Η πιο κοινή αιτία για την απουσία εμμήνου ρύσεως, γνωστή ιατρικά ως αμηνόρροια, είναι η εγκυμοσύνη. Άλλοι σωματικοί λόγοι που μια γυναίκα σε αναπαραγωγική ηλικία μπορεί να χάσει την περίοδό της είναι η ασθένεια, η απώλεια βάρους και η αύξηση βάρους. Τα αντισυλληπτικά που εισάγουν τεχνητές ορμόνες στο σώμα, όπως τα αντισυλληπτικά χάπια, τα έμπλαστρα και τα εμβόλια, μπορεί να προκαλέσουν απουσία εμμήνου ρύσεως. Η ψυχολογική κατάσταση μιας γυναίκας, ειδικά το ακραίο στρες, μπορεί μερικές φορές να εξηγήσει την απουσία εμμήνου ρύσεως.
Η έμμηνος ρύση εμφανίζεται όταν η επένδυση της μήτρας αποβάλλεται κάθε μήνα. Αυτή η επένδυση αναπτύσσεται μετά την ωορρηξία για να λάβει ένα γονιμοποιημένο ωάριο. Όταν συμβεί εγκυμοσύνη, η επένδυση παραμένει στη θέση της και η γυναίκα δεν έχει περίοδο. Εάν μια γυναίκα θηλάζει, μπορεί να έχει απουσία εμμήνου ρύσεως επειδή η επένδυση της μήτρας δεν έχει αποβληθεί. Παρά το γεγονός ότι δεν έχει περίοδο, η γυναίκα μπορεί να έχει ωορρηξία και να μείνει έγκυος ενώ θηλάζει.
Η χρήση ορμονικού ελέγχου των γεννήσεων συχνά προκαλεί απουσία εμμήνου ρύσεως επειδή αυτά τα αντισυλληπτικά έχουν σχεδιαστεί για να καταστέλλουν την ωορρηξία. Όταν το σώμα μιας γυναίκας δεν έχει ωορρηξία, δεν υπάρχει μηνιαία περίοδος επειδή η επένδυση της μήτρας δεν αποβάλλεται. Η γυναίκα συνήθως αρχίζει να έχει ωορρηξία και να έχει ξανά τακτικές περιόδους εντός μερικών μηνών από τη διακοπή της χρήσης ορμονικού ελέγχου των γεννήσεων.
Οι γιατροί ορίζουν δύο τύπους αμηνόρροιας. Εάν ένα κορίτσι δεν έχει ξεκινήσει την περίοδό του μέχρι τα 16, αυτό αναφέρεται ως πρωτοπαθής αμηνόρροια. Όταν μια γυναίκα που είχε περίοδο πριν έχει απουσία εμμήνου ρύσεως για έναν ή περισσότερους μήνες, οι γιατροί αναφέρονται σε αυτή την κατάσταση ως δευτερογενή αμηνόρροια.
Άλλες αιτίες δευτερογενούς αμηνόρροιας περιλαμβάνουν φάρμακα όπως αντικαταθλιπτικά, στεροειδή και χημειοθεραπεία. Οι αθλητές και οι γυναίκες με διατροφικές διαταραχές μπορεί επίσης να είναι επιρρεπείς σε απουσία εμμήνου ρύσεως. Η ωορρηξία συχνά δεν συμβαίνει όταν μια γυναίκα ζυγίζει πολύ λίγο ή έχει ακραίο σωματικό στρες, όπως το σωματικό στρες που υπομένουν οι αθλητές που προπονούνται. Εάν δεν συμβεί ωορρηξία, δεν υπάρχει περίοδος.
Μπορεί επίσης να εμφανιστεί απουσία εμμήνου ρύσεως καθώς μια γυναίκα πλησιάζει στην εμμηνόπαυση. Κατά τη διάρκεια της περιόδου που είναι γνωστή ως περιεμμηνόπαυση, το σώμα μιας γυναίκας μεταβαίνει από τα αναπαραγωγικά του χρόνια στη στιγμή που η ωορρηξία δεν θα εμφανίζεται πλέον. Κατά την περιεμμηνόπαυση, ο εμμηνορροϊκός κύκλος μπορεί να είναι ακανόνιστος και μπορεί να υπάρξουν μήνες στη σειρά που η γυναίκα δεν έχει έμμηνο ρύση.
Στην περίπτωση της πρωτοπαθούς αμηνόρροιας, οι αιτίες μπορεί να περιλαμβάνουν χρωμοσωμικές διαταραχές, υποθαλάμους και υπόφυση. Το κορίτσι μπορεί να έχει γεννηθεί με ανωμαλίες στη μήτρα, στον τράχηλο ή σε άλλα αναπαραγωγικά όργανα που το εμποδίζουν να έχει ωορρηξία ή έμμηνο ρύση. Η ανορεξία, η νόσος του Cushing και η παχυσαρκία μπορεί επίσης να είναι η αιτία της πρωτοπαθούς αμηνόρροιας.