Οι ασθένειες του αναπνευστικού συστήματος είναι καταστάσεις που επηρεάζουν τα διάφορα μέρη της μύτης, του λαιμού και των πνευμόνων. Υπάρχουν πολλές διαφορετικές ασθένειες του αναπνευστικού συστήματος που επηρεάζουν ανθρώπους από όλο τον κόσμο κάθε χρόνο. Οι περισσότερες από αυτές τις ασθένειες προκαλούνται από μόλυνση από ιούς, βακτήρια και μύκητες. Ορισμένες λοιμώξεις μπορεί να είναι ήπιες, όπως το κοινό κρυολόγημα, ενώ άλλες μπορεί να εμφανιστούν μακροπρόθεσμα και να γίνουν απειλητικές για τη ζωή, όπως το άσθμα και η χρόνια αποφρακτική πνευμονοπάθεια (ΧΑΠ). Άλλες αιτίες της νόσου του αναπνευστικού συστήματος περιλαμβάνουν τη γενετική προδιάθεση, τη ρύπανση του περιβάλλοντος και τους παράγοντες του τρόπου ζωής.
Οι διάφορες ασθένειες του αναπνευστικού συστήματος που προκαλούνται από μόλυνση από ιούς είναι συχνά ήπιες και χρειάζονται κυρίως υποστηρικτική θεραπεία, όπως ξεκούραση και κατανάλωση άφθονων υγρών. Συχνά, τέτοιες λοιμώξεις είναι μεταδοτικές, μεταφέρονται από το ένα άτομο στο άλλο μέσω του βήχα και του φτερνίσματος. Ωστόσο, υπάρχουν άλλες ιογενείς ασθένειες του αναπνευστικού συστήματος που μπορούν να αποτελέσουν σοβαρή απειλή για την κοινότητα, όπως η γρίπη των χοίρων που προκαλείται από τον ιό H1N1, η γρίπη των πτηνών που προκαλείται από τον ιό H5N1 και το σοβαρό οξύ αναπνευστικό σύνδρομο (SARS) που προκαλείται από τον κοροναϊό SARS .
Οι βακτηριακές λοιμώξεις της αναπνευστικής οδού περιλαμβάνουν την αμυγδαλίτιδα, τον κοκκύτη, τη φυματίωση (ΤΒ) και την πνευμονία, μεταξύ πολλών άλλων. Συχνά υπάρχουν συμπτώματα όπως πυρετός, αδυναμία του σώματος, πονοκέφαλος, πόνος κατά την κατάποση και δύσπνοια. Ορισμένες λοιμώξεις θεραπεύονται εύκολα με τη χρήση αντιβιοτικών και αρκετή ανάπαυση, ενώ άλλες απαιτούν μακροχρόνια θεραπεία, όπως για τη θεραπεία της φυματίωσης, η οποία μπορεί να απαιτήσει έξι έως εννέα μήνες τακτικής φαρμακευτικής αγωγής. Η πνευμονία μπορεί επίσης να είναι απειλητική για τη ζωή, εάν δεν αντιμετωπιστεί έγκαιρα.
Οι μυκητιασικές λοιμώξεις των πνευμόνων περιλαμβάνουν την ασπεργίλλωση, την κρυπτόκοκκωση και την ιστοπλάσμωση. Τα ταξίδια σε ενδημικές περιοχές και η συχνή έκθεση σε περιττώματα νυχτερίδων και πτηνών μπορεί συχνά να προκαλέσουν μόλυνση σε ευαίσθητα άτομα. Τα άτομα που μολύνονται από μύκητες είναι συχνά ανοσοκατεσταλμένα, πράγμα που σημαίνει ότι το ανοσοποιητικό τους σύστημα δεν λειτουργεί καλά. Σε αυτούς περιλαμβάνονται ασθενείς με σύνδρομο επίκτητης ανοσολογικής ανεπάρκειας (AIDS).
Άλλες ασθένειες του αναπνευστικού συστήματος περιλαμβάνουν το άσθμα και τη χρόνια αποφρακτική πνευμονοπάθεια (ΧΑΠ). Στο άσθμα και τη ΧΑΠ, συχνά υπάρχει στένωση των αεραγωγών που εκδηλώνεται με δύσπνοια. Οι παράγοντες που οδηγούν στο άσθμα περιλαμβάνουν τη γενετική προδιάθεση και την εισπνοή επιβλαβών ουσιών από το περιβάλλον, με τη διαταραχή να εκδηλώνεται κυρίως κατά την παιδική ηλικία. Η ΧΑΠ, από την άλλη πλευρά, προκαλείται συνήθως από τον τρόπο ζωής και τους περιβαλλοντικούς παράγοντες όπως το κάπνισμα, και εμφανίζεται συχνά σε άτομα μεγαλύτερης ηλικίας. Το κάπνισμα έχει συνδεθεί σε μεγάλο βαθμό όχι μόνο με το άσθμα και τη ΧΑΠ, αλλά και με την ανάπτυξη καρκίνου του πνεύμονα.