Τα περισσότερα κιτ απομόνωσης ριβονουκλεϊκού οξέος (RNA) μπορούν να απομονώσουν RNA υψηλής ποιότητας από ένα ευρύ φάσμα ιστών και τύπων οργανισμών, συμπεριλαμβανομένων φυτών, ζώων και ιών. Το μιτοχονδριακό και το ριβοσωμικό RNA — mRNA και rRNA, αντίστοιχα — μπορεί να απαιτούν εξειδικευμένα κιτ απομόνωσης RNA ειδικά για μικρούς κλώνους RNA. Άλλοι παράγοντες που μπορεί να διαφέρουν μεταξύ των διαφόρων κιτ απομόνωσης είναι η ποσότητα των δειγμάτων που μπορεί να επεξεργαστεί κάθε κιτ και ο χρόνος που χρειάζεται για την πλήρη επεξεργασία ενός δείγματος.
Οι πιο συνηθισμένοι τύποι κιτ απομόνωσης RNA μπορούν να χρησιμοποιηθούν για μια μεγάλη ποικιλία εφαρμογών, ανεξάρτητα από την προέλευση του RNA. Τα κύτταρα και οι ιστοί των θηλαστικών είναι από τις πιο κυρίαρχες πηγές που χρησιμοποιούνται για την απομόνωση και τον καθαρισμό του RNA. Τα φυτικά κύτταρα και οι ιοί χρησιμοποιούνται επίσης σε πειράματα μοριακής βιολογίας που απαιτούν τη χρήση κιτ απομόνωσης RNA.
Μόλις συλλεχθεί το δείγμα ιστού ή αίματος, πρέπει να προετοιμαστεί για απομόνωση RNA κατά τη διάρκεια μιας κρίσιμης διαδικασίας που είναι γνωστή ως κυτταρική αποικοδόμηση, διαχωρισμός ή διάσπαση. Εάν το κυτταρικό υλικό δεν έχει ολοκληρωθεί διαταραχθεί, η διαδικασία απομόνωσης RNA θα παράγει λιγότερο RNA. Τα καλύτερα κιτ απομόνωσης RNA περιλαμβάνουν υλικά και προμήθειες για κυτταρική αποικοδόμηση πριν από την απομόνωση και καθαρισμό RNA μετά την απομόνωση.
Σε ειδικές περιπτώσεις όπου ένα πείραμα απαιτεί mRNA ή rRNA, διατίθενται εξειδικευμένα κιτ απομόνωσης RNA για κλώνους RNA που είναι ιδιαίτερα μικρές. Τα υλικά και οι προμήθειες που περιλαμβάνονται σε ένα τέτοιο κιτ μπορεί να διαφέρουν ως προς την ποσότητα και το μέγεθος. Αυτά τα κιτ απομόνωσης RNA είναι λιγότερο κοινά από τα κιτ RNA πολλαπλών χρήσεων και μπορεί να υπάρχει σημαντική διαφορά κόστους.
Πολλά κοινά κιτ απομόνωσης RNA είναι σχεδιασμένα για χρήση με όλους τους τύπους ιστών και κυττάρων και μπορούν να ολοκληρώσουν μια αντίδραση μέσα σε περίπου 20 λεπτά. Ο χρόνος που χρειάζεται για την πλήρη κυτταρική αποικοδόμηση μπορεί να ποικίλλει ανάλογα με το πού στον οργανισμό συλλέχθηκαν τα κύτταρα. Πέρα από το στάδιο της κυτταρικής αποικοδόμησης, η διαδικασία απομόνωσης RNA και ο επακόλουθος καθαρισμός είναι σχετικά τυπικές όσον αφορά τη διαδικασία και το χρόνο.
Ένα άλλο χαρακτηριστικό που μπορεί να είναι συγκεκριμένο για ορισμένα κιτ είναι η ποσότητα του δείγματος που απαιτείται για την επεξεργασία της αντίδρασης. Ενώ ορισμένα κιτ απομόνωσης μπορεί να απαιτούν σχετικά μεγάλο όγκο δείγματος, άλλα κιτ μπορεί να λειτουργούν καλά με μικρότερο όγκο. Αυτή η διαφορά μπορεί να είναι πλεονέκτημα εάν ο όγκος του δείγματος είναι περιοριστικός παράγοντας.
Αρκετοί κατασκευαστές κιτ απομόνωσης RNA διαθέτουν γραφήματα σύγκρισης διαθέσιμα στο Διαδίκτυο. Αυτά τα γραφήματα μπορούν να χρησιμοποιηθούν για να δείτε τις διαφορές μεταξύ των διαφόρων κιτ που παράγουν. Οι διαφορές μπορεί να περιλαμβάνουν εξειδικευμένους τύπους εφαρμογών, χημικές ουσίες και απαιτούμενους όγκους δειγμάτων.