Μια μεταμόσχευση βλαστοκυττάρων για πολλαπλό μυέλωμα μπορεί να παρατείνει τη ζωή σε ορισμένους ασθενείς. Από την άλλη πλευρά, η διαδικασία σωτηρίας μπορεί να έχει σοβαρές επιπλοκές, όπως δευτερογενείς καρκίνους, αποτυχία μοσχεύματος και ακόμη και θάνατο. Οι μέτριες αντιδράσεις περιλαμβάνουν αιμορραγία και λοιμώξεις, ενώ μπορεί επίσης να εμφανιστούν λιγότερο σοβαρές επιπλοκές όπως η υπογονιμότητα και ο καταρράκτης.
Ενώ η μεταμόσχευση βλαστοκυττάρων για πολλαπλό μυέλωμα δεν είναι θεραπεία, οι ασθενείς που υποβάλλονται στη διαδικασία μπορεί συχνά να επιβραδύνουν την εξέλιξη της νόσου. Αφού υποβληθούν επιτυχώς στη διαδικασία, ορισμένοι ασθενείς παρουσιάζουν συχνά ύφεση των συμπτωμάτων και εξέλιξη της νόσου. Οι ασθενείς με πολλαπλό μυέλωμα μπορούν να επιλέξουν μεταξύ αυτόλογης και αλλογενούς μεταμόσχευσης βλαστοκυττάρων. Η αυτόλογη μεταμόσχευση βλαστοκυττάρων περιλαμβάνει τη συλλογή των βλαστικών κυττάρων του ίδιου του ασθενούς, ενώ οι αλλογενείς μεταμοσχεύσεις βλαστοκυττάρων συλλέγουν βλαστοκύτταρα από έναν στενά ταιριαστό δότη.
Η διαδικασία της μεταμόσχευσης βλαστοκυττάρων φέρνει τη δυνατότητα παρατεταμένης ζωής, αλλά η διαδικασία εγκυμονεί επίσης σοβαρό κίνδυνο. Τελικά, κάθε ασθενής θα έχει ποικίλες αντιδράσεις που κυμαίνονται από μικρές έως πολύ σοβαρές παρενέργειες. Η υπογονιμότητα και ο καταρράκτης είναι γνωστό ότι εμφανίζονται σε ασθενείς με πολλαπλό μυέλωμα μετά από ολική ακτινοβόληση του σώματος, η οποία συμβαίνει πριν από τη λήψη της θεραπείας με βλαστοκύτταρα. Στην περίπτωση της υπογονιμότητας, η θεραπεία ορμονικής υποκατάστασης θα είναι απαραίτητη για την ωορρηξία. Όσοι λαμβάνουν στεροειδή σε συνδυασμό με τη μεταμόσχευση βλαστοκυττάρων έχουν μεγαλύτερες πιθανότητες να αναπτύξουν καταρράκτη.
Η μη φυσιολογική αιμορραγία ή η θρομβοπενία και οι λοιμώξεις είναι δυνητικά σοβαρές επιπλοκές μιας μεταμόσχευσης βλαστοκυττάρων για πολλαπλό μυέλωμα. Η θρομβοπενία είναι ένας χαμηλός αριθμός αιμοπεταλίων στο αίμα. Η κατάσταση μπορεί να οδηγήσει σε υπερβολική αιμορραγία και μώλωπες. Οι ευκαιριακές λοιμώξεις αποτελούν επίσης μέτριο έως σοβαρό κίνδυνο για την ευημερία και την ανάρρωση του ασθενούς, ειδικά εάν ληφθούν ανοσοκατασταλτικά φάρμακα. Οι βακτηριακές λοιμώξεις αντιμετωπίζονται με ισχυρά αντιβιοτικά ενώ οι μυκητιάσεις αντιμετωπίζονται με αντιμυκητιακά φάρμακα όπως η φλουκοναζόλη.
Οι πολύ πιο σοβαρές συνέπειες της λήψης μεταμόσχευσης βλαστοκυττάρων περιλαμβάνουν δευτερογενείς καρκίνους όπως η λευχαιμία και το λέμφωμα, ειδικά εκείνοι που εμφανίζονται σε ορισμένους ασθενείς με πολλαπλό μυέλωμα που λαμβάνουν χημειοθεραπεία και ακτινοβολία πριν από τη μεταμόσχευση βλαστοκυττάρων. Η αποτυχία μοσχεύματος και η νόσος του μοσχεύματος έναντι του ξενιστή (GVHD) είναι δύο απειλητικές για τη ζωή επιπλοκές που μπορεί να οδηγήσουν σε ανεπάρκεια οργάνων και ακόμη και θάνατο. Στην περίπτωση αποτυχίας του μοσχεύματος, τα βλαστοκύτταρα αποτυγχάνουν να αναπτυχθούν, με αποτέλεσμα την ανεπάρκεια του μυελού των οστών. Το GVHD περιλαμβάνει τα μεταμοσχευμένα βλαστοκύτταρα του δότη για να επιτεθούν στους ιστούς του σώματος του λήπτη. Οι αλλογενείς λήπτες μοσχευμάτων διατρέχουν μεγαλύτερο κίνδυνο να αναπτύξουν οξείες και χρόνιες μορφές GVHD από εκείνους που λαμβάνουν αυτόλογη μεταμόσχευση βλαστοκυττάρων για πολλαπλό μυέλωμα.