Μερικές από τις πιο κοινές αιτίες καθυστέρησης της εμμήνου ρύσεως είναι οι ορμονικές ανισορροπίες, οι ασθένειες, οι αλλαγές στα φάρμακα και η εμμηνόπαυση ή η εγκυμοσύνη. Η υπερβολική άσκηση, οι γρήγορες αλλαγές στο βάρος, το υπερβολικό ή ελλιπές βάρος και η κακή διατροφή μπορούν επίσης να συμβάλουν στην ακανόνιστη έμμηνο ρύση. Ένας κανονικός κύκλος εμμήνου ρύσεως είναι διαφορετικός για κάθε γυναίκα, επειδή ορισμένες γυναίκες έχουν έμμηνο ρύση όσο συχνά κάθε 20 ημέρες και άλλες έχουν έμμηνο ρύση μόνο κάθε 35 ημέρες. Η διάρκεια του κύκλου ποικίλλει επίσης για κάθε γυναίκα και μπορεί να διαρκέσει από τρεις έως επτά ημέρες.
Οι ορμονικές ανισορροπίες είναι μια κοινή αιτία για έναν καθυστερημένο κύκλο. Μια κοινή ορμονική διαταραχή είναι γνωστή ως σύνδρομο πολυκυστικών ωοθηκών και μπορεί να συμβάλει σε ακανόνιστη έμμηνο ρύση ή σε απώλεια περιόδου συνολικά. Το συναισθηματικό στρες, το άγχος, η κούραση και η θεραπεία ορμονικής υποκατάστασης είναι μερικοί από τους πιο κοινούς παράγοντες που παρεμβαίνουν στα επίπεδα ορμονών. Μια παρεμβολή μπορεί επίσης να προκληθεί από ξένες ουσίες στο σώμα, όπως ρύπανση του περιβάλλοντος, χημικές ουσίες, καπνός τσιγάρου και υπερβολική χρήση ορισμένων καλλυντικών. Η εγκυμοσύνη και ο θηλασμός είναι επίσης κοινές αιτίες καθυστέρησης της εμμήνου ρύσεως.
Μια κακή διατροφή με υψηλή περιεκτικότητα σε κορεσμένα λιπαρά, επεξεργασμένα τρόφιμα και πολλά πρόχειρα φαγητά μπορεί να στερήσει τον οργανισμό από τα απαραίτητα θρεπτικά συστατικά που χρειάζεται για να εξισορροπήσει τα επίπεδα των ορμονών. Οι ανθυγιεινές αλλαγές στη διατροφή και οι διατροφικές διαταραχές μπορεί να οδηγήσουν σε γρήγορη απώλεια βάρους ή ταχεία αύξηση βάρους, τα οποία και τα δύο μπορεί να επηρεάσουν τον εμμηνορροϊκό κύκλο. Το υπερβολικό βάρος γενικά τείνει να παρεμβαίνει στις ορμόνες και επομένως αποτελεί σημαντικό παράγοντα κινδύνου για καθυστέρηση της εμμήνου ρύσεως. Η άσκηση μπορεί να βοηθήσει κάποιον να διατηρήσει ένα υγιές βάρος, αλλά θα πρέπει να γίνεται με μέτρο, γιατί η τακτική έντονη άσκηση παρεμβαίνει και στον κύκλο.
Η καθυστέρηση της εμμήνου ρύσεως μπορεί επίσης να προκληθεί από ορισμένα φάρμακα, όπως αντισυλληπτικά χάπια, αντικαταθλιπτικά και κορτικοστεροειδή. Μπορεί να χρειαστούν αρκετοί κύκλοι στο σώμα για να προσαρμοστεί στη νέα ποσότητα ορμονών στο σώμα, όταν μια γυναίκα παίρνει ή βγάζει αντισυλληπτικά χάπια. Οι αλλαγές σε άλλα φάρμακα μπορεί επίσης να οδηγήσουν σε καθυστέρηση της εμμήνου ρύσεως. Άλλες κοινές αιτίες περιλαμβάνουν μια οξεία ή μακροχρόνια ασθένεια όπως η νόσος του θυρεοειδούς, ένας όγκος στον εγκέφαλο ή της υπόφυσης, λοιμώξεις και πρόωρη ωοθηκική ανεπάρκεια.
Η περιεμμηνόπαυση είναι το στάδιο λίγο πριν την εμμηνόπαυση κατά το οποίο το σώμα αρχίζει να μειώνει την παραγωγή ορμονών. Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, οι κύκλοι αρχίζουν να αλλάζουν. Αυτό συχνά έχει ως αποτέλεσμα έναν ελαφρύ ή βαρύ κύκλο, μια καθυστερημένη περίοδο ή μια μεγάλη έμμηνο ρύση.