Οι κυβερνητικοί νόμοι και κανονισμοί είναι οι κύριες πηγές προστασίας των υγροτόπων. Αυτά περιλαμβάνουν τα πάντα, από τον Αμερικανικό νόμο για το καθαρό νερό έως τα προγράμματα που αγοράζουν υγρότοπους από ιδιώτες έως την εκπαίδευση του κοινού. Πριν από τη θέσπιση αυτών των τύπων περιβαλλοντικών νόμων, πολλοί υγρότοποι καταστράφηκαν, ενώ ακόμη περισσότεροι κινδύνευσαν. Οι κανονισμοί που έχουν σχεδιαστεί για την προστασία των υγροτόπων συνήθως προέρχονται από ομοσπονδιακές, πολιτειακές και τοπικές δικαιοδοσίες και τα διοικητικά τους όργανα.
Ένα από τα πιο σαρωτικά προγράμματα που βοηθούν στην προστασία των υγροτόπων προήλθε από τη θέσπιση της νομοθεσίας για τα καθαρά νερά από την αμερικανική κυβέρνηση. Συνολικά, αυτή η νομοθεσία έχει σχεδιαστεί για να προστατεύει όλα τα υδάτινα σώματα στις ΗΠΑ, αλλά περιέχει επίσης αποφάσεις που ισχύουν ειδικά για τους υγρότοπους. Μία από τις πιο σημαντικές πτυχές του νόμου για το καθαρό νερό, όπως αφορά τους υγροβιότοπους, είναι οι κανονισμοί που διασφαλίζουν ότι οι παραπόταμοι που εκκενώνονται σε αυτές τις περιοχές πρέπει να εξετάζονται με βάση τον αντίκτυπο που θα μπορούσαν να έχουν στα υδάτινα υδάτινα υδάτια. Σε ορισμένες περιπτώσεις, αποδεκτά επίπεδα ρύπανσης για έναν κολπίσκο ή ρέμα στο σημείο προέλευσής τους θα μπορούσαν τελικά να είναι καταστροφικά για ένα οικοσύστημα υγροτόπων. Αυτός ο τύπος νομοθεσίας για “μεγάλη εικόνα” βοηθά στην προστασία των ελών και των υγροτόπων από την εισερχόμενη ρύπανση.
Ένας άλλος τύπος προστασίας των υγροτόπων που χρηματοδοτείται από την κυβέρνηση προέρχεται από κίνητρα που προσφέρονται στους ιδιοκτήτες γης είτε να δωρίσουν είτε να πουλήσουν τους υγροτόπους τους σε κυβερνήσεις ή σε ιδιωτικά περιβαλλοντικά προγράμματα. Μόλις αποτελούν μέρος αυτών των προγραμμάτων, η χρήση και τα οικοσυστήματα των υγροτόπων μπορούν να παρακολουθούνται στενότερα. Εκτός από οποιοδήποτε χρηματικό κέρδος από την απευθείας πώληση ενός υγροτόπου σε μια προστατευτική υπηρεσία, στους ιδιοκτήτες γης προσφέρονται συχνά ελκυστικές φορολογικές εκπτώσεις. Ένας άλλος τύπος κινήτρου περιλαμβάνει τον ορισμό ενός ιδιώτη ιδιοκτήτη υγροτόπων ως κυβερνητικού διαχειριστή της δικής του περιουσίας. Συνεργαζόμενος με κυβερνητικούς φορείς για τη διασφάλιση της προστασίας των υγροτόπων του, ο ιδιοκτήτης γης μπορεί να είναι επιλέξιμος για κρατικές επιχορηγήσεις για την προστασία και την ενίσχυση της περιουσίας, διατηρώντας παράλληλα την ιδιοκτησία.
Σε πολλές περιπτώσεις, οι υγρότοποι που πωλούνται σε κρατικούς ή ιδιωτικούς περιβαλλοντικούς οργανισμούς γίνονται προστατευόμενες περιοχές. Μπορεί να γίνουν μέρος ενός ομοσπονδιακού ή κρατικού συστήματος πάρκων, ενός καταφυγίου άγριας ζωής ή μιας περιοχής ερημιάς. Τα οικοσυστήματα αυτών των προστατευόμενων υγροτόπων συνήθως παρακολουθούνται προσεκτικά και η χρήση τους είναι συνήθως περιορισμένη.
Εκτός από τα ομοσπονδιακά προγράμματα και τη νομοθεσία, ορισμένες πολιτείες και τοπικές δικαιοδοσίες έχουν νόμους και κανονισμούς που έχουν σχεδιαστεί για την τοπική προστασία των υγροτόπων. Είναι συχνότερα σε παράκτιες περιοχές όπου οι υγρότοποι είναι άφθονοι. Αυτός ο τύπος προστασίας υγροτόπων συχνά σχεδιάζεται για την προστασία υγροβιότοπων που μπορεί να έχουν ανησυχίες συγκεκριμένες για τη γεωγραφική περιοχή τους και που μπορεί να μην καλύπτονται από ευρύτερους ομοσπονδιακούς κανονισμούς.
Η εκπαίδευση τόσο του κοινού όσο και του προσωπικού επιβολής είναι ένας άλλος τρόπος με τον οποίο πολλές κυβερνήσεις προσπαθούν να επιτύχουν την προστασία των υγροτόπων. Αυτό μερικές φορές περιλαμβάνει προγράμματα κοινοτικής προσέγγισης και εκπαιδευτικούς πόρους για εκπαιδευτικούς και άλλους εκπαιδευτικούς. Ως επί το πλείστον, αυτά τα προγράμματα έχουν σχεδιαστεί για να βοηθήσουν τα μέλη της κοινότητας να κατανοήσουν το ρόλο των υγροτόπων και τη σημασία της διατήρησης των οικοσυστημάτων τους.