Η κατανόηση των πλεονεκτημάτων και των μειονεκτημάτων της λήψης αντιβιοτικών για τον πυρετό μπορεί να βοηθήσει στον καθορισμό της καλύτερης απόφασης κατά περίπτωση. Ενώ τα αντιβιοτικά μπορεί να είναι αποτελεσματικά για τη θεραπεία πυρετών που σχετίζονται με βακτηριακή λοίμωξη, μπορεί να είναι αναποτελεσματικά και ακόμη και επικίνδυνα εάν ο πυρετός προκαλείται από ιό. Η διαβούλευση με έναν γιατρό πριν από την έναρξη ενός αντιβιοτικού σχήματος είναι ο καλύτερος τρόπος για να διασφαλιστεί ότι χρησιμοποιούνται τα σωστά φάρμακα για την αντιμετώπιση του προβλήματος.
Τα αντιβιοτικά για τον πυρετό είναι συχνά δικαιολογημένα όταν η αιτία μιας ασθένειας περιλαμβάνει βακτήρια. Οι λοιμώξεις του ουροποιητικού συστήματος, ο στρεπτόκοκκος στο λαιμό, οι παραρρινοκολπικές λοιμώξεις και οι λοιμώξεις με βάση τα όργανα προκαλούνται συχνά από μια αναπτυσσόμενη βακτηριακή αποικία και ενέχουν κίνδυνο πυρετού. Τα αντιβιοτικά δρουν σκοτώνοντας τα βακτήρια, γεγονός που οδηγεί στη μείωση άλλων συμπτωμάτων, συμπεριλαμβανομένων των σχετικών πυρετών. Εάν ένας γιατρός μπορεί να προσδιορίσει ότι υπάρχει βακτηριακή λοίμωξη, τα αντιβιοτικά για τον πυρετό και την υποκείμενη πάθηση μπορεί κάλλιστα να είναι η πρώτη γραμμή άμυνας του ασθενούς.
Από την άλλη πλευρά, πολλές λοιμώξεις είναι ιογενούς φύσης, συμπεριλαμβανομένων των περισσότερων κρυολογημάτων, λοιμώξεων του αναπνευστικού συστήματος και γρίπης. Η χρήση αντιβιοτικών για τον πυρετό όταν υπάρχει ιογενής λοίμωξη δεν θα μειώσει τα συμπτώματα ούτε θα διορθώσει το υποκείμενο πρόβλημα, επειδή το φάρμακο δεν είναι ικανό να επιτεθεί σε έναν ιό. Σε ορισμένες περιπτώσεις, οι γιατροί μπορεί να συνταγογραφήσουν ένα αντιικό φάρμακο που μπορεί να σκοτώσει τους ιούς, όπως ένα αντιβιοτικό μπορεί να σκοτώσει τα βακτήρια. Καθώς οι περισσότερες ιογενείς λοιμώξεις υποχωρούν χωρίς βοήθεια, ωστόσο, οι γιατροί μπορούν απλώς να συμβουλεύσουν τη χρήση φαρμάκων χωρίς ιατρική συνταγή και αυξημένη ανάπαυση για τη μείωση του πυρετού και άλλων συμπτωμάτων.
Το δύσκολο μέρος του καθορισμού της χρήσης αντιβιοτικών για τον πυρετό έγκειται στο γεγονός ότι πολλοί γιατροί δεν μπορούν να δώσουν οριστική διάγνωση για το εάν μια μικρή ασθένεια είναι βακτηριακής ή ιογενούς φύσης. Αυτό μπορεί να οδηγήσει τους ανθρώπους να εξετάσουν το ενδεχόμενο αυτοθεραπείας με αντιβιοτικά ή να ζητήσουν από γιατρό συνταγή αντιβιοτικών σε περίπτωση που η μόλυνση είναι βακτηριακή.
Ενώ ένα αντιβιοτικό για τον πυρετό μπορεί να λειτουργήσει εάν η πάθηση αποδειχθεί ότι είναι βακτηριακή, υπάρχουν ορισμένοι κίνδυνοι στη λήψη αντιβιοτικών όταν δεν είναι απολύτως απαραίτητα. Εάν οι πυρετοί προκαλούνται από ιογενή ασθένεια, η λήψη αντιβιοτικών μπορεί πράγματι να αυξήσει ορισμένα συμπτώματα, όπως ναυτία, αϋπνία ή πεπτικά προβλήματα. Πιο ανησυχητικό, η υπερβολική έκθεση στα αντιβιοτικά μπορεί να προκαλέσει τα βακτήρια να αναπτύξουν αντίσταση, καθιστώντας τις βακτηριακές λοιμώξεις πιο δύσκολο να αντιμετωπιστούν με την πάροδο του χρόνου. Για το λόγο αυτό, πολλοί γιατροί συμβουλεύουν την αποφυγή αντιβιοτικών για τον πυρετό, εκτός εάν η υποκείμενη ασθένεια μπορεί να προσδιοριστεί θετικά ως βακτηριακή λοίμωξη που είναι απίθανο να επιλυθεί από μόνη της.