Πολλοί άνθρωποι μπορούν να χρησιμοποιήσουν αναστολείς οιστρογόνων χωρίς να εμφανίσουν σημαντικές παρενέργειες, αν και τυχόν νέα ή ενοχλητικά συμπτώματα που εμφανίζονται μετά την έναρξη της θεραπείας με αυτό το είδος φαρμάκου θα πρέπει να συζητούνται με τον συνταγογραφούντα ιατρό. Μερικές από τις πιο συχνές παρενέργειες αυτών των ουσιών περιλαμβάνουν ζάλη, ναυτία και εξάψεις. Πρόσθετες παρενέργειες αυτών των φαρμάκων μπορεί να περιλαμβάνουν αύξηση βάρους, νυχτερινές εφιδρώσεις και αλλαγές στην κολπική έκκριση. Πιο σοβαρές παρενέργειες των αναστολέων οιστρογόνων, ειδικά όταν χρησιμοποιούνται για παρατεταμένες χρονικές περιόδους, μπορεί να περιλαμβάνουν την ανάπτυξη θρόμβων αίματος, αλλεργικές αντιδράσεις ή αυξημένο κίνδυνο ανάπτυξης καρκίνου των αναπαραγωγικών οργάνων.
Οι περισσότερες ανεπιθύμητες ενέργειες των αναστολέων οιστρογόνων είναι σχετικά ήπιες και μπορεί να μειωθούν με την πάροδο του χρόνου καθώς το σώμα προσαρμόζεται στη φαρμακευτική αγωγή. Η ήπια ζάλη είναι ένα κοινό παράπονο, αλλά εάν αυτό το σύμπτωμα γίνει σοβαρό ή συνοδεύεται από πονοκέφαλο, θα πρέπει να συμβουλευτείτε γιατρό για περαιτέρω αξιολόγηση. Εάν εμφανιστεί ναυτία κατά τη χρήση αυτού του τύπου φαρμάκου, μπορεί να σας βοηθήσει να φάτε ένα γεύμα ή να πιείτε ένα ποτήρι γάλα πριν πάρετε το φάρμακο.
Εξάψεις, νυχτερινές εφιδρώσεις και άλλα συμπτώματα που μοιάζουν με την εμμηνόπαυση μπορεί να εμφανιστούν κατά τη λήψη αναστολέων οιστρογόνων. Πόνος στα οστά ή στους μύες, αύξηση βάρους και κόπωση έχουν αναφερθεί από όσους λαμβάνουν αυτά τα φάρμακα. Μπορεί να υπάρξει αύξηση ή μείωση των κολπικών εκκρίσεων από όσους χρησιμοποιούν αυτό το είδος φαρμάκου. Ενώ τα περισσότερα από αυτά τα συμπτώματα είναι ήπιας φύσης, ορισμένες φορές μπορεί να είναι δυνατή η προσαρμογή της δόσης εάν αυτές οι παρενέργειες γίνουν ιδιαίτερα ενοχλητικές.
Η παρατεταμένη χρήση αναστολέων οιστρογόνων αυξάνει τον κίνδυνο εμφάνισης σοβαρών παρενεργειών ή δυνητικά θανατηφόρων επιπλοκών. Μπορεί να αναπτυχθούν θρόμβοι αίματος οποιαδήποτε στιγμή κατά τη διάρκεια της θεραπείας, αλλά ο κίνδυνος αυξάνεται δραματικά με την παρατεταμένη χρήση αυτών των φαρμάκων. Μπορεί επίσης να εμφανιστεί μια μορφή οστικής απώλειας γνωστής ως οστεοπόρωση, που οδηγεί σε μεγαλύτερη πιθανότητα καταγμάτων. Οι αναστολείς οιστρογόνων μπορεί να αυξήσουν τον κίνδυνο ανάπτυξης καρκίνου του μαστού, καρκίνου των ωοθηκών ή άλλων καρκίνων που επηρεάζουν το αναπαραγωγικό σύστημα.
Οι αλλεργικές αντιδράσεις σε αναστολείς οιστρογόνων είναι ασυνήθιστες, αν και είναι πιθανές, ακόμη κι αν τα φάρμακα ήταν καλά ανεκτά στο παρελθόν. Τα ήπια συμπτώματα αλλεργίας μπορεί να περιλαμβάνουν ήπιο δερματικό εξάνθημα ή κνησμό. Ένας δυνητικά απειλητικός για τη ζωή τύπος αλλεργικής αντίδρασης γνωστός ως αναφυλαξία μπορεί να προκαλέσει συμπτώματα όπως πρήξιμο του προσώπου ή του λαιμού, πόνο στο στήθος ή δυσκολία στην αναπνοή. Αυτά τα συμπτώματα πρέπει να αντιμετωπίζονται ως επείγουσα ιατρική κατάσταση και συχνά απαιτείται εισαγωγή στο νοσοκομείο προκειμένου να σταθεροποιηθεί η υγεία του ασθενούς.