Μια πιθανή έλλειψη διαφάνειας αποτελεί κίνδυνο για τα χρηματοπιστωτικά ιδρύματα. Μεγάλο μέρος των παγκόσμιων κεφαλαιαγορών σε κάποιο σημείο κινείται μέσω του καναλιού των χρηματοπιστωτικών ιδρυμάτων, συμπεριλαμβανομένων των επενδυτικών τραπεζών και των εταιρειών διαχείρισης χρημάτων, όπως τα αμοιβαία κεφάλαια κινδύνου και τα αμοιβαία κεφάλαια. Η μεγαλύτερη ρύθμιση σε ορισμένους θύλακες χρηματοπιστωτικών υπηρεσιών μειώνει το επίπεδο κινδύνου στον οποίο εκτίθενται οι τράπεζες και οι αγορές. Εάν μια τράπεζα είναι τόσο μεγάλη και έχει τόση επιρροή που η κατάρρευσή της θα είχε κυματιστικές επιπτώσεις στην οικονομία, ο κίνδυνος στα χρηματοπιστωτικά ιδρύματα αυτού του είδους είναι μεγάλος. Η πιθανή ανταλλαγή ευαίσθητων πληροφοριών με ακατάλληλο τρόπο είναι ένας άλλος παράγοντας κινδύνου που περιβάλλει τις χρηματοπιστωτικές εταιρείες.
Τα χρηματοπιστωτικά ιδρύματα δημιουργούν πολλά από τα εξελιγμένα μέσα που αγοράζονται και πωλούνται στις αγορές κάθε μέρα. Τίτλοι, όπως τα πιστωτικά παράγωγα, διαπραγματεύονται συχνά σε μια προσπάθεια να προστατευθούν άλλα ανοίγματα και να κερδίσουν χρήματα για την ίδια την τράπεζα εκτός από τους πελάτες. Δεδομένου ότι μια τράπεζα μπορεί να επενδύσει χρήματα από τον ισολογισμό της για να αυξήσει τα κέρδη που παράγονται στην επιχείρηση, ο κίνδυνος στα χρηματοπιστωτικά ιδρύματα γίνεται μεγαλύτερος λόγω της πιθανότητας κακών συναλλαγών ή απροσδόκητων ζημιών. Αυτές οι ελλείψεις μπορεί να προκαλέσουν μείωση των εσόδων, κάτι που γίνεται εμφανές σε έναν ισολογισμό – μια αντανάκλαση της οικονομικής υγείας ενός ιδρύματος.
Ένας άλλος κίνδυνος στα χρηματοπιστωτικά ιδρύματα περιβάλλει τη δυνατότητα επικάλυψης εντός μιας επιχείρησης. Ιδίως ορισμένες τράπεζες είναι τόσο μεγάλες που πραγματοποιούνται διάφορες λειτουργίες, που κυμαίνονται από χρηματοοικονομική ανάλυση έως δραστηριότητα επενδυτικής τραπεζικής. Οι γραμμές δεοντολογίας θα μπορούσαν εύκολα να γίνουν ασαφείς όταν μια εταιρεία πρόκειται να επωφεληθεί από έναν πελάτη με βάση τον τρόπο που οι δημόσιοι επενδυτές αντιμετωπίζουν μια μετοχή, για παράδειγμα. Οι κανονιστικές πρακτικές και οι βιομηχανικές πρακτικές, όπως ένα κινεζικό τείχος, έχουν εξελιχθεί για να προκαλέσουν διαχωρισμό μεταξύ αυτών των ρόλων, έτσι ώστε να υπάρχει μικρότερη τάση ή πιθανότητα εμφάνισης οποιωνδήποτε ανάρμοστων.
Υπάρχουν τρόποι για τα χρηματοπιστωτικά ιδρύματα να μετριάσουν τον κίνδυνο για την επιχείρηση και την ευρύτερη οικονομία. Για παράδειγμα, ορισμένα χρηματοπιστωτικά ιδρύματα είναι τόσο μεγάλα και εκτελούν τόσο μεγάλο όγκο χρηματοοικονομικών συναλλαγών που οποιαδήποτε χρεοκοπία ή άλλη αποτυχία θα μπορούσε να θέσει συστημικό κίνδυνο για την οικονομία. Η περιφερειακή ρύθμιση που απαιτεί διαφάνεια στους τύπους συναλλαγών που εκτελούν οι τράπεζες και άλλες χρηματοπιστωτικές εταιρείες και στις στρατηγικές που χρησιμοποιούνται προάγει μικρότερο βαθμό κινδύνου. Επίσης, όσο περισσότερο επικοινωνούν και συντονίζουν τους στόχους κορυφαία στελέχη, όπως ο οικονομικός διευθυντής, και επαγγελματίες κινδύνου, όπως ο επικεφαλής συμμόρφωσης, τόσο πιο πιθανό είναι να μειωθεί ο κίνδυνος στα χρηματοπιστωτικά ιδρύματα.