Αφού υποβληθούν σε βαζεκτομή, ορισμένοι άνδρες αναφέρουν κοινά προβλήματα όπως μώλωπες κοντά στο σημείο της τομής, πρήξιμο και μικρή ενόχληση. Αυτά τα προβλήματα βαζεκτομής είναι αναμενόμενα και γενικά διαρκούν μόνο λίγες ημέρες. Σε ορισμένες περιπτώσεις, μπορεί να προκύψουν πιο σοβαρές επιπλοκές, συμπεριλαμβανομένης της μετεγχειρητικής λοίμωξης.
Σχεδόν κάθε ασθενής θα αντιμετωπίσει μερικά προβλήματα βαζεκτομής τις ημέρες ή την εβδομάδα αμέσως μετά τη διαδικασία, όπως μώλωπες και πρήξιμο των όρχεων, καθώς και κάποιο πόνο και δυσφορία. Είναι κοινή πρακτική για τον ιατρό να συνταγογραφεί ένα από του στόματος παυσίπονο και πιθανώς ένα αντιφλεγμονώδες φάρμακο για την ανακούφιση αυτών των συμπτωμάτων. Πολλοί ασθενείς θεωρούν χρήσιμο να εφαρμόζουν μια σακούλα πάγου στην περιοχή για σύντομο χρονικό διάστημα για να περιορίσουν την κυκλοφορία του αίματος και να ανακουφίσουν τον πόνο. Μετά από μια βαζεκτομή, οι ασθενείς συνήθως λαμβάνουν οδηγίες να ειδοποιήσουν αμέσως τον γιατρό εάν εμφανιστεί πιο σοβαρή επιπλοκή της βαζεκτομής, όπως πυρετός ή σχηματισμός σβώλων στους όρχεις.
Υπάρχουν άλλα πιο σοβαρά προβλήματα βαζεκτομής που μπορεί να εκδηλωθούν μετά από χειρουργική επέμβαση, όπως πυρετός, λοίμωξη και μια κατάσταση γνωστή ως κοκκιώματα σπέρματος, η οποία αναφέρεται στο πίσω μέρος του σπέρματος στους όρχεις. Σε περίπτωση οποιασδήποτε από αυτές τις καταστάσεις, είναι σημαντικό για τον ασθενή να ζητήσει ιατρική συμβουλή από το γιατρό του το συντομότερο δυνατό. Ο πυρετός μπορεί τις περισσότερες φορές να αντιμετωπιστεί στο σπίτι με φάρμακα χωρίς ιατρική συνταγή και ξεκούραση, αλλά εάν υπάρχει λοίμωξη, ο γιατρός θα θελήσει να εξετάσει την περιοχή και να ενεργήσει ανάλογα. Είναι ασυνήθιστο τα κοκκιώματα του σπέρματος να προκαλούν προβλήματα και τα περισσότερα εξογκώματα θα διαλυθούν από μόνα τους μέσα σε ένα χρόνο.
Μερικές μελέτες έχουν εισαγάγει την ιδέα της σύνδεσης της βαζεκτομής και του μεγαλύτερου κινδύνου καρκίνου του προστάτη για τους ασθενείς που επιλέγουν αυτή τη διαδικασία. Οι περισσότεροι επαγγελματίες του ιατρικού κλάδου πιστεύουν ότι δεν υπάρχει σχέση μεταξύ της υποτροπής σε βαζεκτομή και του αυξημένου ποσοστού καρκίνου του προστάτη. Προτείνεται κάθε άνδρας να επισκέπτεται τακτικά γιατρό για εξετάσεις προστάτη για να εξασφαλίσει καλή υγεία.
Αν και είναι σπάνιο, η αποτυχία της βαζεκτομής είναι πρόβλημα για μικρό αριθμό ασθενών. Η αιτία αυτών των τύπων προβλημάτων βαζεκτομής είναι συχνά άγνωστη και επίσης αποτελεί μέρος του λόγου που συνιστάται στους ασθενείς να χρησιμοποιούν εναλλακτικές μορφές ελέγχου των γεννήσεων για τους πρώτους τρεις μήνες μετά τη διαδικασία. Εφόσον η ασθενής τηρεί το απαιτούμενο πρόγραμμα δειγματοληψίας σπέρματος, αυτό το ζήτημα μπορεί να επιλυθεί πριν προκύψει οποιαδήποτε απρογραμμάτιστη εγκυμοσύνη.