Οι αμοιβές των ταξιδιωτικών πρακτόρων περιλαμβάνουν τις αμοιβές που καταβάλλονται τόσο από τους καταναλωτές όσο και από τους ίδιους τους ταξιδιωτικούς πράκτορες. Πολλοί ταξιδιωτικοί πράκτορες χρεώνουν τέλη στους πελάτες για να αντισταθμίσουν το κόστος κράτησης ταξιδιωτικών προϊόντων που δεν πληρώνουν προμήθεια, καθώς και για το χρόνο και το κόστος της πραγματοποίησης ταξιδιωτικής έρευνας ή της επικοινωνίας με τους πωλητές για να κανονίσουν ειδικά καταλύματα. Εκτός από τις χρεώσεις καταναλωτή, οι ίδιοι οι ταξιδιωτικοί πράκτορες μπορούν να πληρώνουν τέλη με τη μορφή τμηματικών προμηθειών με πρακτορεία υποδοχής, συνδρομές μέλους πρακτορείου υποδοχής ή προμήθειες franchise. Τα πρακτορεία μπορούν επίσης να πληρώνουν τέλη ιδιότητας μέλους και επεξεργασίας πιστωτικών καρτών σε επαγγελματικούς ταξιδιωτικούς οργανισμούς.
Στις περισσότερες περιπτώσεις, ένας ταξιδιωτικός πράκτορας θα κερδίσει το μεγαλύτερο μέρος του εισοδήματός του μέσω προμηθειών που καταβάλλονται από προμηθευτές ταξιδιωτικών υπηρεσιών, όπως ξενοδοχεία και γραμμές κρουαζιέρας. Ορισμένοι ταξιδιωτικοί πωλητές, ωστόσο, δεν πληρώνουν προμήθεια στον ταξιδιωτικό πράκτορα εάν αυτός ή αυτή κάνει κράτηση για το ταξίδι για λογαριασμό του πελάτη του. Δεδομένου ότι αυτό αντιπροσωπεύει μια πιθανή απώλεια για τον πράκτορα, πολλοί χρεώνουν τέλη ταξιδιωτικού πράκτορα στους καταναλωτές για κάθε κράτηση χωρίς εντολή που πρέπει να κάνει ο ταξιδιωτικός πράκτορας. Για παράδειγμα, οι περισσότερες εμπορικές αεροπορικές εταιρείες δεν πληρώνουν πλέον προμήθειες σε ταξιδιωτικούς πράκτορες, έτσι πολλά ταξιδιωτικά γραφεία χρεώνουν τώρα μια μικρή αμοιβή ευγένειας για κάθε κράτηση αεροπορικού εισιτηρίου.
Πολλοί καταναλωτές αναμένεται να πληρώσουν τέλη ταξιδιωτικού πράκτορα όταν κάνουν κράτηση για πολύ περίπλοκες ταξιδιωτικές ρυθμίσεις, ιδιαίτερα εάν οι ρυθμίσεις απαιτούν σημαντική έρευνα από την πλευρά του ταξιδιωτικού πράκτορα. Μερικοί ταξιδιώτες επιλέγουν να επισκεφθούν εξωτικούς προορισμούς ή να προγραμματίσουν μεγάλα ταξίδια σε πολλά διαφορετικά μέρη. Αυτός ο τύπος ταξιδιού μπορεί να απαιτεί τις προσπάθειες ενός επαγγελματία ταξιδιωτικού πράκτορα για τον καθορισμό των απαιτήσεων βίζας, την κράτηση καταλυμάτων ποιότητας και τη διευθέτηση της τοπικής μεταφοράς. Δεδομένου ότι αυτό μπορεί να απαιτήσει αρκετές ώρες εργασίας, ορισμένοι ταξιδιωτικοί πράκτορες θα ζητήσουν από τους καταναλωτές να πληρώσουν τέλη ταξιδιωτικού πράκτορα για να καλύψουν το χρόνο που αφιερώνουν στον προγραμματισμό του ταξιδιού. Επιπλέον, οι πελάτες ενδέχεται επίσης να αναμένεται να καλύψουν τυχόν έξοδα που πραγματοποιήθηκαν από τον ταξιδιωτικό πράκτορα κατά τη διαδικασία έρευνας και κράτησης.
Οι ταξιδιωτικοί πράκτορες και τα ταξιδιωτικά γραφεία ενδέχεται επίσης να υποχρεωθούν να πληρώσουν διάφορα είδη τελών. Οι ανεξάρτητοι ταξιδιωτικοί πράκτορες συνεργάζονται συχνά με ένα πρακτορείο υποδοχής που παρέχει τεχνολογική υποστήριξη, πρόσβαση σε ταξιδιωτικούς πωλητές και κάλυψη ευθυνών σε μεμονωμένους πράκτορες. Οι πράκτορες μπορούν να πληρώσουν μια ποικιλία αμοιβών στην υπηρεσία υποδοχής τους για να καλύψουν το κόστος των υπηρεσιών που λαμβάνουν. Μπορεί επίσης να ζητηθεί από αυτούς τους πράκτορες να μοιράσουν τις προμήθειες τους με το πρακτορείο υποδοχής. Οι ίδιοι οι φορείς μπορούν να επιλέξουν να συμμετάσχουν σε διάφορα προγράμματα επαγγελματικής πιστοποίησης ή να επωφεληθούν από υπηρεσίες επεξεργασίας πιστωτικών καρτών που προσφέρονται από ενώσεις του κλάδου. Και στις δύο περιπτώσεις, η εταιρεία θα καταβάλει έναν ή περισσότερους τύπους αμοιβών στον οργανισμό που παρέχει αυτές τις υπηρεσίες.