Υπάρχουν πολλά είδη βακτηρίων που βρίσκονται στο πεπτικό σύστημα ενός ατόμου. Μερικά είναι πεπτικά βακτήρια που βοηθούν στη διαδικασία της πέψης και βοηθούν στη διασφάλιση της καλής υγείας. Άλλοι τύποι βακτηρίων μπορεί να εγκατασταθούν στην πεπτική οδό και να προκαλέσουν προβλήματα υγείας. Μεταξύ των τύπων βακτηρίων που βρίσκονται στην πεπτική οδό είναι ο Lactobacillus, το Bifidobacterium και το Escherichia.
Ο Lactobacillus acidophilus είναι ένας τύπος βακτηρίων που ζει στο λεπτό έντερο ενός ατόμου. Θεωρείται ωφέλιμος τύπος βακτηρίων για μερικούς λόγους. Αυτό το βακτήριο συνθέτει τη βιταμίνη Κ και έχει την ικανότητα να μεταβολίζει τη λακτόζη, η οποία είναι ένα είδος ζάχαρης που βρίσκεται στα γαλακτοκομικά προϊόντα. Παράγει επίσης ουσίες που εμποδίζουν τα επιβλαβή βακτήρια να αναπτυχθούν και να πολλαπλασιαστούν στον πεπτικό σωλήνα. Εάν ένα άτομο δεν έχει αρκετά από αυτά τα βακτήρια στο πεπτικό του σύστημα, η πέψη μπορεί να επηρεαστεί.
Συχνά, οι άνθρωποι εστιάζουν στην ικανότητα του Lactobacillus acidophilus να επηρεάζει την ανάπτυξη επιβλαβών βακτηρίων. Αυτό το πεπτικό βακτήριο βοηθά επίσης το σώμα στην παραγωγή της ομάδας Β των βιταμινών. Τα βακτήρια λέγεται επίσης ότι βοηθούν στη διατήρηση της χοληστερόλης σε φυσιολογικά επίπεδα.
Το Bifidobacterium είναι ένας άλλος τύπος φιλικών βακτηρίων που βρίσκεται στο πεπτικό σύστημα ενός ατόμου. Ζει στο παχύ έντερο ενός ατόμου και παίζει σημαντικό ρόλο στην προστασία του οργανισμού από ορισμένους τύπους ζύμης, καθώς και από βακτήρια που είναι επιβλαβή παρά χρήσιμα. Αυτό το βακτήριο μπορεί να παρέμβει με βακτήρια που φλεγμονώνουν τα έντερα και προκαλούν στο προσβεβλημένο άτομο διάρροια. Λειτουργεί παρεμποδίζοντας την ικανότητα των βακτηρίων να αναπτυχθούν. Μπορεί επίσης να βοηθήσει το σώμα να παράγει βιταμίνη Β.
Ο Streptococcus thermophilus είναι ένα πεπτικό βακτήριο που βοηθά το σώμα να παράγει ένζυμα λακτόζης. Αυτά τα ένζυμα είναι σημαντικά για την πέψη των γαλακτοκομικών προϊόντων. Αυτό το βακτήριο βοηθά επίσης να διατηρείται προστατευμένη η γαστρεντερική επένδυση του ατόμου όταν το γάλα και τα γαλακτοκομικά προϊόντα περνούν από τη διαδικασία της πέψης. Μάλιστα, αυτό το βακτήριο λέγεται ότι βοηθά τους ανθρώπους να αποφύγουν τα δυσάρεστα συμπτώματα της δυσανεξίας στη λακτόζη.
Πολλοί άνθρωποι έχουν ακούσει για το Escherichia coli, το οποίο συνήθως συντομεύεται ως E. coli. Αυτός ο τύπος βακτηρίων είναι συχνά ο ένοχος όταν κάποιος αναπτύσσει μια πεπτική ασθένεια, όπως αυτές που προκαλούν εμετό και διάρροια. Το Escherichia coli είναι μια ολόκληρη ομάδα βακτηρίων, ωστόσο, και μερικά από αυτά είναι φιλικά. Ορισμένα στελέχη αυτού του πεπτικού βακτηρίου βοηθούν το σώμα να αφομοιώσει τις φυτικές τροφές. Μερικοί βοηθούν επίσης το σώμα να παράγει βιταμίνη Κ.