Μια σειρά από διαφορετικές επιπλοκές της διασωλήνωσης είναι πιθανές. Εάν οι ασθενείς χρειάζονται επείγουσα βοήθεια στην αναπνοή, συνήθως διασωληνώνονται με την εισαγωγή ενός αναπνευστικού σωλήνα στο στόμα, ο οποίος στη συνέχεια διοχετεύεται στην τραχεία. αυτός ο σωλήνας αναφέρεται συχνά ως ενδοτραχειακός σωλήνας. Μετά τη διασωλήνωση, ένας αναπνευστήρας μπορεί να αντλεί αέρα μέσα και έξω από τους πνεύμονες. Επιπλοκές της διασωλήνωσης μπορεί να προκύψουν από τη διαδικασία εισαγωγής, καθώς ο σωλήνας θα μπορούσε να βλάψει είτε την αναπνευστική είτε τη γαστρεντερική οδό. Οι ασθενείς που είναι διασωληνωμένοι έχουν αυξημένο κίνδυνο για λοιμώξεις όπως πνευμονία και ιγμορίτιδα και η μακροχρόνια υποστήριξη της αναπνοής με ενδοτραχειακό σωλήνα μπορεί να οδηγήσει σε βλάβη της αναπνευστικής οδού, καθιστώντας την μελλοντική αναπνοή πιο δύσκολη.
Η ίδια η εισαγωγή του σωλήνα μπορεί περιστασιακά να προκαλέσει βλάβη στον ασθενή που υποβάλλεται σε αυτή τη διαδικασία. Σπάνια, ο σωλήνας μπορεί να βλάψει τις φωνητικές χορδές, οδηγώντας σε προβλήματα στην ομιλία μετά την απομάκρυνση του ασθενούς από τον αναπνευστήρα. Άλλες φορές, ο σωλήνας θα μπορούσε να περάσει στον οισοφάγο αντί στην τραχεία, οδηγώντας σε ρήξεις στον οισοφάγο. Αυτό μπορεί να οδηγήσει σε αιμορραγία εντός της γαστρεντερικής οδού και θα μπορούσε επίσης να προκαλέσει προβλήματα με την κατάποση μετά την αφαίρεση του αναπνευστικού σωλήνα.
Με τον καιρό και με ακατάλληλη φροντίδα των διασωληνωμένων ασθενών, μπορεί να εμφανιστεί μια λοίμωξη του πνεύμονα που ονομάζεται πνευμονία. Συχνά αυτή η κατάσταση, η οποία είναι μία από τις επιπλοκές της διασωλήνωσης, αναφέρεται ως πνευμονία που σχετίζεται με τον αναπνευστήρα. Αυτός ο τύπος μόλυνσης αναπτύσσεται επειδή οι πνεύμονες των διασωληνωμένων ασθενών είναι λιγότερο προστατευμένοι σε σύγκριση με τους ανθρώπους που αναπνέουν κανονικά επειδή ο αέρας διοχετεύεται απευθείας στους πνεύμονες. Πολλές φορές αυτές οι λοιμώξεις είναι δύσκολο να αντιμετωπιστούν επειδή προκαλούνται από ανθεκτικά βακτήρια που υπάρχουν στο νοσοκομείο.
Μια άλλη από τις μολυσματικές επιπλοκές της διασωλήνωσης είναι η ιγμορίτιδα, μια κατάσταση που χαρακτηρίζεται από φλεγμονή και ερεθισμό των κόλπων. Αυτή η παρενέργεια εμφανίζεται επειδή η παροχέτευση της κοιλότητας του κόλπου συχνά επηρεάζεται από την παρουσία του ενδοτραχειακού σωλήνα. Οι ασθενείς μπορεί να έχουν ή να μην έχουν συμπτώματα αυτής της λοίμωξης. Ωστόσο, είναι κλινικά σημαντικό, επειδή η μόλυνση των ιγμορείων μπορεί να προκαλέσει πυρετό. Εκτελούνται απεικονιστικές μελέτες, όπως αξονική τομογραφία (CT) για τον εντοπισμό της ιγμορίτιδας.
Οι ασθενείς που πρέπει να παραμείνουν σε αναπνευστήρα για μεγάλο χρονικό διάστημα μπορεί να εμφανίσουν άλλες επιπλοκές της διασωλήνωσης. Η παρουσία ενός πλαστικού σωλήνα από το στόμα στους πνεύμονες μπορεί να βλάψει τον χόνδρο που υποστηρίζει την αναπνευστική οδό, μειώνοντας τη δομική του ακεραιότητα. Διαφορετικά μέρη της αναπνευστικής οδού, συμπεριλαμβανομένης της τραχείας, μπορεί να στενέψουν λόγω της παρουσίας του σωλήνα. Ως αποτέλεσμα, οι ασθενείς θα μπορούσαν να αναπτύξουν συριγμό και δύσπνοια. Για το λόγο αυτό, οι ασθενείς που αναμένεται να χρειαστούν βοήθεια στην αναπνοή για πάνω από μια εβδομάδα συχνά αλλάζουν από τη διασωλήνωση από το στόμα σε διασωλήνωση μέσω της τραχείας.