπορεί, λίβρα προς λίβρα, να παράγει πολύ περισσότερη ενέργεια από το καλαμπόκι, εν μέρει επειδή είναι ευκολότερο να παράγει αιθανόλη από ζαχαροκάλαμο. Το καλαμπόκι απαιτεί πρόσθετα ένζυμα, προσθέτοντας περισσότερα βήματα και κόστος στη διαδικασία. Το ζαχαροκάλαμο προσφέρει και άλλα οφέλη.
Ενώ το καλαμπόκι συχνά καλλιεργείται σε διαφορετικές συνθήκες, γεγονός που καθιστά δύσκολο τον προσδιορισμό της ποσότητας που θα είναι διαθέσιμος από έτος σε έτος, ειδικά για μεμονωμένα φυτά αιθανόλης με βάση το καλαμπόκι, η αιθανόλη ζαχαροκάλαμου είναι πολύ πιο προβλέψιμη. Η καλλιέργεια ζάχαρης, στο μέρος του κόσμου όπου μετατρέπεται σε αιθανόλη, παραμένει σχετικά σταθερή χρόνο με το χρόνο σε αντίθεση με τις καλλιέργειες που καλλιεργούνται στη ζώνη καλαμποκιού των Ηνωμένων Πολιτειών. Ενώ η μεσοδυτική περιοχή των ΗΠΑ προσφέρει μερικά από τα πιο εύφορα εδάφη στον κόσμο, πολλά άλλα πράγματα μπορούν να επηρεάσουν την καλλιέργεια καλαμποκιού. Παράσιτα, ξηρασίες, πλημμύρες, ακόμη και ισχυροί άνεμοι, όλα μπορούν να προκαλέσουν όλεθρο στο καλαμπόκι. Ενώ το ίδιο θα μπορούσε να ειπωθεί και για το ζαχαροκάλαμο, φαίνεται να ξεπερνά την καταιγίδα λίγο καλύτερα.
Ένα άλλο πλεονέκτημα της αιθανόλης ζαχαροκάλαμου είναι ο κύκλος συγκομιδής της. Το καλαμπόκι φυτεύεται κάθε χρόνο, συνήθως την άνοιξη, και στη συνέχεια συγκομίζεται το φθινόπωρο. Υπάρχει μόνο μία συγκομιδή ανά κύκλο φύτευσης. Ωστόσο, το ζαχαροκάλαμο προσφέρει το πλεονέκτημα, σε ορισμένες περιπτώσεις, έως και επτά συγκομιδών πριν χρειαστεί αναφύτευση. Έτσι, μπορεί να είναι πολύ πιο ενεργειακά και οικονομικά αποδοτική η παραγωγή αιθανόλης από ζαχαροκάλαμο.
Αυτοί οι παράγοντες μπορούν να κάνουν μεγάλη διαφορά για διάφορους λόγους. Το ζαχαροκάλαμο μπορεί να φτάσει στα εργοστάσια επεξεργασίας με μεγαλύτερη συνέπεια και προβλέψιμα. Υπάρχει πολύ λίγος λόγος για μια μονάδα παραγωγής αιθανόλης ζαχαροκάλαμου να ανησυχεί ότι ένας παραγωγός δεν θα είναι σε θέση να εκπληρώσει τις συμβατικές του υποχρεώσεις. Αν και αυτό μπορεί να ισχύει και για το καλαμπόκι τις περισσότερες φορές, θα υπάρξουν χρόνια που επίσης δεν ισχύει.
Το ενεργειακό ισοζύγιο, η ποσότητα της εισαγόμενης ενέργειας έναντι της παραγωγής ενέργειας, είναι επίσης σημαντικά υψηλότερη για την αιθανόλη ζαχαροκάλαμου σε σύγκριση με την αιθανόλη καλαμποκιού. Για κάθε μία μονάδα ενέργειας που καταναλώνεται στην παραγωγή αιθανόλης καλαμποκιού, δημιουργούνται 1.3 μονάδες. Για κάθε μονάδα ενέργειας που χρησιμοποιείται για την παραγωγή αιθανόλης ζαχαροκάλαμου, δημιουργούνται οκτώ μονάδες. Αυτό προσφέρει ένα ακόμη ανταγωνιστικό πλεονέκτημα για τη ζάχαρη.
Πρέπει να σημειωθεί ότι, όσον αφορά τα πρόσθετα της βενζίνης, τα προϊόντα αιθανόλης, είτε είναι από ζάχαρη είτε από καλαμπόκι, είναι πολύ ίδια από τον τρόπο που αντιδρούν στους κινητήρες αυτοκινήτων. Μέχρι να φτάσει στο αυτοκίνητο, έχει τελειοποιηθεί σε σημείο όπου η προέλευσή του είναι άσχετη. Το μόνο σημαντικό μέρος είναι το κόστος και το ενεργειακό όφελος από την παραγωγή του. Είτε πρόκειται για καλαμπόκι είτε για ζαχαροκάλαμο, η αιθανόλη παρέχει καθαρότερη βενζίνη με υψηλότερα οκτάνια. Όπως το βιοντίζελ, είναι επίσης μια ανανεώσιμη πηγή καυσίμου.