Υπάρχουν τέσσερα διαφορετικά βήματα ελέγχου που ακολουθούνται σε κάθε οικονομικό έλεγχο ή έλεγχο συστήματος: σχεδιασμός και αξιολόγηση κινδύνου, δοκιμή εσωτερικών ελέγχων, ουσιαστικές διαδικασίες και οριστικοποίηση. Ο σκοπός αυτών των βημάτων ελέγχου είναι να παρέχουν μια τυπική διαδικασία που χρησιμοποιείται σε κάθε έλεγχο. Στους περισσότερους οργανισμούς, ο έλεγχος διενεργείται από το τμήμα εσωτερικού ελέγχου ή μια εταιρεία εξωτερικού ελέγχου ή λογιστικής.
Τα βήματα ελέγχου προγραμματισμού και αξιολόγησης κινδύνου διεξάγονται συνήθως πριν από το τέλος του οικονομικού έτους και χρησιμοποιούνται για τη συλλογή πληροφοριών. Ο ελεγκτής αφιερώνει χρόνο για να μάθει για τη βιομηχανία, τους κανονισμούς, τις λογιστικές πολιτικές και τα συστήματα πληροφοριών. Κατά τη διάρκεια αυτού του σταδίου, πολλοί ελεγκτές εργάζονται από απομακρυσμένη τοποθεσία, καθώς οι περισσότερες από αυτές τις πληροφορίες διατίθενται από ανεξάρτητες πηγές.
Προκειμένου να σχεδιαστεί αποτελεσματικά ο έλεγχος, το συνολικό πεδίο εφαρμογής πρέπει να αξιολογηθεί και να τεκμηριωθεί. Ένας τυπικός οικονομικός έλεγχος περιορίζεται σε συναλλαγές που πραγματοποιήθηκαν την τρέχουσα περίοδο και συχνά ολοκληρώνεται σε συνοπτικό επίπεδο. Ο αριθμός των συναλλαγών και οι αξίες σε δολάρια χρησιμοποιούνται για τον προσδιορισμό των άνω και κάτω ορίων που θα χρησιμοποιηθούν για τον καθορισμό των τιμών ελέγχου. Ο κλάδος, η ισχύς των εσωτερικών ελέγχων και τυχόν ζητήματα που εγείρονται από τη διοίκηση καθορίζουν την εκτίμηση κινδύνου για τον έλεγχο.
Ένα από τα πιο σημαντικά από όλα τα βήματα ελέγχου είναι η διαδικασία ελέγχου των εσωτερικών ελέγχων. Αυτές οι διαδικασίες και διαδικασίες χρησιμοποιούνται για να διασφαλιστεί ότι υπάρχουν κατάλληλες εγκρίσεις πριν από την πληρωμή ή την πραγματοποίηση συναλλαγών στο σύστημα. Η κύρια μέθοδος ελέγχου εσωτερικού ελέγχου είναι η τυχαία επιλογή συναλλαγών και ο έλεγχος της τεκμηρίωσης της πηγής. Εάν μια τυχαία επιλογή από ένα αντιπροσωπευτικό δείγμα διαπιστώσει ότι τα στοιχεία ελέγχου ήταν ασθενή ή έλειπαν, τότε το μέγεθος του δείγματος πρέπει να αυξηθεί.
Οι ουσιαστικές διαδικασίες είναι η πραγματική διαδικασία συλλογής φυσικών αποδεικτικών στοιχείων των συναλλαγών και η επαλήθευση της αξίας που δημοσιεύτηκε σε έναν συγκεκριμένο λογαριασμό υποστηρίζεται από πραγματικά έγγραφα. Αυτή η πτυχή του ελέγχου είναι η πιο χρονοβόρα και είναι πολύ λεπτομερής εργασία. Ο λογαριασμός που επιλέχθηκε για αυτόν τον τύπο κριτικής ποικίλλει, αλλά είναι συνήθως αυτός που παρακολουθεί μια σειρά από δραστηριότητες υψηλής και χαμηλής αξίας δολαρίου.
Το τελευταίο στάδιο του ελέγχου είναι η οριστικοποίηση. Πρόκειται για τη δημιουργία μιας αναφοράς προς τη διοίκηση που συνοψίζει όλες τις διαδικασίες που χρησιμοποιήθηκαν για τη διεξαγωγή του ελέγχου, το αποτέλεσμα των διαφόρων διαδικασιών και την υποστηρικτική τεκμηρίωση. Οι αναφορές ελέγχου έχουν διάφορες μορφές ή διατάξεις που χρησιμοποιούνται, ανάλογα με το κοινό. Για παράδειγμα, οι περισσότερες τράπεζες απαιτούν ελεγμένες οικονομικές καταστάσεις όταν υποβάλλουν αίτηση για επιχειρηματικό δάνειο. Συχνά έχουν μια προτιμώμενη μορφή, καθιστώντας τη σύγκριση και την αναθεώρηση μια πιο απλή διαδικασία.